| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,744,362 | G→A | 8.1% | H104Y (CAC→TAC) | apt ← | Adenine phosphoribosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,744,362 | 0 | G | A | 8.1% | 652.9 / 30.1 | 207 | H104Y (CAC→TAC) | apt | Adenine phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (89/101); new base A (7/10); total (96/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAA > USA300TCH1516_ALE/1744272‑1744452 | cTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTtgtg > 2:1509716/1‑91 (MQ=255) tAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGc > 1:3646650/1‑91 (MQ=255) aaTTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCa < 1:356660/91‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGCTTCAATCGTACCCCCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTCTAATTGCATCTTTGTGCAtt > 2:894674/1‑91 (MQ=255) ttttATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCAtt < 2:2593976/91‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCAtt > 1:193972/1‑91 (MQ=255) ttATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGt < 1:871312/91‑1 (MQ=255) ttATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGt < 2:1900197/91‑1 (MQ=255) ttATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGt < 1:1427544/91‑1 (MQ=255) ttATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGt < 1:243665/91‑1 (MQ=255) tATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGtt > 2:1725554/1‑91 (MQ=255) aTTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑a < 2:2911324/91‑1 (MQ=255) aTTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑a < 1:3836617/91‑1 (MQ=255) ttGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aa > 2:3233073/1‑91 (MQ=255) ttGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aa < 1:3599613/91‑1 (MQ=255) ttGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aa > 1:1572663/1‑91 (MQ=255) ttGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aa < 2:339534/91‑1 (MQ=255) tgctgcTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aaa < 1:415558/91‑1 (MQ=255) tgctgcTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aaa > 2:3896309/1‑91 (MQ=255) gctgctTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aaaa > 1:3768562/1‑91 (MQ=255) gctgctTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑aaaa > 1:2545246/1‑91 (MQ=255) gctTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACAt > 1:3326786/1‑91 (MQ=255) tCAATCGTACCTCCAGTAGCTAATAAATCATCTTTAATTAACGCGCGTTGGCCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTg < 2:2507276/91‑1 (MQ=255) cAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGt > 2:2378480/1‑91 (MQ=255) aTCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTAc < 1:1719043/91‑1 (MQ=255) tCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTAcc > 1:1169012/1‑91 (MQ=255) cGTACCACCAGTAGCTAATAATTCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAAACATTTGTAcc < 2:1329511/91‑1 (MQ=255) cGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCa > 2:604440/1‑91 (MQ=255) gTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCat > 1:2750908/1‑91 (MQ=255) tACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCata > 1:2500388/1‑91 (MQ=255) accaccAGTAGCTAATGAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCatat < 1:2377816/91‑1 (MQ=255) accaGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCt > 1:1066535/1‑91 (MQ=255) accaGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCt < 1:921801/91‑1 (MQ=255) accaGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCt < 2:3072520/91‑1 (MQ=255) accaGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCt > 1:1733606/1‑91 (MQ=255) ccaGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTa > 2:3031508/1‑91 (MQ=255) aGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCa < 1:2786974/91‑1 (MQ=255) aGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCa < 1:2621029/91‑1 (MQ=255) cTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATa > 2:2167639/1‑91 (MQ=255) taataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATAc < 1:1067900/91‑1 (MQ=255) taataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATAc < 2:1986506/91‑1 (MQ=255) taataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATAc < 2:1364994/91‑1 (MQ=255) aataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACt < 1:2291801/91‑1 (MQ=255) aataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACt < 2:1300665/91‑1 (MQ=255) ataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTc < 1:1156747/91‑1 (MQ=255) ataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTc < 2:3620936/91‑1 (MQ=255) ataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTc < 1:158611/91‑1 (MQ=255) ataaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTACATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTc < 2:2314708/91‑1 (MQ=255) taaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCa > 2:1287907/1‑91 (MQ=255) taaATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCa > 1:2845465/1‑91 (MQ=255) aaaTCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCAt > 1:205419/1‑91 (MQ=255) tcatcTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAAc < 1:771105/91‑1 (MQ=255) catcTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACg < 2:3844696/91‑1 (MQ=255) catcTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACg < 1:706598/91‑1 (MQ=255) catcTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACCCATAACg > 2:265701/1‑91 (MQ=255) atcTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGa > 2:530164/1‑91 (MQ=255) atcTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTACATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGa > 2:918819/1‑91 (MQ=255) cTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAAt > 2:3701729/1‑91 (MQ=255) cTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTACATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAAt > 2:277079/1‑91 (MQ=255) tGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATg < 2:1047968/91‑1 (MQ=255) aaTTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTACATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACt > 2:2974847/1‑91 (MQ=255) aaTTAACACACGTTGACCT‑GTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACtt > 2:367905/1‑91 (MQ=255) aTTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACtt > 1:2149614/1‑91 (MQ=255) tAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCa > 2:2181338/1‑91 (MQ=255) tAACACACGTTGACCTGGTTTAACTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCa > 2:1582115/1‑91 (MQ=255) cacacGGTGAGGTAGTTTAATTGGATCTTTGTGCAGTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTGCACGa < 2:3590299/91‑1 (MQ=255) acacGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCGTACTCATAACGAATGACTTCACGAg > 1:3685026/1‑91 (MQ=255) cacGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAgg < 1:1572142/91‑1 (MQ=255) cacGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTACATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAgg > 2:342824/1‑91 (MQ=255) cGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTa > 1:1344038/1‑91 (MQ=255) gTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTaa < 1:1711304/91‑1 (MQ=255) ccTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTcc < 1:1683603/91‑1 (MQ=255) ccTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTcc < 2:2417654/91‑1 (MQ=255) ccTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTcc < 2:493510/91‑1 (MQ=255) ccTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTcc > 2:1094814/1‑91 (MQ=255) tGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCct > 1:3675179/1‑91 (MQ=255) ggTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATACTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCctt < 1:3138826/91‑1 (MQ=255) gTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTGGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCcttc < 2:3055715/91‑1 (MQ=255) tttAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAGTTTCCcttct > 1:3877856/1‑91 (MQ=255) tttAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCcttct < 2:2692890/91‑1 (MQ=255) aaTTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCtttt < 2:2041770/91‑1 (MQ=255) aTTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTc > 1:3464454/1‑91 (MQ=255) ttGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCt < 1:962479/91‑1 (MQ=255) tGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTa > 1:2419691/1‑91 (MQ=255) tGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCACTTCTTTTCTa > 1:3576568/1‑91 (MQ=255) gCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTaa > 1:510779/1‑91 (MQ=255) cATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAAc < 1:662683/91‑1 (MQ=255) cATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAAc > 1:117837/1‑91 (MQ=255) tCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAg < 1:494034/91‑1 (MQ=255) tCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAg < 2:211909/91‑1 (MQ=255) tCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAg < 2:1146970/91‑1 (MQ=255) tCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAg < 1:2665096/91‑1 (MQ=255) tCTTTGTACATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAg < 2:1399094/91‑1 (MQ=255) tgtgCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGc < 2:1631479/91‑1 (MQ=255) tgtgCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCATCTTTTCTAACAGGTGc > 1:3381618/1‑91 (MQ=255) gtgCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTTACAGGTGCa < 1:1976032/91‑1 (MQ=255) tgCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCaa > 1:18875/1‑91 (MQ=255) gCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCaaa > 1:2793407/1‑91 (MQ=255) gCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCaaa > 1:342050/1‑91 (MQ=255) gCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCaaa > 1:2353852/1‑91 (MQ=255) | CTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTT‑AAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAA > USA300TCH1516_ALE/1744272‑1744452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |