| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,243,504 | A→T | 11.3% | intergenic (+82/+27) | USA300HOU_RS11475 → / ← pyrG | hypothetical protein/CTP synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,243,504 | 0 | A | T | 11.3% | 791.7 / 71.5 | 259 | intergenic (+82/+27) | USA300HOU_RS11475/pyrG | hypothetical protein/CTP synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (122/107); new base T (21/8); total (144/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.30e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
GAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCGGACGA > USA300TCH1516_ALE/2243414‑2243594 | gAATTATACAAGTCCCTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAGCATTATACAAAAAACCGGTACATTCAATGTTTAACaa > 2:3881277/1‑91 (MQ=255)gAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTCACATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACaa > 2:159767/1‑91 (MQ=255) aaTTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTACAAATATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAAt > 2:3668464/1‑91 (MQ=255) aaTTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAAt > 2:1723443/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATCTTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCGATGTTTAACAATg > 1:3961207/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATg > 1:1419806/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATg > 1:3348063/1‑91 (MQ=255) ttATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCATTGTTAAACATTGa < 1:1162901/91‑1 (MQ=38) ttATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCATTGTTAAACATTGa < 1:138152/91‑1 (MQ=38) ttATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCATTGTTAAACATTGa < 2:3494552/91‑1 (MQ=38) ataAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGaaa > 1:1269539/1‑91 (MQ=255) ataAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGaaa < 1:3536243/91‑1 (MQ=255) taAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGACAg > 2:2542205/1‑91 (MQ=255) taAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAg > 1:2526441/1‑91 (MQ=255) taAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAg < 2:1998016/91‑1 (MQ=255) aaaGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTa < 1:1938651/91‑1 (MQ=255) aaGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTAc < 1:3241410/91‑1 (MQ=255) aaGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTAc > 1:3154342/1‑91 (MQ=255) aaGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTAc < 1:1813072/91‑1 (MQ=255) aaGTCACTAGTATTATTTCATA‑CGTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAAGCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTAc < 2:3018242/91‑1 (MQ=255) aGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAGCCGGTACTTTCATTGTTAAACATTGAAAGTAcc < 1:108736/91‑1 (MQ=37) aGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTAcc > 2:1185808/1‑91 (MQ=255) gTCACTATTGTTATTTCATACCCTTGTCACTAACATAATATCAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTAcc < 2:222771/91‑1 (MQ=39) tCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAGAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCgg < 2:1310491/91‑1 (MQ=255) cACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGt < 1:2016635/91‑1 (MQ=255) cACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGt < 1:3309216/91‑1 (MQ=255) cACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGt < 1:3024082/91‑1 (MQ=255) ttGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTttat > 1:425283/1‑91 (MQ=255) tGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTttatt > 1:3835431/1‑91 (MQ=255) tATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGc < 1:618279/91‑1 (MQ=255) aTTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCa < 2:2469975/91‑1 (MQ=255) ttCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCaaa > 2:1033698/1‑91 (MQ=255) ttCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCaaa < 1:3692497/91‑1 (MQ=255) tCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAat > 1:2180662/1‑91 (MQ=255) cATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatt < 2:3403532/91‑1 (MQ=255) cATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatt > 2:680248/1‑91 (MQ=255) a‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatttat > 2:7945/1‑91 (MQ=255) cTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatttattt > 1:2571985/1‑91 (MQ=255) cTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatttattt < 2:1476537/91‑1 (MQ=255) gTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatttatttatt < 1:3940765/91‑1 (MQ=255) tCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatttatttattt > 2:1825136/1‑91 (MQ=255) cACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAatttatttattct > 1:2423739/1‑89 (MQ=255) cACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTAtttt > 2:1000281/1‑91 (MQ=255) aCTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTttg < 1:2076993/91‑1 (MQ=255) aCTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTttg < 1:2500497/91‑1 (MQ=255) cTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTGACAATGAAAGTACCGGTTCAATTAGCAAATTTATTTATTttgt > 2:3671059/1‑91 (MQ=39) cTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTttgt > 1:2794821/1‑91 (MQ=255) tAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTttgtt < 1:2549236/91‑1 (MQ=255) cATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGat < 1:1717498/91‑1 (MQ=255) ataataTTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTTCCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGata < 2:2256267/91‑1 (MQ=255) ataataTTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGata < 2:3602375/91‑1 (MQ=255) aataTTAAAATTATACGTAAAACCGGTACTTTGAATGTTTAACAATGAGAGTACCGGTTTTATTAGCATATTTATTTATTTTGTTGATAtt < 2:1355595/91‑1 (MQ=38) aataTTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATAtt < 2:1228251/91‑1 (MQ=255) atatTAAAATTATATGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATAttt > 2:2805771/1‑91 (MQ=255) atatTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACACTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATAttt > 2:3048133/1‑91 (MQ=255) atTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTa < 1:772452/91‑1 (MQ=255) atTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTa < 1:2339792/91‑1 (MQ=255) ttAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTaa < 1:1022880/91‑1 (MQ=255) ttAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTaa < 2:163939/91‑1 (MQ=255) tAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAAt > 1:3773708/1‑91 (MQ=255) aaTTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGaa > 2:1859852/1‑91 (MQ=255) aTTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAg < 1:3734815/91‑1 (MQ=255) ttATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGc < 1:2206878/91‑1 (MQ=255) ttATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGc < 1:463719/91‑1 (MQ=255) ataCGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCtt < 1:3216237/91‑1 (MQ=255) aCGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCa > 1:3617257/1‑91 (MQ=255) aCGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATCAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCa > 2:3469186/1‑91 (MQ=255) cGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCaa > 1:3070715/1‑91 (MQ=255) aaaCCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATaaa > 1:2908102/1‑91 (MQ=255) aCCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATg > 1:2607571/1‑91 (MQ=255) ccGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGa > 2:2098731/1‑91 (MQ=255) cGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAt > 1:131337/1‑91 (MQ=255) cGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAt < 1:3495221/91‑1 (MQ=255) ggTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAAtaaat < 2:3735992/91‑5 (MQ=255) ggTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAtt < 2:2031104/91‑1 (MQ=255) gTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTCTTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAttt > 2:3089262/1‑91 (MQ=255) gTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAttt > 1:2118370/1‑91 (MQ=255) gTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAttt > 2:2549915/1‑91 (MQ=255) gTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAttt > 2:538999/1‑91 (MQ=255) gTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGAttt < 2:1111795/91‑1 (MQ=255) aCTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTaa < 2:3745020/91‑1 (MQ=255) aCTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTaa > 2:3260782/1‑91 (MQ=255) aCTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTaa > 2:618488/1‑91 (MQ=255) cTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTaaa > 1:2324801/1‑91 (MQ=255) tcattGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAAt > 2:4105/5‑91 (MQ=38) cattGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATc > 2:3518260/4‑91 (MQ=38) cAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATc > 1:1282635/1‑91 (MQ=255) attGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCACATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCg > 2:1068138/3‑91 (MQ=38) attGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCg > 1:2058285/3‑91 (MQ=38) attGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCg > 1:1875232/3‑91 (MQ=38) attGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCg > 2:575465/3‑91 (MQ=38) attGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAACCg > 2:893273/3‑91 (MQ=38) ttGTTAAACATTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTAAAAAATCgg > 1:3552039/2‑91 (MQ=38) gTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGt < 2:2698082/91‑1 (MQ=255) ttAACAATGAAAGTACCTGTTTTATTAGCAAATTTATGTATTTTGTTGATAGTTGAATGAAGCTTCAATAAGTGATTTAAGAATCGGGTGc < 2:2396255/91‑1 (MQ=255) ttAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGc > 1:3861744/1‑91 (MQ=255) tAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCg < 1:2669666/91‑1 (MQ=255) tAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCg < 2:1923011/91‑1 (MQ=255) aaCAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCgg < 2:3362461/91‑1 (MQ=255) aTGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTGATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCGGACGa < 2:836734/91‑1 (MQ=255) | GAATTATAAAAGTCACTATTGTTATTTCATA‑CCTTGTCACTAACATAATATTAAAATTATACGAAAAACCGGTACTTTCAATGTTTAACAATGAAAGTACCGGTTTTATTAGCAAATTTATTTATTTTGTTGATATTTTAATGAAGCTTCAATAAATGATTTAAAAATCGGGTGCGGACGA > USA300TCH1516_ALE/2243414‑2243594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |