| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 631,535 | G→A | 9.4% | intergenic (+161/‑341) | gph_1 → / → proP | Phosphoglycolate phosphatase/Proline/betaine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 631,535 | 0 | G | A | 9.4% | 802.3 / 50.0 | 272 | intergenic (+161/‑341) | gph_1/proP | Phosphoglycolate phosphatase/Proline/betaine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (107/136); new base A (10/16); total (120/152) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
TTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCAC > USA300TCH1516_ALE/631445‑631625 | ttCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAAGAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTg < 1:3686724/91‑1 (MQ=255) tCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGt > 2:2904065/1‑91 (MQ=255) cGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTa > 1:2228634/1‑91 (MQ=255) tttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTaaaa > 2:3137454/1‑91 (MQ=255) ttAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTaaaaa < 2:1173437/91‑1 (MQ=255) aGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTACAAaaata < 1:939418/91‑1 (MQ=255) aGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTACAAaaata < 2:3072117/91‑1 (MQ=255) aGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGCCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTACAAaaata < 1:1344418/91‑1 (MQ=255) gATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAaaataa > 1:61326/1‑91 (MQ=255) gATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAaaataa > 1:2009971/1‑91 (MQ=255) gATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTACAAaaataa < 1:3748524/91‑1 (MQ=255) ttAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAaaataaat < 1:2218273/91‑1 (MQ=255) tAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAAtt > 2:299626/1‑91 (MQ=255) tAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAAtt > 1:2942713/1‑91 (MQ=255) ggAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTaa > 1:1617438/1‑91 (MQ=255) gAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTTTAAAAATAAATTaaa > 2:3453791/1‑91 (MQ=255) aaTTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAg < 1:1869271/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGt < 2:3782683/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGt > 2:2044271/1‑91 (MQ=255) aTTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGt > 1:3658327/1‑91 (MQ=255) tttAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTa < 1:515550/91‑1 (MQ=255) aaaaTAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATg < 1:3062451/91‑1 (MQ=255) aaaaTAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATg > 1:2578170/1‑91 (MQ=255) aaaaTAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAACTAAAGTAATg > 2:3862548/1‑91 (MQ=255) aataaataTTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATGTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGAc < 1:2131124/91‑1 (MQ=255) ataaataTTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACa > 2:2069304/1‑91 (MQ=255) aaataTTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACaaa > 2:3772377/1‑91 (MQ=255) aataTTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAg < 2:3022084/91‑1 (MQ=255) atatTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGt < 1:1796224/91‑1 (MQ=255) atatTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGt < 1:3505906/91‑1 (MQ=255) tatttattAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGtt > 1:1471003/1‑91 (MQ=255) tttattAAACATTATTAATTTTTAAGTAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATGAAAGTAATGACAAAGTTAt < 2:3420233/91‑1 (MQ=255) tttattAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTAt > 1:1208824/1‑91 (MQ=255) tttattAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTAt < 2:3555931/91‑1 (MQ=255) tattgAACATTATGAATTTTTAAAGGGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTGTTGTAAAAATAAAGTAAAGGAATGACAAAGTTATTg < 2:1384742/91‑1 (MQ=255) tattaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTg < 2:236646/91‑1 (MQ=255) tattaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTg < 2:2552740/91‑1 (MQ=255) tattaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTg < 1:474113/91‑1 (MQ=255) tattaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTg < 2:236744/91‑1 (MQ=255) attaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGa < 1:1268982/91‑1 (MQ=255) ttaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGaa < 2:1985296/91‑1 (MQ=255) ttaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGaa < 2:956130/91‑1 (MQ=255) ttaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGaa < 1:2916857/91‑1 (MQ=255) ttaAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGaa < 1:1593254/91‑1 (MQ=255) taAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAg > 1:2963853/1‑91 (MQ=255) cATTATGAATTTTTAAAGAGTAATTTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTaaa < 2:3686596/91‑1 (MQ=255) cATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTaaa < 1:3777617/91‑1 (MQ=255) cATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTaaa > 2:125317/1‑91 (MQ=255) ttATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAAtt < 2:702542/91‑1 (MQ=255) tATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTg > 2:2183676/1‑91 (MQ=255) aTGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAACATAAATTAAAGTAATGACAAAGCTATTGAAGTAAATTGa > 2:3785956/1‑91 (MQ=255) aTGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGa > 2:3347915/1‑91 (MQ=255) aaTTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGta > 1:3912468/1‑91 (MQ=255) aaTTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGta < 2:1829112/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGta > 2:1642904/1‑91 (MQ=255) aaTTTTTAAAGAGGAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGta < 1:1697024/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGtat < 1:734816/91‑1 (MQ=255) aTTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGtat > 1:219373/1‑91 (MQ=255) tAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACa < 2:2470352/91‑1 (MQ=255) aaaGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAt < 2:241601/91‑1 (MQ=255) aaaGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAt > 2:671013/1‑91 (MQ=255) aaaGAGTAATATCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAt < 2:1772864/91‑1 (MQ=255) aaGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAtt > 1:3161368/1‑91 (MQ=255) aaGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAtt < 2:1079453/91‑1 (MQ=255) agagTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACAttt < 1:3322373/91‑1 (MQ=255) gTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTaaa < 2:1587686/91‑1 (MQ=255) tAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAAt < 2:1624290/91‑1 (MQ=255) tAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAAt < 1:978820/91‑1 (MQ=255) aTGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATAc > 1:2620931/1‑91 (MQ=255) tCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGAt < 1:2301767/91‑1 (MQ=255) cTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATg > 2:2707198/1‑91 (MQ=255) tGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGt < 1:1649217/91‑1 (MQ=255) gACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTc < 2:1523650/91‑1 (MQ=255) gACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTc < 2:822472/91‑1 (MQ=255) aCTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCg > 2:1274876/1‑91 (MQ=255) aCTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCg > 1:415967/1‑91 (MQ=255) tCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGaa > 1:642461/1‑91 (MQ=255) gTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGaaaa < 2:2004420/91‑1 (MQ=255) ttGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAAt > 2:2584954/1‑91 (MQ=255) ttGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAAt < 2:703310/91‑1 (MQ=255) ttGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAAt > 1:2438180/1‑91 (MQ=255) tGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATg > 2:2982583/1‑91 (MQ=255) tGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATg > 1:2250409/1‑91 (MQ=255) atttatttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGAt < 1:1110067/91‑1 (MQ=255) atttatttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGAt < 1:2832944/91‑1 (MQ=255) atttatttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTAGTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGAt < 2:3478383/91‑1 (MQ=255) atttatttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGCTATTGAAGTAAATTGAGAATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGaa > 2:3291712/1‑90 (MQ=255) atttatttTTACAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGAt > 1:3361368/1‑91 (MQ=255) atttatttTTACAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGAt > 2:2143206/1‑91 (MQ=255) atttatttTGGGAAAAATAAATAAAAGTAAGAACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGag < 2:412521/91‑2 (MQ=255) ttatttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAg > 2:2818484/1‑91 (MQ=255) ttatttTTACAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAg > 1:3306775/1‑91 (MQ=255) ttatttTTACAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAg > 2:1299436/1‑91 (MQ=255) atttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCa > 1:1105265/1‑91 (MQ=255) atttTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCa < 1:1927134/91‑1 (MQ=255) tttttGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCat < 2:586463/91‑1 (MQ=255) tttttACAAAAAAAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAAATGCGTATAAACAATTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCat > 2:467885/1‑91 (MQ=255) ttttGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCata > 1:837597/1‑91 (MQ=255) ttttGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCata > 2:1698216/1‑91 (MQ=255) gTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCAc < 2:857919/91‑1 (MQ=255) | TTCGCTTTAGATTAGGAATTTAAAATAAATATTTATTAAACATTATGAATTTTTAAAGAGTAATGTCTGACTCGTTGATAATTTATTTTTGTAAAAATAAATTAAAGTAATGACAAAGTTATTGAAGTAAATTGAGTATAAACATTTAAATACGATGTCGAAAATGGCGATAGCATATCAC > USA300TCH1516_ALE/631445‑631625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |