Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 2,428,879 | T→A | 5.9% | T256T (ACA→ACT) ‡ | lytR_2 ← | Transcriptional regulator LytR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 2,428,879 | 0 | T | A | 5.9% | 859.4 / 30.1 | 250 | T256T (ACA→ACT) ‡ | lytR_2 | Transcriptional regulator LytR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (91/143); new base A (9/6); total (100/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CCTTGACCACTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCAAGC > USA300TCH1516_ALE/2428790‑2428969 | cTTGACCACTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGt < 1:391213/91‑1 (MQ=255) gACCACTCAATGGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGtttt > 2:496350/1‑91 (MQ=255) aCCACTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTa < 1:3569811/91‑1 (MQ=255) ccACTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTaa < 2:751424/91‑1 (MQ=255) cACTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAAc < 1:1393589/91‑1 (MQ=255) cACTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAAc < 1:56316/91‑1 (MQ=255) aCTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACa < 1:545039/91‑1 (MQ=255) tCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACatt < 1:2025130/91‑1 (MQ=255) tCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACatt > 2:2641801/1‑91 (MQ=255) tCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACatt > 2:2070382/1‑91 (MQ=255) tCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAAACAGATTTAACatt < 1:2253514/91‑1 (MQ=39) cAATTGATGCTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACatta < 1:3546538/91‑1 (MQ=255) aaTTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACattat < 1:229612/91‑1 (MQ=255) aTTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACattatt < 2:2821162/91‑1 (MQ=255) aTTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAAACAGATTTAACattagg < 2:2230284/91‑3 (MQ=38) ttGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTAttt < 2:1496974/91‑1 (MQ=255) tGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTAtttt > 2:2997393/1‑91 (MQ=255) gATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTg < 1:318090/91‑1 (MQ=255) aTGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGa > 1:1116757/1‑91 (MQ=255) tGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGaa > 1:3597245/1‑91 (MQ=255) gTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAAt > 2:3922883/1‑91 (MQ=255) tttATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAAtt < 1:245436/91‑1 (MQ=255) ttattaATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAAttt < 1:913645/91‑1 (MQ=255) attaATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATttca < 2:840701/91‑1 (MQ=255) ttaATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATttcat < 2:789863/91‑1 (MQ=255) taAACGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATttcatt < 1:299122/91‑1 (MQ=255) aTCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATttcattca > 1:3209710/1‑91 (MQ=255) tCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTtcattcat < 2:1602740/91‑1 (MQ=255) gtgtCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTa > 2:3601567/1‑91 (MQ=255) gtgtCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTa < 1:2564083/91‑1 (MQ=255) tCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGAc < 2:2405200/91‑1 (MQ=255) tCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGAc < 1:1302959/91‑1 (MQ=255) cATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACt < 2:1272498/91‑1 (MQ=255) aTTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTa < 1:866116/91‑1 (MQ=255) ttAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTAt > 1:1463836/1‑91 (MQ=255) ttAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTAt < 1:44821/91‑1 (MQ=255) ttAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTAt < 1:44694/91‑1 (MQ=255) ttAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTAt > 2:3582204/1‑91 (MQ=255) aGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTa < 1:13837/91‑1 (MQ=255) aTCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTaaaa > 2:339795/1‑91 (MQ=255) aTCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTaaaa < 1:2615985/91‑1 (MQ=255) tCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAAt < 2:1349855/91‑1 (MQ=255) cTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAAtg > 2:201200/1‑91 (MQ=255) cTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAAtg < 2:2840896/91‑1 (MQ=255) cTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAAtg < 2:2841476/91‑1 (MQ=255) ttATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAAtgtg < 1:1771218/91‑1 (MQ=255) tataATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATgtgt < 1:125332/91‑1 (MQ=255) tataATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATgtgt < 2:32432/91‑1 (MQ=255) ataATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTa < 1:624117/91‑1 (MQ=255) ttGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTTACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCg < 2:1118207/91‑1 (MQ=255) ttGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCg < 1:3809070/91‑1 (MQ=255) gCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCgat < 1:1889432/91‑1 (MQ=255) gCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCgat < 1:278642/91‑1 (MQ=255) cTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCgatg < 1:1219986/91‑1 (MQ=255) cTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCgatg < 2:292859/91‑1 (MQ=255) cTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCgatg < 2:289506/91‑1 (MQ=255) tAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATgg > 2:2536733/1‑91 (MQ=255) aaTCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATggg > 2:1445551/1‑91 (MQ=255) aTCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGc > 1:823822/1‑91 (MQ=255) aTCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGc > 2:2093105/1‑91 (MQ=255) tCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCt < 1:2929416/91‑1 (MQ=255) tCGTATTCAAATAACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCt > 1:3034743/1‑91 (MQ=255) cGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCtt < 1:1249465/91‑1 (MQ=255) cGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCtt < 1:324735/91‑1 (MQ=255) gTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTg < 2:1376044/91‑1 (MQ=255) gTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTg > 2:2486264/1‑91 (MQ=255) gTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCAGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTg > 2:2244062/1‑91 (MQ=255) tATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGc < 2:3287134/91‑1 (MQ=255) tATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGc > 1:1550130/1‑91 (MQ=255) aTTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTCACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGCCTATTAAAATGTGTAATCGCTGATGGGCTTGCa > 2:2262348/1‑91 (MQ=255) ttCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCaa < 1:3343661/91‑1 (MQ=255) ttCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCaa < 1:3280290/91‑1 (MQ=255) tCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAAt < 2:1874707/91‑1 (MQ=255) tCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAAt < 2:2286137/91‑1 (MQ=255) tCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGAATATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAAt < 1:3533018/91‑1 (MQ=255) cAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATc < 2:1224956/91‑1 (MQ=255) aaaTCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCt > 1:103299/1‑91 (MQ=255) cACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTAtt < 2:2774866/91‑1 (MQ=255) cACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTAtt < 2:1976448/91‑1 (MQ=255) cACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTAtt > 1:3740676/1‑91 (MQ=255) aaaatAATGTTAAAACAGATTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTAtt > 2:1115094/5‑91 (MQ=38) aCCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTg > 2:584845/1‑91 (MQ=255) ccTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTgg < 1:685390/91‑1 (MQ=255) aatAATGTTAAAACAGATTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTGATTgg > 2:3636868/3‑91 (MQ=38) cTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGc < 1:3633066/91‑1 (MQ=255) cTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGc < 2:3117347/91‑1 (MQ=255) tAATGTTAAAACAGATTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGcc > 2:2102767/1‑91 (MQ=39) aTGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCAt < 1:2962233/91‑1 (MQ=255) aTGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCAt > 2:2943020/1‑91 (MQ=255) aTGTTAAAACAGATTTAACATTATTTTGAATTTCATTTATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCAt > 2:1623298/1‑91 (MQ=255) gNTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGNATTTCATNCATTAGACTATTAANATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTNGCCATCg > 2:2375310/1‑91 (MQ=255) aaaTCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCtt > 1:3115805/1‑91 (MQ=255) aaTCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTc > 1:1437137/1‑91 (MQ=255) aTCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCa < 1:3090984/91‑1 (MQ=255) tCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCaa < 1:1632203/91‑1 (MQ=255) cTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAGATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCAAg < 2:691094/91‑1 (MQ=255) cTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCAAg < 2:3770681/91‑1 (MQ=255) cTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCAAg < 1:2808466/91‑1 (MQ=255) tGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCAAGc < 1:230094/91‑1 (MQ=255) tGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCAAGc < 2:2450787/91‑1 (MQ=255) | CCTTGACCACTCAATTGATGTTTATTAATCGTGTCATTAGCATCTTTATAATTGCTTCTAATCGTATTCAAATCACCTAATGTTAAATCTGTTTTAACATTATTTTGAATTTCATTCATTAGACTATTAAAATGTGTAATCGATGATGGGCTTGCAATCTTATTGGCCATCGCTTCAAGC > USA300TCH1516_ALE/2428790‑2428969 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |