| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 598,492 | A→G | 10.8% | intergenic (+41/+241) | tuf → / ← yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 598,492 | 0 | A | G | 10.8% | 655.7 / 57.4 | 241 | intergenic (+41/+241) | tuf/yxeP_2 | Elongation factor Tu/putative hydrolase YxeP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (118/96); new base G (8/18); total (126/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.50e-01 | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
AAGGTGGACGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTT > USA300TCH1516_ALE/598402‑598582 | aGGTGGACGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCaa > 1:1543379/1‑91 (MQ=255) ggTGGACGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAAt < 1:1507126/91‑1 (MQ=255) tGGACGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCg > 2:1740024/1‑91 (MQ=255) gACGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTAAATCGAg > 1:1962540/1‑91 (MQ=255) aCGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAgg < 2:2853428/91‑1 (MQ=255) aCGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGACCCCTCGATTGAgg < 2:2663437/91‑1 (MQ=255) cGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAggg < 1:919608/91‑1 (MQ=255) gTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAgggg < 1:1118163/91‑1 (MQ=255) gTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAgggg < 1:1280133/91‑1 (MQ=255) cTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTATTTCCTTAGATTTTATATAAACAGAAGCTCCCTCAATCGAGGGGTC‑t > 2:2284724/1‑91 (MQ=255) cTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑t < 2:2377422/91‑1 (MQ=255) tGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑tt > 1:1176416/1‑91 (MQ=255) gTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGACCCCTCGATTGAGGGATC‑ttc < 1:627314/91‑2 (MQ=38) tAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑tt‑tt > 1:3648582/1‑91 (MQ=255) gATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑tt‑ttttt > 1:2919314/1‑91 (MQ=255) gATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAAGAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAAAAGACCCCTCGATTGAGGGATC‑tt‑ctttt < 1:3173383/91‑1 (MQ=25) cAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAAt > 1:1353313/1‑91 (MQ=255) cAGGCGTTGTTACTGAAATAATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAA‑AAGACCCCTCGATTGAGGGATC‑TTCTTTTTata < 2:1122329/91‑3 (MQ=18) ggCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAAtgt < 1:2264499/91‑1 (MQ=255) gCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAAtgtg > 2:165597/1‑91 (MQ=255) gCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAAtgtg > 1:2785544/1‑91 (MQ=255) gCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAAAAGACCCCTCGATTGAGGGATC‑TTCTTTTTatata < 1:2281300/91‑5 (MQ=18) ttgttACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTaa < 2:2685199/91‑1 (MQ=255) ttgttACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTaa > 2:1190560/1‑91 (MQ=255) tgttACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTaaa < 1:511837/91‑1 (MQ=255) tACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAAttt < 2:3405993/91‑1 (MQ=255) aCTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAAtttt > 2:3294694/1‑91 (MQ=255) tagAAATTATTTAATGATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTg > 2:2222816/3‑91 (MQ=255) cTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTACATTTTg > 2:1304006/1‑91 (MQ=255) cTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTg > 2:3078569/1‑91 (MQ=255) tggaaTCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGt < 2:1283409/88‑1 (MQ=255) tGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGt < 1:2978291/91‑1 (MQ=255) aaaTCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTaa < 2:2907769/91‑1 (MQ=255) aaaTCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTaa > 2:729834/1‑91 (MQ=255) tCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTACATTTTGTAATgg > 2:408434/1‑91 (MQ=255) tCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATgg > 2:1610309/1‑91 (MQ=255) aTTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCt < 2:2499380/91‑1 (MQ=255) ttAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTCTTT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCt < 1:1323799/91‑1 (MQ=255) ttAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTa > 1:323258/1‑91 (MQ=255) ttAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTa > 2:3630308/1‑91 (MQ=255) tAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTAt > 1:2454468/1‑91 (MQ=255) tAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTAt < 1:3832777/91‑1 (MQ=255) aataatTTCTCATTTCTTAGATTTTATATAATAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTc < 2:2605280/91‑1 (MQ=255) aataatTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTc > 1:3943022/1‑91 (MQ=255) aataatTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTc > 1:3311209/1‑91 (MQ=255) ataatTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCg > 1:1694693/1‑91 (MQ=255) taatttctaatttcTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGa > 2:2724492/1‑91 (MQ=255) taatttctaatttcTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGa > 1:839042/1‑91 (MQ=255) tttctaatttctTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGAttt > 1:2126103/1‑91 (MQ=255) ctaatttctTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTACCTTTTGTAATCGCTATTAGATTTaga > 2:3427207/1‑91 (MQ=255) taatttctTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTagaa < 1:989452/91‑1 (MQ=255) taatttctTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTagaa > 2:536138/1‑91 (MQ=255) taatttctTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTagaa > 1:1648630/1‑91 (MQ=255) aatttctTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGTGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTagaag > 2:1414603/1‑91 (MQ=255) tttctTAGATTTTATATAAAAAGAAGGTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTGAATTTTGTAGTGGCTATTCGATTTAgaagaa < 2:1464062/91‑1 (MQ=255) ttAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACaat > 1:2109839/1‑91 (MQ=255) ttAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACaat > 1:1463517/1‑91 (MQ=255) tAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACaata < 2:3805799/91‑1 (MQ=255) tAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACaata > 2:646625/1‑91 (MQ=255) aGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACaataa > 1:420385/1‑91 (MQ=255) aGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACaataa > 2:2636889/1‑91 (MQ=255) gcttttATATAAACAGAAGCCCCCTCAACCGAGGGGTC‑CT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAAGGGCTATTCGATTTAGACGAACaataat > 2:3651771/3‑91 (MQ=255) tatataAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATtgatg < 1:369813/91‑1 (MQ=255) tatataAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATtgatg < 2:169497/91‑1 (MQ=255) atataAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATtgatga < 2:2468789/91‑1 (MQ=255) atataAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATtgatga > 1:1870711/1‑91 (MQ=255) atataAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATtgatga > 1:2867861/1‑91 (MQ=255) tataAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGaa > 2:2038095/1‑91 (MQ=255) ataAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGaaa > 1:1018340/1‑91 (MQ=255) aaaaaGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAga < 2:2484053/91‑1 (MQ=255) aaaaaGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAga < 2:1216438/91‑1 (MQ=255) aaaaGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgac < 1:2589366/91‑1 (MQ=255) aaaaGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgac < 2:1582081/91‑1 (MQ=255) aaaGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgact > 2:3502222/1‑91 (MQ=255) aaaGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgact < 1:312429/91‑1 (MQ=255) agaagaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTACTGTGTCCATTTTGTACTGGCTATTCGCTTTCGAAGAACACTAATTGACGAACgactga > 2:456300/1‑91 (MQ=255) agaagaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgactga < 1:2702459/91‑1 (MQ=255) agaagaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgactga < 1:2198970/91‑1 (MQ=255) agaagaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgactga < 1:241134/91‑1 (MQ=255) gaagaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgactgac > 2:743794/1‑91 (MQ=255) gaagaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAgactgac < 2:1847744/91‑1 (MQ=255) agaccccTCGATTGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACta > 1:714759/5‑91 (MQ=255) agaccccTCGATTGAAGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATATAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACta > 1:3366106/5‑91 (MQ=255) agaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACta > 1:139557/1‑91 (MQ=255) gaTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGACTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaa > 2:3314615/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaat > 1:3524402/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaat > 2:873764/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaat > 1:3734842/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaat < 2:3109029/91‑1 (MQ=255) tCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaata > 2:3273171/1‑91 (MQ=255) tCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaata > 1:1704519/1‑91 (MQ=255) tCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATCCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaata > 2:2895903/1‑91 (MQ=255) cccTCGATTGAGGGATC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaataa > 1:3439256/1‑91 (MQ=255) cccTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaataa > 1:773625/1‑91 (MQ=255) cccTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACtaataa > 2:2080624/1‑91 (MQ=255) ccTCGATTGAGGGATC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATaaa > 2:3548375/1‑91 (MQ=255) ccTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATaaa < 2:392818/91‑1 (MQ=255) tCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAAc < 2:2834162/91‑1 (MQ=255) cAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACt < 1:3612792/91‑1 (MQ=255) aaTCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACtt < 2:814664/91‑1 (MQ=255) | AAGGTGGACGTACTGTAGGATCAGGCGTTGTTACTGAAATCATTAAATAATTTCTAATTTCTTAGATTTTATATAAAAAGAAGATCCCTCAATCGAGGGGTC‑TT‑TTTTTAATGTGTAAATTTTGTAATGGCTATTCGATTTAGAAGAACAATAATTGATGAAAGACTGACTAATAAAACTT > USA300TCH1516_ALE/598402‑598582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |