| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,366,121 | A→T | 6.2% | intergenic (+420/‑34) | rpmG2_1 → / → rpsN2 | 50S ribosomal protein L33 2/Alternate 30S ribosomal protein S14 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,366,121 | 0 | A | T | 6.2% | 1021.7 / 40.5 | 304 | intergenic (+420/‑34) | rpmG2_1/rpsN2 | 50S ribosomal protein L33 2/Alternate 30S ribosomal protein S14 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (123/161); new base T (3/16); total (126/178) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
TAAATATGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGTAAATAAA > USA300TCH1516_ALE/1366031‑1366211 | aaaTATGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGtaataa < 1:2215716/91‑1 (MQ=255) aaaTATGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGtaataa < 2:2085027/91‑1 (MQ=255) atatGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAattatt < 2:3853756/91‑1 (MQ=255) atatGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAAtt < 2:2208419/91‑1 (MQ=255) atatGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAAtt < 1:1638586/91‑1 (MQ=255) tatGATGGCTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAACCTTCACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATCATATAAATCGTAATAATTa > 2:595980/1‑91 (MQ=255) atgatgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTAc < 1:2821730/91‑1 (MQ=255) gatgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGa > 1:1003972/1‑91 (MQ=255) gatgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGa > 1:61687/1‑91 (MQ=255) atgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAt > 1:1370201/1‑91 (MQ=255) tgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAtt > 1:1388003/1‑91 (MQ=255) tgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAtt < 1:1888757/91‑1 (MQ=255) tgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAtt < 1:2988216/91‑1 (MQ=255) tgGTTTAGAAAAGGATTTAACAAAGAGATGAAACTTTACTGTTGAATGATGTGAGGATTGTGTTATTAGATAAATCGTAATAATTACGAtt < 2:290397/91‑1 (MQ=255) ggTTTAGAAAATGATTTAACGAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTACGAttt < 2:3168242/91‑1 (MQ=255) ggTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAttt < 1:2953122/91‑1 (MQ=255) gTTTAGAAAATGATTTGACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTg < 2:3782138/91‑1 (MQ=255) gTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGGTTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAttta > 2:3920942/1‑90 (MQ=255) gTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTg > 2:482091/1‑91 (MQ=255) tttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTACGATTTGa < 1:3035819/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGAt < 1:880739/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGAt < 1:2794470/91‑1 (MQ=255) tAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATa < 2:1476330/91‑1 (MQ=255) aaaaTGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATaaaa < 2:3743403/91‑1 (MQ=255) aaaTGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATaaaaa < 1:1695507/91‑1 (MQ=255) aaaTGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATaaaaa > 1:868039/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAg < 2:198547/91‑1 (MQ=255) tGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTg > 1:1924263/1‑91 (MQ=255) tGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTg < 2:3491282/91‑1 (MQ=255) tGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTg > 2:665660/1‑91 (MQ=255) tGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTg > 2:1569377/1‑91 (MQ=255) ttAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGt > 1:3888415/1‑91 (MQ=255) ttAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGt > 1:2405477/1‑91 (MQ=255) tAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTa > 2:1971991/1‑91 (MQ=255) tAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTa > 1:1250969/1‑91 (MQ=255) aCAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAAc < 1:2040733/91‑1 (MQ=255) aCAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAAc < 1:795723/91‑1 (MQ=255) cAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACt > 2:3496275/1‑91 (MQ=255) aaaGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACta < 2:1389567/91‑1 (MQ=255) aGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACtata < 1:957455/91‑1 (MQ=255) aGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAAGTAACtata > 1:1769128/1‑91 (MQ=255) gAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACtatat > 1:3180347/1‑91 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTCCGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg > 1:3504393/1‑91 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg < 2:3816698/91‑1 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg < 1:1991267/91‑1 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg < 1:2679843/91‑1 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg < 2:2385941/91‑1 (MQ=255) aaCTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTa > 2:2819279/1‑91 (MQ=255) aaCTTTACTGTTGAATTATGAGAGGATCGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTa > 2:1910851/1‑91 (MQ=255) cTTTACTGTTGAATTACGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTaat < 2:3034332/91‑2 (MQ=255) tttACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGa > 2:1925270/1‑91 (MQ=255) tttACTGTTGAATTATGCGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGa < 2:2587077/91‑1 (MQ=255) tACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGaaa < 1:1303127/91‑1 (MQ=255) aCTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAAt < 1:3344432/91‑1 (MQ=255) tGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCt < 1:3744692/91‑1 (MQ=255) tGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCt > 1:2751998/1‑91 (MQ=255) gTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTa < 2:2371601/91‑1 (MQ=255) gTTGAATTATGAGAGGATCGGGTTATTATCTAAATCGTAATAATTACGATTTGCTAAAAAGTGAGGGATCTATATATGGCTAAGACATCtc > 2:1071356/1‑90 (MQ=255) ttGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTaa < 1:680914/91‑1 (MQ=255) tGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTaaa > 2:973212/1‑91 (MQ=255) gAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTaaaa < 1:3447585/91‑1 (MQ=255) gAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTaaaa < 2:2968021/91‑1 (MQ=255) ttATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAg < 1:1453763/91‑1 (MQ=255) gtgAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCaaa > 2:1716976/1‑91 (MQ=255) gtgAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCaaa < 2:1699722/91‑1 (MQ=255) gAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAag < 2:528913/91‑1 (MQ=255) gAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAag < 1:2118990/91‑1 (MQ=255) gAGGATTGTGTTACTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATGAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAag < 1:3962090/91‑1 (MQ=255) ggATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAagag > 2:224224/1‑91 (MQ=255) ggATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAagag < 2:3219206/91‑1 (MQ=255) ggATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAagag > 1:1427599/1‑91 (MQ=255) ggATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAagag > 2:3958598/1‑91 (MQ=255) gATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAagaga < 2:892185/91‑1 (MQ=255) ttGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAgagaga < 2:2673183/91‑1 (MQ=255) tgtgTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaa < 1:117738/91‑1 (MQ=255) gtgtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAAGTATATATGGCTAAGAAATATAAAATAGCAAAAGAGAGaaa > 2:2473466/1‑91 (MQ=255) gtgtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaaa < 1:2591452/91‑1 (MQ=255) tgtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaaaa > 2:2996392/1‑91 (MQ=255) gtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaaaaa < 1:51913/91‑1 (MQ=255) gtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaaaaa < 2:403062/91‑1 (MQ=255) attatATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagag < 1:1109074/91‑1 (MQ=255) attatATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagag > 1:3660534/1‑91 (MQ=255) attatATAAATCGTAATAACTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCAAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagag > 2:1023205/1‑91 (MQ=255) ttatATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagaga < 2:3305747/91‑1 (MQ=255) ttatATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagaga < 2:1647019/91‑1 (MQ=255) ttatATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagaga < 2:814619/91‑1 (MQ=255) ttatATAAATCGTAATAATTAAGATTGGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAAGCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagaga < 2:3646418/91‑1 (MQ=255) atataAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagagaag > 1:2364265/1‑91 (MQ=255) atataAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagagaag > 2:1140081/1‑91 (MQ=255) taAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGt < 1:152844/91‑1 (MQ=255) aTCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAg < 2:3481703/91‑1 (MQ=255) aTCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAg > 2:2292606/1‑91 (MQ=255) tCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGt > 1:2549334/1‑91 (MQ=255) tCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGt < 2:3118146/91‑1 (MQ=255) cGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGta > 1:3308322/1‑91 (MQ=255) taattaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 2:1812732/1‑91 (MQ=255) taataaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa < 1:2281736/91‑1 (MQ=255) aataatTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaat > 2:1441682/1‑91 (MQ=255) taatTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaataa > 2:2739867/1‑91 (MQ=255) taaaTACGATTTGAT‑AAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGcaaataaa > 2:3501714/1‑91 (MQ=255) | TAAATATGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGTAAATAAA > USA300TCH1516_ALE/1366031‑1366211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |