| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,042,100 | T→A | 5.3% | K338N (AAA→AAT) | gatB_2 ← | Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,042,100 | 0 | T | A | 5.3% | 820.5 / 24.2 | 244 | K338N (AAA→AAT) | gatB_2 | Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (113/117); new base A (2/11); total (116/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.14e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
ATTTTCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTAAA > USA300TCH1516_ALE/2042010‑2042190 | tttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAttt < 1:853806/91‑1 (MQ=255) tttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAttt < 1:2123701/91‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTa < 2:1641531/91‑1 (MQ=255) tCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTaa > 1:1184848/1‑91 (MQ=255) tCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTaa < 2:3867959/91‑1 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAAc < 1:48352/91‑1 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTAAc < 1:3406678/91‑1 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTAAc < 1:2664657/91‑1 (MQ=255) cTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTAAc < 1:155911/91‑1 (MQ=255) tGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATCTTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTATCa > 2:670880/1‑91 (MQ=255) tGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACa > 2:2799182/1‑91 (MQ=255) ggTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGTCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACAt > 1:3502968/1‑91 (MQ=255) ggTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACAt > 2:2748766/1‑91 (MQ=255) ggTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACAt > 1:1829310/1‑91 (MQ=255) gtgtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATc < 1:2062662/91‑1 (MQ=255) gtgtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATc > 1:2189416/1‑91 (MQ=255) gtgtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATc > 1:3204737/1‑91 (MQ=255) tgtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCt > 2:3322337/1‑91 (MQ=255) gtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTg > 2:2634468/1‑91 (MQ=255) gtTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTg > 2:1172036/1‑91 (MQ=255) ttAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGc < 1:1250595/91‑1 (MQ=255) ttAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGc < 1:2473827/91‑1 (MQ=255) ttAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGc > 2:3312024/1‑91 (MQ=255) ttAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGc > 2:2613418/1‑91 (MQ=255) ttAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAAATTAACATCtaa < 1:2294367/91‑3 (MQ=255) tAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCa > 2:1844645/1‑91 (MQ=255) aaTTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCAc < 2:2284185/91‑1 (MQ=255) aaTTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCAc > 2:2920879/1‑91 (MQ=255) ttAGTATCTAAGAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAAGCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgt < 2:3017339/91‑1 (MQ=255) tAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtg < 2:1052158/91‑1 (MQ=255) tAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtg > 2:1743644/1‑91 (MQ=255) tAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTAAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtg < 2:3650129/91‑1 (MQ=255) aGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtgt < 2:1334637/91‑1 (MQ=255) aGTATCTAATAATTCTACTTAATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCgtgt < 2:3696404/91‑1 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt > 2:1514490/1‑91 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt > 2:1455941/1‑91 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt > 1:2362574/1‑91 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt > 1:794327/1‑91 (MQ=255) gTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGtt > 2:2439722/1‑91 (MQ=255) tATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTc < 2:424415/91‑1 (MQ=255) tATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTc > 1:626683/1‑91 (MQ=255) tCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCaa < 1:1480214/91‑1 (MQ=255) tCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCaa > 2:561489/1‑91 (MQ=255) tCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCaa > 1:1651300/1‑91 (MQ=255) cTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAAt > 2:1492504/1‑91 (MQ=255) aatTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCTAttgttg > 2:3517099/1‑91 (MQ=255) tCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGAtt > 1:452216/1‑91 (MQ=255) cTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTc < 1:3884529/91‑1 (MQ=255) tACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCa < 1:3197400/91‑1 (MQ=255) aCTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCaa < 1:131432/91‑1 (MQ=255) aCTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCaa > 2:3915080/1‑91 (MQ=255) aCTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCaa < 1:3523217/91‑1 (MQ=255) gATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGaa < 2:1898070/91‑1 (MQ=255) tttttATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAAt > 1:2320265/1‑91 (MQ=255) tttttATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAAt > 2:3429006/1‑91 (MQ=255) ttatttgAATATTCGTTCGCGCCCCCCATTAACCAGTGAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAACGAAATCTg < 2:3233936/91‑1 (MQ=255) ttatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTg < 2:2777587/91‑1 (MQ=255) tatttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAAtgtca < 1:3309825/91‑5 (MQ=255) atttaAATATTCGTTTACGCCATCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAGCATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGAc < 2:3004850/91‑1 (MQ=255) atttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGAc > 1:2773841/1‑91 (MQ=255) atttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGAc < 2:2601925/91‑1 (MQ=255) atttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGAc > 1:2834400/1‑91 (MQ=255) atttaAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGAc > 1:2834324/1‑91 (MQ=255) taAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACAtt > 1:3237407/1‑91 (MQ=255) aaTAGTCGTTTACGCCACCCTTGAGCCAGTTGGATGTGAATTTAACATCTTCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAATAAATCTGACATTTc < 2:3400024/91‑1 (MQ=255) atatTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCt < 2:851755/91‑1 (MQ=255) tatTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCtt < 1:1866877/91‑1 (MQ=255) atTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCttt > 1:1898090/1‑91 (MQ=255) tttACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCa > 2:2721711/1‑91 (MQ=255) ttACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCaa < 2:74824/91‑1 (MQ=255) aCGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATg < 2:2028649/91‑1 (MQ=255) aCGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATg < 1:1230561/91‑1 (MQ=255) aCGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATg > 1:361186/1‑91 (MQ=255) gCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGtt > 2:2699912/1‑91 (MQ=255) aCCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAAt > 1:1576123/1‑91 (MQ=255) cccATTAACCAGTTATATGCTAATTTAACATCCGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTTTTTCGTCACTGTTAATa > 2:3461106/1‑91 (MQ=255) cccATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATa > 2:637533/1‑91 (MQ=255) cccATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATa > 2:991223/1‑91 (MQ=255) cccATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATa > 1:1798547/1‑91 (MQ=255) cccATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATa > 2:1380302/1‑91 (MQ=255) ccATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGAGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATAc < 2:3739050/91‑1 (MQ=255) cATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACg < 1:3752764/91‑1 (MQ=255) aTTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgt < 1:2070411/91‑1 (MQ=255) aTTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgt < 1:96771/91‑1 (MQ=255) ttAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgtg < 2:887424/91‑1 (MQ=255) attaCCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgtg > 1:1010661/4‑91 (MQ=255) tAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACgtgt < 2:3165534/91‑1 (MQ=255) aaCCAGTTAGATGTTAATTTAACCTCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAACCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGtgtg > 2:3944422/1‑91 (MQ=255) aaCCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGtgtg < 2:757585/91‑1 (MQ=255) ccAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCa > 2:2434486/1‑91 (MQ=255) cAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCAt < 1:1692209/91‑1 (MQ=255) cAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCAt < 2:3743041/91‑1 (MQ=255) aGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATc > 1:2306235/1‑91 (MQ=255) aGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATc > 1:1299102/1‑91 (MQ=255) gATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATg < 1:3853036/91‑1 (MQ=255) gATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATg > 1:1446050/1‑91 (MQ=255) gTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAg < 2:1605970/91‑1 (MQ=255) gTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTCTGCATCGTATGCAg > 2:3232351/1‑91 (MQ=255) gTTAAATTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAg > 1:1594758/1‑91 (MQ=255) ttAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAgg < 1:70046/91‑1 (MQ=255) | ATTTTCTGGTGTTAATTTAGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCACCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTAAA > USA300TCH1516_ALE/2042010‑2042190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |