| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,076,529 | G→C | 7.9% | M190I (ATG→ATC) | purQ → | Phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,076,529 | 0 | G | C | 7.9% | 669.9 / 41.2 | 202 | M190I (ATG→ATC) | purQ | Phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (93/93); new base C (3/13); total (96/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.35e-01 | |||||||||||
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAA > USA300TCH1516_ALE/1076439‑1076619 | tCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCatg < 1:2977928/91‑1 (MQ=255) cAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTGATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCatga > 1:3350935/1‑91 (MQ=255) cAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCatga > 1:1924296/1‑91 (MQ=255) aaTTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCatgatg > 2:1450558/1‑91 (MQ=255) aaTTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGAAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCatcatg < 2:2351312/91‑1 (MQ=255) attattCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGc > 1:1793427/1‑91 (MQ=255) tattCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATCATGCca < 1:2138472/91‑1 (MQ=255) tattCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATCATGCca < 1:600631/91‑1 (MQ=255) tattCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATCATGCca < 2:2098908/91‑1 (MQ=255) tattCTGAAATATGTGAAAAAACCGAACGAAAAATATGATTATATTACAAGAAATGATAAAGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATCATGCca < 2:1836574/91‑1 (MQ=255) attCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCcac > 1:3207259/1‑91 (MQ=255) attCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCcac < 1:2174590/91‑1 (MQ=255) ttCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCACATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATCTGGCATGATGCcaca < 1:3367401/91‑1 (MQ=255) ttCTGAAATATGGGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCcaca < 2:3613154/91‑1 (MQ=255) tCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACAt < 2:401913/91‑1 (MQ=255) tCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACAt > 2:1701494/1‑91 (MQ=255) cTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATc > 1:3800509/1‑91 (MQ=255) tGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATcc > 2:3440168/1‑91 (MQ=255) tGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATcc < 1:1173012/91‑1 (MQ=255) gAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCt > 1:1074195/1‑91 (MQ=255) gAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCt > 1:1825247/1‑91 (MQ=255) aaaTATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTg < 1:3228694/91‑1 (MQ=255) aaaTATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTg < 1:3827692/91‑1 (MQ=255) atatGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATGGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGaa < 2:463075/91‑1 (MQ=255) tatGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGaaa < 2:874573/91‑1 (MQ=255) tgtgAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAaga < 1:1385425/91‑1 (MQ=255) gtgAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAagag > 2:1115461/1‑91 (MQ=255) tgAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGc < 1:2268089/91‑1 (MQ=255) tgAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGc > 2:1036704/1‑91 (MQ=255) gAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCt > 2:212223/1‑91 (MQ=255) ataatCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCttt > 2:3150337/1‑91 (MQ=255) atCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGa < 1:249932/91‑1 (MQ=255) tCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGaa < 1:3734605/91‑1 (MQ=255) ccGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGaaa < 2:602049/91‑1 (MQ=255) cGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAAc < 1:2201914/91‑1 (MQ=255) gAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACg > 2:2920020/1‑91 (MQ=255) aaCGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgt < 1:1685186/91‑1 (MQ=255) aaCGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgt > 1:1268358/1‑91 (MQ=255) aCGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgtt < 1:1192721/91‑1 (MQ=255) cGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgttg > 1:1989417/1‑91 (MQ=255) cGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgttg < 1:2056387/91‑1 (MQ=255) ggTTCATGTGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGAGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgttga > 2:3919816/1‑90 (MQ=255) ggTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgttgt > 1:691140/1‑91 (MQ=255) gTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACgttgtt > 1:2343006/1‑91 (MQ=255) ttCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTa < 1:301269/91‑1 (MQ=255) ttCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTa < 1:1561430/91‑1 (MQ=255) ttCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTa > 2:1399440/1‑91 (MQ=255) cATATGGTGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAgg < 1:3321125/91‑1 (MQ=255) cATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAgg < 1:3494303/91‑1 (MQ=255) cATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAgg > 2:90640/1‑91 (MQ=255) tatGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGATGTTAGGTa > 1:3776887/1‑91 (MQ=255) tgatgaTATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAACGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAATCGTTGTTAGGTACt > 1:3566355/1‑91 (MQ=255) atgatATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTgc > 2:2015867/1‑90 (MQ=255) tgatATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGAt < 1:1176728/91‑1 (MQ=255) atatTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCAGGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAg < 1:2472347/91‑1 (MQ=255) ttGCAGGAATTGTTAAGGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtgg < 2:3776887/91‑1 (MQ=255) ttGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtgg > 2:3860729/1‑91 (MQ=255) ttGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtgg > 2:1303390/1‑91 (MQ=255) ttGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtgg > 2:3738267/1‑91 (MQ=255) ttGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGATACTGATAgtgg > 2:3283132/1‑91 (MQ=255) tGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGACAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtggt > 2:3118527/1‑91 (MQ=255) gCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtggtg < 1:753033/91‑1 (MQ=255) gCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtggtg < 2:1636/91‑1 (MQ=255) gCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAgtggtg < 1:1725832/91‑1 (MQ=255) aGGAATTGTTAGCGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGtgtg < 1:3584745/91‑1 (MQ=255) aGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGtgtg < 2:539628/91‑1 (MQ=255) gAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGaa > 2:2372939/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGaaa < 2:3813329/91‑1 (MQ=255) gTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAattat > 1:2074336/1‑91 (MQ=255) ttAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGACAGAGCTTTAGAAACGGTGTTAGGTACTGATAGTGGGGTGAAattatt > 2:918694/1‑91 (MQ=255) tAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTAttt > 1:2793314/1‑91 (MQ=255) aaCGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTg > 2:3154089/1‑91 (MQ=255) aaCGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTg < 1:2732677/91‑1 (MQ=255) aaCGAAAAAGGCAATGTATGTGGCACGATACCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGATGTTAGGTACCGATAGCGGAGTGAAATCATTTg > 2:3447211/1‑91 (MQ=255) aCGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGa > 1:2057685/1‑91 (MQ=255) aaaGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGa < 1:1458448/91‑1 (MQ=255) aaaGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGa > 2:1515366/1‑91 (MQ=255) aaaGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGa > 2:244113/1‑91 (MQ=255) aaGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTACAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGAt < 1:3135132/91‑1 (MQ=255) aGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATg < 1:1437404/91‑1 (MQ=255) aGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATg > 2:2731267/1‑91 (MQ=255) aGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATg < 1:2235894/91‑1 (MQ=255) ggCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATgg > 2:2867746/1‑91 (MQ=255) ggaaTGGAGGTGGCAGGATGCCACAGCCTGAGGGAGCTGTAGAGACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATGTGAAGCGATGGt < 2:1571166/89‑1 (MQ=255) cAATGTATGTGGCATGATGCCACCTCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAACTATTTGAAGCGATggga > 2:2568850/1‑89 (MQ=255) aaTGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGCTAGGTACTGCTAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTaa > 2:2532256/1‑91 (MQ=255) atgtatgtGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTaaa > 2:3839672/1‑91 (MQ=255) atgtatgtGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTaaa > 2:749726/1‑91 (MQ=255) tgtatgtGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTaaaa < 1:1009610/91‑1 (MQ=255) tatgtGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGGTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAg < 2:2589615/91‑1 (MQ=255) atgtGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGt < 2:3078367/91‑1 (MQ=255) tgtgGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGtt < 1:151633/91‑1 (MQ=255) gtgGCATCATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGCTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGCTGGTAAAAAGTTg > 1:451685/1‑91 (MQ=255) ggCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGa < 2:1281387/91‑1 (MQ=255) ggCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGa > 1:1366483/1‑91 (MQ=255) ggCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGAGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGa < 2:1757846/91‑1 (MQ=255) cATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAgg < 1:2665092/91‑1 (MQ=255) cATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAgg < 2:818377/91‑1 (MQ=255) atgatgCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAggg < 2:1146008/91‑1 (MQ=255) atgatgCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAggg > 2:684187/1‑91 (MQ=255) | TCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAA > USA300TCH1516_ALE/1076439‑1076619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |