| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 937,168 | G→A | 10.4% | intergenic (+75/‑56) | USA300HOU_RS04665 → / → pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 937,168 | 0 | G | A | 10.4% | 720.0 / 47.1 | 245 | intergenic (+75/‑56) | USA300HOU_RS04665/pepA_1 | NADH dehydrogenase‑like protein/Cytosol aminopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (115/103); new base A (23/3); total (138/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.52e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
AAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTAAGCAACGA > USA300TCH1516_ALE/937078‑937258 | aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc < 2:3957015/91‑1 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc < 2:3033572/91‑1 (MQ=255) aaaGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGc > 1:2186674/1‑91 (MQ=255) ggTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCttt > 2:1064816/1‑91 (MQ=255) ggTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCttt > 1:2119079/1‑91 (MQ=255) ggTAAATTCTAGGCATTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTCCAGTGACACTGAAGGACttt > 2:1175530/1‑91 (MQ=39) gTAAAGTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAGAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTa < 2:2643814/91‑1 (MQ=255) ttCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgtt < 2:1869609/91‑1 (MQ=255) ttCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgtt < 1:1677493/91‑1 (MQ=255) tCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTAttgttg < 2:1033758/91‑1 (MQ=255) tAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAGCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCGCTGAAGGGCTTTATTGTTGTa < 2:1044917/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATATAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTAc < 2:3632641/91‑1 (MQ=255) aGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTAc < 2:1638898/91‑1 (MQ=255) ggCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACa > 1:413625/1‑91 (MQ=255) ggCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACa < 1:1537495/91‑1 (MQ=255) ggCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACa < 1:1730218/91‑1 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt > 1:1737014/1‑91 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt < 2:1490072/91‑1 (MQ=255) cTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAt > 1:1154746/1‑91 (MQ=255) tttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAtt < 1:1196371/91‑1 (MQ=255) tttAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAAtt > 1:2901081/1‑91 (MQ=255) aaataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCCTTTCTAAAGTCCTTCAGTGTCACTGACGGGCTCTATTGTTGTACAATTTGa > 1:1229529/1‑91 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa > 1:2097395/1‑91 (MQ=255) aataaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGaa < 2:2794875/91‑1 (MQ=255) taaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGt < 1:2296246/91‑1 (MQ=255) aaaGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTg < 2:269203/91‑1 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg < 1:1091313/91‑1 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg > 2:3921189/1‑91 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAg > 1:2558156/1‑91 (MQ=255) aGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATACATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTAATTGTTGTACAGTTTGAAGTGAg > 2:3024596/1‑91 (MQ=255) ttCAGCTAAACCCATAAAATTAAATGATGCATTTATAGAGTCCGTCAGTGTCACTGAAGGGCGTTATTGTTGTACAGTTTGAAGTGAGTaa < 2:179115/91‑1 (MQ=255) ttCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTTTTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTaa > 2:1722832/1‑91 (MQ=255) tCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGATGTGAGTAAc > 1:3545041/1‑91 (MQ=255) cAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACa > 1:2685649/1‑91 (MQ=255) aGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACat < 1:1361866/91‑1 (MQ=255) gCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACata > 1:2155079/1‑91 (MQ=255) gCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACata < 1:2473776/91‑1 (MQ=255) tAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATc < 2:2784800/91‑1 (MQ=255) aaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTCACATATCaa > 1:3788938/1‑91 (MQ=255) aaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaa > 1:3451289/1‑91 (MQ=255) aaCACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaa < 2:151126/91‑1 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa > 2:503436/1‑91 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa < 1:2263980/91‑1 (MQ=255) acacATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCaaa < 2:297277/91‑1 (MQ=255) cacgTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGCAACATATCAAAt < 1:3056110/91‑1 (MQ=255) cacaTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAAt > 1:838738/1‑91 (MQ=255) caTAAAATTGAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCt < 1:3790028/91‑1 (MQ=255) caTAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCt < 1:1139211/91‑1 (MQ=255) tAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTaa > 2:245619/1‑91 (MQ=255) aaaaTTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAag < 2:1307330/91‑1 (MQ=255) aaattaaattATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAagg > 1:3864574/1‑91 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAaggag < 1:3926914/91‑1 (MQ=255) attaaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATAGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAaggag < 1:3419759/91‑1 (MQ=255) taaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGt > 2:3764023/1‑91 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGCGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa > 2:1841221/1‑91 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa < 1:1856815/91‑1 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa > 1:1326830/1‑91 (MQ=255) aaattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTa < 1:3041173/91‑1 (MQ=255) aattaTTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTAc > 1:505831/1‑91 (MQ=255) attattCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACa > 1:841006/1‑91 (MQ=255) attattCATTTATAAAGTCCTAAAGTGCCACTGAAGGGTTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATGAAATCTAGGGAGGAAcg > 2:3524273/1‑90 (MQ=255) ttattCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACAt > 2:566438/1‑91 (MQ=255) attCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTa > 1:2823086/1‑91 (MQ=255) ttCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGATACATTAt < 2:330033/91‑1 (MQ=255) cATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGa < 2:238878/91‑1 (MQ=255) cATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGa < 1:1258590/91‑1 (MQ=255) aTTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGaa < 2:1195544/91‑1 (MQ=255) ttATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGCAGTGAGTAACATATCAACTCTAAGGAGGTACATCATGAAtt > 2:3487160/1‑91 (MQ=255) ttATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAtt < 1:3317091/91‑1 (MQ=255) tataAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAAttt < 1:1571243/91‑1 (MQ=255) taAAGCCCTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTtta > 1:142448/1‑91 (MQ=38) aaGTCCTTTATTTTCACTTAAGGTCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCACATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaa < 2:3435252/91‑1 (MQ=255) agcccTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaat > 1:1891829/4‑91 (MQ=38) aGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaat < 1:2398576/91‑1 (MQ=255) gTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatt < 1:403989/91‑1 (MQ=255) tCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatta > 2:1955424/1‑91 (MQ=255) tCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACACATCAAATCTCAGGAGGTACATTATGAATTttaaatta > 2:1390596/1‑91 (MQ=255) cccTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaatta > 2:2485417/2‑91 (MQ=255) ccTTCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTttaaattaa > 2:1926323/1‑91 (MQ=255) tCAGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATa > 2:2184249/1‑91 (MQ=255) cAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATaa > 2:739819/1‑91 (MQ=255) cAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATaa < 2:23255/91‑1 (MQ=255) aGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 2:2206666/1‑91 (MQ=255) aGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 1:2448692/1‑91 (MQ=255) aGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 1:264808/1‑91 (MQ=255) aGTGACACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 1:621578/1‑91 (MQ=255) aGTGACACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAac > 1:1133678/1‑91 (MQ=255) tgacACTGAAGGACTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAacac > 2:1260766/4‑91 (MQ=255) gtCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATGAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAacaca < 2:3056926/91‑1 (MQ=255) acACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGCGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAacacac > 1:3234605/2‑91 (MQ=255) cACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCANATCTCAGGAGGTACATTATNAATTTTAAATTAAATAACACACt > 2:1485034/1‑91 (MQ=255) cACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACt > 2:461115/1‑91 (MQ=255) aCTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTa < 1:3351962/91‑1 (MQ=255) aCTGAAGGACTTTACTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTa > 2:3354234/1‑91 (MQ=255) aGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTAAGCaa < 2:2951292/91‑1 (MQ=255) gggCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTAAGCAAc < 1:3576760/91‑1 (MQ=255) gggCTTTATTGGTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTAAGCAAc < 1:3590868/91‑1 (MQ=255) ggCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTAAGCAACg > 1:3727269/1‑91 (MQ=255) ggCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTAAGCAACg < 1:1920898/91‑1 (MQ=255) gCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGCGGTACATTATGAATTTTACATTAAATAACGCACTAAGCAACGa > 1:3952365/1‑91 (MQ=255) | AAAAGGTAAATTCTAGGCTTTAAATAAAGTTTCAGCTAAACACATAAAATTAAATTATTCATTTATAAAGTCCTTCAGTGTCACTGAAGGGCTTTATTGTTGTACAATTTGAAGTGAGTAACATATCAAATCTAAGGAGGTACATTATGAATTTTAAATTAAATAACACACTAAGCAACGA > USA300TCH1516_ALE/937078‑937258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |