| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 512,643 | A→G | 16.5% | intergenic (+711/‑6052) | recR → / → speA_2 | Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 512,643 | 0 | A | G | 16.5% | 582.9 / 100.3 | 243 | intergenic (+711/‑6052) | recR/speA_2 | Recombination protein RecR/Arginine decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (120/83); new base G (22/18); total (142/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
ATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAC > USA300TCH1516_ALE/512553‑512733 | ttgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaat < 1:558001/91‑1 (MQ=255) gttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa < 1:3311644/91‑1 (MQ=255) gttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa > 1:422510/1‑91 (MQ=255) atgCAAACAAAACAACTCAACTTAAGGAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg < 2:1974594/89‑1 (MQ=255) aGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg > 1:1366181/1‑91 (MQ=255) aGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg < 1:803995/91‑1 (MQ=255) ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTGAATGTTAATAAAATGt > 2:3781977/1‑91 (MQ=255) ggCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGt > 2:3841761/1‑91 (MQ=255) caaacaaaACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGtat > 1:3434016/1‑91 (MQ=255) aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaa > 2:2555034/1‑91 (MQ=255) aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaa > 2:3497907/1‑91 (MQ=255) aacaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaa < 2:2105076/91‑1 (MQ=255) acaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTCTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat > 1:3177621/1‑91 (MQ=255) acaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat > 1:1855987/1‑91 (MQ=255) acaaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaat > 1:625352/1‑91 (MQ=255) caaaacaaCTCAACTTAAGAAATATCTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt < 2:3685702/91‑1 (MQ=255) caaaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt < 1:823054/91‑1 (MQ=255) aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaa > 2:3857216/1‑91 (MQ=255) aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaa > 1:2255880/1‑91 (MQ=255) aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaa > 2:2815581/1‑91 (MQ=255) aacaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaat < 1:2748944/91‑1 (MQ=255) acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATaattaatt > 2:3799882/1‑91 (MQ=255) acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATaattaatt < 2:1072221/91‑1 (MQ=255) acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAACTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATaattaatt > 1:1194460/1‑91 (MQ=255) aactcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCt > 2:2591070/1‑91 (MQ=255) actcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTCAATAAAATGTACAATTAATTCtt > 2:3016171/1‑91 (MQ=255) ctcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTg > 2:676841/1‑91 (MQ=255) tcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGt < 2:1399980/91‑1 (MQ=255) aactTAAGAAATGACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCg < 2:3288016/91‑1 (MQ=255) ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt < 2:2318866/91‑1 (MQ=255) ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt > 1:1021469/1‑91 (MQ=255) ttAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTa < 1:1797096/91‑1 (MQ=255) aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg < 2:2148972/91‑1 (MQ=255) aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg > 2:126945/1‑91 (MQ=255) aGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa > 1:455017/1‑91 (MQ=255) aGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa < 2:1526517/91‑1 (MQ=255) gAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTATAAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAACTGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa < 2:2241869/91‑1 (MQ=255) gAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTACGaa > 1:1913721/1‑91 (MQ=255) gAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa > 1:2944331/1‑91 (MQ=255) gAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa > 1:195708/1‑91 (MQ=255) aaCTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATg < 2:858582/91‑1 (MQ=255) aCTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGa < 2:2690946/91‑1 (MQ=255) aCTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGa > 2:1709999/1‑91 (MQ=255) tGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACa < 1:1578052/91‑1 (MQ=255) tGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACa < 2:812328/91‑1 (MQ=255) tGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACa < 2:1469287/91‑1 (MQ=255) ttACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGa > 2:2610625/1‑91 (MQ=255) tACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaa > 1:1143107/1‑91 (MQ=255) aCTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaa > 2:3154578/1‑91 (MQ=255) cTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa > 1:2468511/1‑91 (MQ=255) cTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa < 1:2629547/91‑1 (MQ=255) tAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc > 1:3046018/1‑91 (MQ=255) aaCGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt > 1:1645983/1‑91 (MQ=255) aCGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg < 2:3941381/91‑1 (MQ=255) aCGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg < 1:112592/91‑1 (MQ=255) aaaaTTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAAt > 1:3769064/1‑91 (MQ=255) aaaTTTATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAGCTGAATg < 2:575161/91‑1 (MQ=255) aaaTTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATACAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATg > 2:1640940/1‑91 (MQ=255) attaatt‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc > 1:1286974/1‑91 (MQ=255) aatt‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat < 2:1691048/91‑1 (MQ=255) aatt‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat > 1:1447863/1‑91 (MQ=255) att‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAata < 2:937042/91‑1 (MQ=255) att‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAata > 2:3459298/1‑91 (MQ=255) tt‑ttAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat > 2:532638/1‑91 (MQ=255) tt‑ttAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat > 1:1507060/1‑91 (MQ=255) ataaaaaaaGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat < 1:1579901/87‑1 (MQ=255) tAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAGATGAACATTGAAAACTGAATGACACTATgcg > 2:50191/1‑89 (MQ=255) aaaaGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCaa > 2:2453917/1‑91 (MQ=255) aaaGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAc > 2:186052/1‑91 (MQ=255) aGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt > 2:3953402/1‑91 (MQ=255) aGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt > 1:2689497/1‑91 (MQ=255) aGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGt > 1:2391710/1‑91 (MQ=255) gatATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt > 2:2047473/3‑91 (MQ=255) gTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt > 2:1878533/1‑91 (MQ=255) gTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt > 2:22864/1‑91 (MQ=255) gTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt > 1:694810/1‑91 (MQ=255) gTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt < 1:2501147/91‑1 (MQ=255) gTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGtt > 2:1352848/1‑91 (MQ=255) tATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTaa > 2:3602802/1‑91 (MQ=255) tATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTaa > 2:3028784/1‑91 (MQ=255) tATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTaa < 1:2850231/91‑1 (MQ=255) aTTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt < 1:77255/91‑1 (MQ=255) aTTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt > 1:2083518/1‑91 (MQ=255) ttGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAtt > 1:57113/1‑91 (MQ=255) tGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTc > 2:3079826/1‑91 (MQ=255) gACTTAAATCTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc < 1:3780703/91‑1 (MQ=255) catAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGACGATAAAAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTACaa < 2:3355841/89‑1 (MQ=21) cTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGACAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa < 1:3953925/91‑1 (MQ=255) cTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa > 1:2333702/1‑91 (MQ=255) ttAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa < 2:2598411/91‑1 (MQ=255) ttAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa < 2:2918451/91‑1 (MQ=255) tAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa > 2:1802332/1‑91 (MQ=255) aaTGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa > 2:1213168/1‑91 (MQ=255) aaTGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa > 1:3096652/1‑91 (MQ=255) aaTGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa > 1:3713063/1‑91 (MQ=255) taataaAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa < 2:1535555/91‑1 (MQ=255) aataaAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc > 1:1652676/1‑91 (MQ=255) aataaAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc < 1:3583179/91‑1 (MQ=255) aataaAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc < 1:3932348/91‑1 (MQ=255) aataaAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAc > 1:88613/1‑91 (MQ=255) | ATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATT‑TTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAAC > USA300TCH1516_ALE/512553‑512733 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |