| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 24,137 | G→A | 7.2% | intergenic (+389/‑41) | purA → / → USA300TCH1516_00018 | Adenylosuccinate synthetase/tRNA‑Glu |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 24,137 | 0 | G | A | 7.2% | 711.2 / 27.1 | 224 | intergenic (+389/‑41) | purA/USA300TCH1516_00018 | Adenylosuccinate synthetase/tRNA‑Glu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (83/124); new base A (11/6); total (94/130) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
AATGAATAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAC > USA300TCH1516_ALE/24047‑24226 | aaTGAATAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATgg < 2:900854/91‑1 (MQ=255)aaTGAATAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATgg < 1:2495194/91‑1 (MQ=255) tGAATAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCa < 2:1199975/91‑1 (MQ=255) tGAATAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCGTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGCCATGACa < 2:583839/91‑1 (MQ=255) gAATAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCaa < 2:2268105/91‑1 (MQ=255) aTAGCCTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGCCATGACAAGa < 1:3296287/91‑1 (MQ=255) aTAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAACATATCTTGTCATGGCAAGa > 2:2439886/1‑91 (MQ=255) aTAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGa < 2:3153218/91‑1 (MQ=255) aTAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGa < 1:498261/91‑1 (MQ=255) aTAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGa < 1:2580650/91‑1 (MQ=255) aTAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGCCATGACAAGa < 2:3800627/91‑1 (MQ=255) aTAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGCCATGACAAGa < 2:2740143/91‑1 (MQ=255) tAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGAt < 2:1609496/91‑1 (MQ=255) tAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGAt < 1:641656/91‑1 (MQ=255) aGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGAtt > 2:1232139/1‑91 (MQ=255) gACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTATTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTg < 2:1915330/91‑1 (MQ=255) tGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCt > 2:296868/1‑91 (MQ=255) gCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCtg > 2:3221185/1‑91 (MQ=255) cAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCtgtg < 2:3262486/91‑1 (MQ=255) cAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCtgtg < 2:748220/91‑1 (MQ=255) cAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCtgtg < 2:2820386/91‑1 (MQ=255) aaTATAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTATGc > 1:3117981/1‑91 (MQ=255) aaTAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGc < 1:2385099/91‑1 (MQ=255) aaTAAAATGCAATTTATCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAAAAAAAAAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGc < 2:1287770/91‑1 (MQ=255) aTAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCt < 1:892312/91‑1 (MQ=255) tAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCta < 1:2338603/91‑1 (MQ=255) aaaaTGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCtat > 2:2782699/1‑91 (MQ=255) aaaaTGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCtat > 1:296797/1‑91 (MQ=255) aaaTGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCtata < 1:3069316/91‑1 (MQ=255) aTGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAat > 1:1277475/1‑91 (MQ=255) tGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatc > 1:839166/1‑91 (MQ=255) tGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatc < 1:2174978/91‑1 (MQ=255) tGCAATTTTTCACTTATAACATTATTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatc < 2:1553242/91‑1 (MQ=255) gCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatct < 2:1064867/91‑1 (MQ=255) gCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatct < 1:1137322/91‑1 (MQ=255) gCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatct < 1:1758632/91‑1 (MQ=255) agttttCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatctatc < 2:1022255/89‑1 (MQ=255) aTTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatctatc < 2:2920857/91‑1 (MQ=255) aTTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatctatc > 2:1501091/1‑91 (MQ=255) tttttCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAatctatct < 2:1742550/91‑1 (MQ=255) ttttCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCtt < 2:220157/91‑1 (MQ=255) tttCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTtg > 1:3703333/1‑91 (MQ=255) tCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTtgtg < 1:1065962/91‑1 (MQ=255) tCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTtgtg > 1:1634093/1‑91 (MQ=255) cACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGc < 2:2867802/91‑1 (MQ=255) aCTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCt < 2:3257913/91‑1 (MQ=255) ataACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAg < 1:2860057/91‑1 (MQ=255) ataACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAg < 1:2858831/91‑1 (MQ=255) taACATTCTTCAAAAAATAATAGCAACATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGa > 1:2365237/1‑91 (MQ=255) taACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGa < 2:1356053/91‑1 (MQ=255) taACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGa < 1:1745378/91‑1 (MQ=255) taACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGa < 2:247061/91‑1 (MQ=255) aaCATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGaa > 2:676536/1‑91 (MQ=255) aCATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAAc < 1:547269/91‑1 (MQ=255) aCATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAAc < 1:327890/91‑1 (MQ=255) tcttcAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCt > 2:1664278/1‑91 (MQ=255) cttcAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTc < 1:2084727/91‑1 (MQ=255) cttcAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTc < 2:609418/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTg > 1:3891283/1‑91 (MQ=255) aaaaaTAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTgg < 2:1714704/91‑1 (MQ=255) aataatAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCa < 1:1542195/91‑1 (MQ=255) cAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTa < 2:1614410/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTaa < 2:3504400/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTaa < 2:2584534/91‑1 (MQ=255) aaaaTTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTaa > 1:741765/1‑91 (MQ=255) aaaTTATGTAAAGAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAg > 1:3031387/1‑91 (MQ=255) tATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGacac > 1:3642074/1‑91 (MQ=255) aTGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACAcc < 1:3775404/91‑1 (MQ=255) gTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGc > 2:272405/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGccc > 1:1666227/1‑91 (MQ=255) aaagaTATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCt < 1:1328672/91‑1 (MQ=255) aaaaaTATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCt < 1:80882/91‑1 (MQ=255) aaaTATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGccgtga < 1:1090086/91‑5 (MQ=255) aaaTATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGccgtga < 1:2483551/91‑5 (MQ=255) atatCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTAGAATCGAGCTGGTGCTTAAGAACGGCTCCTGGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCa < 2:3850643/91‑1 (MQ=37) atCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcg < 1:1367544/91‑1 (MQ=255) atCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcg < 2:3568434/91‑1 (MQ=255) tCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCCAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcgg > 1:385168/1‑91 (MQ=255) tCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcgg < 2:3621035/91‑1 (MQ=255) tCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcgg > 1:854875/1‑91 (MQ=255) tCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcgg < 1:1809672/91‑1 (MQ=255) tCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcgg < 1:714292/91‑1 (MQ=255) cTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggc < 1:310170/91‑1 (MQ=255) cTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggc > 1:1012326/1‑91 (MQ=255) cTTGCCATGACAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggc > 2:204216/1‑91 (MQ=255) ttgccATGACAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggcg > 1:1111256/5‑91 (MQ=255) ttGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggcg > 1:394899/1‑91 (MQ=255) ttGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGATTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGGTAAGACACCGCCCTTTCAcggcg > 2:3680857/1‑91 (MQ=255) tgccATGACAAGATTGGCTGTGCTATCATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCACCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggcgg > 2:3142773/4‑91 (MQ=25) tgccATGACAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGGCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggcgg > 1:3378876/4‑91 (MQ=37) tGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCAcggcgg < 1:1803649/91‑1 (MQ=255) gccATGACAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGt > 2:1090484/3‑91 (MQ=255) gTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGt < 2:3063427/91‑1 (MQ=255) gTCATGGCAAGATTGGCTGTGCGATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCTCCTTCCcggcggg > 2:3148189/1‑90 (MQ=37) ccATGACAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTa > 2:319493/2‑91 (MQ=255) ccATGACAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCATTCACGGCGGTa > 1:2020289/2‑91 (MQ=255) cATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTaa < 1:366577/91‑1 (MQ=255) tGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaca < 2:648466/91‑1 (MQ=255) tGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaca > 1:1409346/1‑91 (MQ=255) ggCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAacac < 1:1030809/91‑1 (MQ=255) | AATGAATAGACTGCCAATAAAATGCAATTTTTCACTTATAACATTCTTCAAAAAATAATAGCAAAATTATGTAAAAAATATCTTGTCATGGCAAGATTGGCTGTGCTATAATCTATCTTGTGCTTAAGAACGGCTCCTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAC > USA300TCH1516_ALE/24047‑24226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |