| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,538,743 | A→T | 11.3% | intergenic (‑257/+70) | gpmA_2 ← / ← fieF | 2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase/Ferrous‑iron efflux pump FieF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,538,743 | 0 | A | T | 11.3% | 819.1 / 81.4 | 272 | intergenic (‑257/+70) | gpmA_2/fieF | 2,3‑bisphosphoglycerate‑dependent phosphoglycerate mutase/Ferrous‑iron efflux pump FieF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (90/150); new base T (2/29); total (92/180) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.09e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
TCATAAATGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTGGTTCTG > USA300TCH1516_ALE/2538654‑2538832 | cATAAATGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTaaa < 1:2446030/91‑1 (MQ=255) cATAAATGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTaaa < 2:3793585/91‑1 (MQ=255) atttaTGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAAc > 1:2293680/5‑91 (MQ=255) aaaTGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCt < 1:3698514/91‑1 (MQ=255) aaTGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTa < 2:2596203/91‑1 (MQ=255) acgAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATGATACACCTTTGTTCGCCATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTaa < 2:2431962/89‑1 (MQ=255) aTGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTaa < 2:705640/91‑1 (MQ=255) aTGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTaa < 1:2696365/91‑1 (MQ=255) aTGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTaa < 1:2182683/91‑1 (MQ=255) aTGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTaa < 1:2646634/91‑1 (MQ=255) tGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTaaa < 1:3496516/91‑1 (MQ=255) tGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTaaa < 2:1392699/91‑1 (MQ=255) gAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTaaaa < 1:2026730/91‑1 (MQ=255) gAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTaaaa < 1:2252254/91‑1 (MQ=255) gAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTaaaa < 1:3639536/91‑1 (MQ=255) aaTCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTaaaaa < 2:2380539/91‑1 (MQ=255) tCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTAAAAATa < 1:3913646/91‑1 (MQ=255) tCAATAACCACCAAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTAAAAATa < 2:3237483/91‑1 (MQ=39) cAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTAAAAATat < 1:2748674/91‑2 (MQ=255) aaTAACCACCTAATATCTTATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTTTACCTAAAAATatt < 2:1872143/91‑3 (MQ=38) aaTAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTATAAATAGa > 2:3500221/1‑91 (MQ=255) aaTAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGa < 1:1796121/91‑1 (MQ=255) aaCCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCAAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGt < 2:1287687/91‑1 (MQ=255) ccaccTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGtaa > 2:3398454/1‑91 (MQ=255) caccTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTTAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGtaat > 2:808124/1‑91 (MQ=255) caccTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGtaat < 2:92217/91‑1 (MQ=255) aataaCAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATaaaaa < 2:96061/91‑1 (MQ=255) aataaCAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATaaaaa < 1:1392777/91‑1 (MQ=255) aaCAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGc < 1:1164362/91‑1 (MQ=255) cAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGcct > 1:152448/1‑91 (MQ=255) aaaTCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGcctc > 1:2062776/1‑91 (MQ=255) aaaTCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGcctc < 1:3176762/91‑1 (MQ=255) aaTCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGcctcc > 2:1813309/1‑91 (MQ=255) aaTCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGcctcc < 2:3148026/91‑1 (MQ=255) aTCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGcctcct < 1:2333693/91‑1 (MQ=255) aTCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGcctcct < 1:2840022/91‑1 (MQ=255) tCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCctcctc > 2:2162463/1‑91 (MQ=255) tCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCctcctc < 2:478245/91‑1 (MQ=255) cATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCa < 2:2344461/91‑1 (MQ=255) cATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCa < 1:959907/91‑1 (MQ=255) ttatACACCTTTGTTCGCTGTTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGata > 1:2673047/1‑91 (MQ=255) tataCACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGatat > 1:3858310/1‑91 (MQ=255) ataCACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATAtt > 1:1061444/1‑91 (MQ=255) ccTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCGAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTtatat < 1:254173/91‑1 (MQ=255) cgttGTTCGCTATGTTTCTAAGGGTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTtatata < 2:1648679/89‑1 (MQ=255) tttGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTatatat < 2:327421/91‑1 (MQ=255) tttGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTatatat < 1:1077109/91‑1 (MQ=255) ttGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATc < 1:2077041/91‑1 (MQ=255) tGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCt > 2:594833/1‑91 (MQ=255) tGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCt > 1:3414792/1‑91 (MQ=255) gTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTa > 2:2957821/1‑91 (MQ=255) gTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTa < 1:1607458/91‑1 (MQ=255) cGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGa > 1:2155498/1‑91 (MQ=255) gCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGaa < 1:2216204/91‑1 (MQ=255) gCTATATTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGaa < 2:1763074/91‑1 (MQ=255) cTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAg < 1:570280/91‑1 (MQ=255) cTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAg > 1:158946/1‑91 (MQ=255) cTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAg > 1:2596301/1‑91 (MQ=255) cTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGACATTCACACATCTATGAAg > 2:3336490/1‑91 (MQ=255) tttttCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACg < 2:2732439/91‑1 (MQ=255) tttttCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACg > 2:2007906/1‑91 (MQ=255) tttttCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATATATATATCTATGAGGACg < 1:3123706/91‑1 (MQ=255) tttCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGtt > 1:1386421/1‑91 (MQ=255) tttCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGtt > 1:2913700/1‑91 (MQ=255) cTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTaa < 2:835593/91‑1 (MQ=255) cTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTaa > 1:2699491/1‑91 (MQ=255) aaGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAAt < 2:3761587/91‑1 (MQ=255) aaGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAAt < 1:2489827/91‑1 (MQ=255) aGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATa < 1:3455756/91‑1 (MQ=255) ggTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATAc < 1:140441/91‑1 (MQ=255) ggTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGAAGTAAAAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATAc < 2:26268/91‑1 (MQ=255) gTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACa < 2:769806/91‑1 (MQ=255) gTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACa < 1:544047/91‑1 (MQ=255) tttAAAAGATGTTTTTAGGTAAACGTAAAAATAGATGTAATAAGAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACAt < 2:3663861/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATAGTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACAt > 2:1297893/1‑91 (MQ=255) tAAAAGATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATta < 2:3210611/91‑1 (MQ=255) tAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATta < 2:2463888/91‑1 (MQ=255) tAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATta < 1:1846498/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTGATAAAAACGCCTCCTCAGATATTGATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATtat < 2:3583189/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAGAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATtat < 2:1134922/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATtat > 1:1716002/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGa < 1:454635/91‑1 (MQ=255) aaTATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGAt > 2:1585333/1‑91 (MQ=255) atatTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATg > 2:2475761/1‑91 (MQ=255) tatTTTTAGGTTTACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATgg > 1:1228798/1‑91 (MQ=255) tatTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATgg > 1:163990/1‑91 (MQ=255) tatTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATgg < 1:3224094/91‑1 (MQ=255) atTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGt < 2:1054267/91‑1 (MQ=255) tttttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGCTATTCATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTc > 2:1218025/1‑91 (MQ=255) tttttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGTAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTc < 1:145518/91‑1 (MQ=255) tttttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTc < 2:2047148/91‑1 (MQ=255) tttttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTc > 2:1472592/1‑91 (MQ=255) ttttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCt < 1:2284431/91‑1 (MQ=255) ttttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCt < 1:3843565/91‑1 (MQ=255) tttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTg < 1:2526953/91‑1 (MQ=255) tttAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTg < 1:1354332/91‑1 (MQ=255) aGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTGGtt < 1:754737/91‑1 (MQ=255) ggTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTGGTTc > 1:461296/1‑91 (MQ=255) ggTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTGGTTc > 1:3789020/1‑91 (MQ=255) ggTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCGCAGATATTTATAGATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTGGTTc < 2:3130924/91‑1 (MQ=255) | TCATAAATGAATCAATAACCACCTAATAACAAATCATATTATACACCTTTGTTCGCTATTTTTCTAAGGTTTAAAAAATATTTTTAGGTAAACCTAAAAATAGATGTAATAAAAACGCCTCCTCAGATATTTATATATCTATGAAGACGTTTAAATACATTATAGATGGTCTGGTTCTG > USA300TCH1516_ALE/2538654‑2538832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |