| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,398,086 | A→T | 5.2% | intergenic (‑247/‑43) | modA ← / → fdhD | Molybdate‑binding periplasmic protein/Sulfurtransferase FdhD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,398,086 | 0 | A | T | 5.2% | 858.5 / 29.3 | 251 | intergenic (‑247/‑43) | modA/fdhD | Molybdate‑binding periplasmic protein/Sulfurtransferase FdhD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (105/133); new base T (8/5); total (113/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
CGAATTCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGATATGAAGAT > USA300TCH1516_ALE/2397996‑2398176 | cGAATTCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCaaa > 2:433662/1‑91 (MQ=255) gAATTCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAAt > 1:2594856/1‑91 (MQ=255) gAATTCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAAt < 1:1798413/91‑1 (MQ=255) aaaTTCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAAt < 2:3264462/90‑1 (MQ=255) aaTTCAATTTAAATCAAACATATTACTCTCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAATCAAATATATTAAAATTTT‑AATCAAAtt < 2:367058/91‑1 (MQ=255) aaTTCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAAtt < 2:2545651/91‑1 (MQ=255) ttCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGc > 1:2093359/1‑91 (MQ=255) tCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCt < 2:3740733/91‑1 (MQ=255) cAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAGCTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCtt < 1:3352512/91‑1 (MQ=255) cAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCtt < 1:799399/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCttt > 2:3402791/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTa > 1:1538391/1‑91 (MQ=255) tttAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATATTAAAATTTTAAAGCAATTTGCttaa < 2:2248564/91‑3 (MQ=255) ttAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCTATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTaaa < 2:3904431/91‑1 (MQ=255) ttAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTTAAAGCAATTTGCttaaa < 2:3571855/91‑4 (MQ=255) tAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTaaaa < 1:3438800/91‑1 (MQ=255) aaaTCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAAt < 1:1989788/91‑1 (MQ=255) aaaTCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAAt < 1:1697784/91‑1 (MQ=255) aaTCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATa > 1:564766/1‑91 (MQ=255) aTCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATaa < 2:277535/91‑1 (MQ=255) aTCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATaa < 1:2928898/91‑1 (MQ=255) cAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAg < 2:691879/91‑1 (MQ=255) aaCAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGtt > 1:469420/1‑91 (MQ=255) aaCAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGtt < 2:2497115/91‑1 (MQ=255) aCAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGttt < 2:32316/91‑1 (MQ=255) aGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAACTTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTaa > 2:2598209/1‑91 (MQ=255) aGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTaa > 1:2999862/1‑91 (MQ=255) gATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAg < 1:1231588/91‑1 (MQ=255) gATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAg < 1:3774890/91‑1 (MQ=255) aTTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGc < 2:3135985/91‑1 (MQ=255) aTTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGc < 1:3282000/91‑1 (MQ=255) aTTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGc > 1:1891289/1‑91 (MQ=255) tGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTa < 2:270596/91‑1 (MQ=255) tGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTa < 1:1674492/91‑1 (MQ=255) gCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTaa > 1:1643254/1‑91 (MQ=255) cTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAAt < 2:2386174/91‑1 (MQ=255) cTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAAt > 2:1234234/1‑91 (MQ=255) cTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAAt < 2:2774857/91‑1 (MQ=255) tCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAAtt > 2:3845636/1‑91 (MQ=255) tCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAAtt < 1:863335/91‑1 (MQ=255) cGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTa < 2:1413352/91‑1 (MQ=255) gCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTaa > 2:137923/1‑91 (MQ=255) tATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAg < 1:2290550/91‑1 (MQ=255) tATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAg > 1:212669/1‑91 (MQ=255) tAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAgggg < 1:603991/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGt < 1:1649797/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGt < 1:704456/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGt < 1:3621905/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGt > 1:1016424/1‑91 (MQ=255) aTTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGtt > 2:1761284/1‑91 (MQ=255) ttttATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAg < 2:286826/91‑1 (MQ=255) tttATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGa > 1:2876248/1‑91 (MQ=255) tttATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGa > 2:496638/1‑91 (MQ=255) atcaatcaAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATaa > 1:2792656/1‑91 (MQ=255) caatcaaATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATg < 2:113433/91‑1 (MQ=255) aatcaaATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGa > 1:270201/1‑91 (MQ=255) atcaaATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGaa > 1:1798248/1‑91 (MQ=255) atcaaATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGaa < 2:2902220/91‑1 (MQ=255) aaaaTTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACa < 1:2515319/90‑1 (MQ=255) aaaTTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACaa < 1:1106691/91‑1 (MQ=255) aaaTTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACaa > 1:1483172/1‑91 (MQ=255) aaaTTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACaa > 2:1651013/1‑91 (MQ=255) aTTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAg > 1:4122/1‑91 (MQ=255) tttCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGa < 2:3770122/91‑1 (MQ=255) ttCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGAt > 2:2922857/1‑91 (MQ=255) aaaCTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTa > 1:192318/1‑91 (MQ=255) aaaCTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTa < 2:2325305/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTAt < 2:2433395/91‑1 (MQ=255) cTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAACGATGTATCt > 2:3956082/1‑91 (MQ=255) aGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCCAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAg > 2:881967/1‑91 (MQ=255) aGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAg > 2:106359/1‑91 (MQ=255) gCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTATAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAgg < 2:837078/91‑1 (MQ=255) gCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAgg > 1:95898/1‑91 (MQ=255) gCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAgg > 2:2307638/1‑91 (MQ=255) gCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAgg < 1:3930487/91‑1 (MQ=255) cAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGt < 2:1933477/91‑1 (MQ=255) aaaTATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTc > 2:335175/1‑91 (MQ=255) aaTATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCa < 1:3470169/91‑1 (MQ=255) aaTATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCa > 2:182197/1‑91 (MQ=255) atatGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGATAGATAATGAACAAAGACGTATCTTTAGGTCaa > 2:1571972/1‑91 (MQ=255) tatGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAAc > 2:953992/1‑91 (MQ=255) tatGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAAc < 2:3528727/91‑1 (MQ=255) tatGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAAc < 1:2357332/91‑1 (MQ=255) tatGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAANTAAAGGGGTTAGATAATGANCAAAGATGTATCTTTAGGTCAAc > 2:1456917/1‑91 (MQ=255) tatGTTAAAAGTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTCAGCTAATTGAGGGGCTTAGATATGGAACAAAGATGTATCTTTAGGGCAAc < 2:3313896/91‑1 (MQ=255) atGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAAcc < 2:3275834/91‑1 (MQ=255) tAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAAtt < 1:750454/91‑1 (MQ=255) aaaTTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGt > 2:1807545/1‑91 (MQ=255) aaTTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGtt < 1:2909160/91‑1 (MQ=255) aaTTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGtt > 2:2334515/1‑91 (MQ=255) aTTTTAAAGCAATTTGC‑TTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTa > 1:437354/1‑91 (MQ=38) t‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAGGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGata > 2:909668/1‑91 (MQ=255) t‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAGGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGata > 2:1673610/1‑91 (MQ=255) t‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGata > 1:1709727/1‑91 (MQ=255) aaGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGatat > 1:2424704/1‑91 (MQ=255) aGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGATATg < 1:3577758/91‑1 (MQ=255) aGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGATATg > 1:11692/1‑91 (MQ=255) gCAATTTGC‑TTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGATATGaa > 1:3267876/1‑91 (MQ=255) aaaTTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGATATGAAg > 2:2004034/1‑91 (MQ=255) aTTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGATATGAAGAt > 2:2872984/1‑91 (MQ=255) | CGAATTCAATTTAAATCAAACAGATTGCTCGCTATTAATTTTTATCAATCAAATTTCAAACTTAAGCAAATATGTTAAAATTTT‑AAGCAAATTGCTTTAAAATAAAGTTTAAGCTAATTAAAGGGGTTAGATAATGAACAAAGATGTATCTTTAGGTCAACCAATTGTTAGATATGAAGAT > USA300TCH1516_ALE/2397996‑2398176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |