| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 690,098 | A→T | 10.8% | intergenic (‑27/+8) | USA300HOU_RS03320 ← / ← USA300HOU_RS03325 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 690,098 | 0 | A | T | 10.8% | 863.9 / 69.3 | 282 | intergenic (‑27/+8) | USA300HOU_RS03320/USA300HOU_RS03325 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (123/128); new base T (11/20); total (134/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CTTCGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAA > USA300TCH1516_ALE/690008‑690188 | tCGACAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCTCAAt < 1:3122353/91‑1 (MQ=255) cGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATa > 2:3524391/1‑91 (MQ=255) cGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAAT‑AAAATAACCCCAATAg > 2:2858391/1‑91 (MQ=255) gCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAg < 2:2330602/91‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAgg > 1:3428995/1‑91 (MQ=255) cAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAggg < 2:563460/91‑1 (MQ=255) cAGTTTTCGTTAACAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAggg > 1:469067/1‑91 (MQ=255) aGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAgggg < 1:3855885/91‑1 (MQ=255) aGTTTTCGTTAATAACAAATGATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAgggg < 2:3246617/91‑1 (MQ=255) gTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCGTACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGc < 2:622849/91‑1 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:3500223/91‑3 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:41007/91‑3 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:2781796/91‑3 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCt > 1:72198/1‑91 (MQ=255) ttttCGTCAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:1974929/91‑3 (MQ=255) tttCGTTAAGAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtta < 1:3795205/91‑4 (MQ=255) cGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAttt > 2:3002815/1‑91 (MQ=255) ttAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTaa > 2:1570419/1‑91 (MQ=255) ttAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTaa > 2:1916993/1‑91 (MQ=255) aataaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAAt < 2:1617992/91‑1 (MQ=255) ataaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATg > 2:226036/1‑91 (MQ=255) ataaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATg < 1:163103/91‑1 (MQ=255) taaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGt > 2:637359/1‑91 (MQ=255) aaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGtt < 1:2733254/91‑1 (MQ=255) aCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTa < 2:3855705/91‑1 (MQ=255) aaaTTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAtt < 2:2003757/91‑1 (MQ=255) aaTTATCTCTTAGACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttt > 1:3036462/1‑91 (MQ=255) aaTTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttt < 2:1258834/91‑1 (MQ=255) aTTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAtttt < 1:2188858/91‑1 (MQ=255) tctcTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTa > 1:1016683/1‑91 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt < 1:950700/91‑1 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt < 2:1386291/91‑1 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt < 1:114743/91‑1 (MQ=255) tctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATc < 1:3930449/91‑1 (MQ=255) ttAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATTCCTCCAGTAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATcgt < 2:2446301/91‑3 (MQ=255) ttAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCAt > 2:1831387/1‑91 (MQ=255) tAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATg > 2:3493027/1‑91 (MQ=255) tAAACCTGCATACGGTGATTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATg < 1:3389271/91‑1 (MQ=255) aaaCCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGa > 1:1572194/1‑91 (MQ=255) ccTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGatat < 1:1479183/91‑1 (MQ=255) ccTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGatat < 1:810225/91‑1 (MQ=255) ccTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGatat < 2:3704544/91‑1 (MQ=255) cTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATAtt < 1:293840/91‑1 (MQ=255) tGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTc > 1:565041/1‑91 (MQ=255) tGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTc > 1:2171662/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 2:1077707/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:1321591/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:1900173/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:268227/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:2638324/1‑91 (MQ=255) cATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTa < 2:2620501/91‑1 (MQ=255) cATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTa > 2:380048/1‑91 (MQ=255) aTACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTAc > 1:3012633/1‑91 (MQ=255) tACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTAct > 1:3339405/1‑91 (MQ=255) cGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTActtc < 2:2535915/91‑1 (MQ=255) tGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTGTTTATCATGATATTCTACttcttc < 2:3361706/91‑1 (MQ=255) gCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTtca > 1:3652624/1‑91 (MQ=255) gCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTtca > 2:3879841/1‑91 (MQ=255) cTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTtcat < 2:1363572/91‑1 (MQ=255) ttttAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTtcatc < 1:993816/91‑1 (MQ=255) ttAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTcatcat > 1:2053666/1‑91 (MQ=255) tAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATCCTACTTCTTCATCATa > 2:771505/1‑91 (MQ=255) tAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCGATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATa < 1:3138944/91‑1 (MQ=255) aaaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATaa < 2:403610/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc < 1:921566/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc > 2:3068015/1‑91 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc > 2:2605469/1‑91 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc < 2:3222435/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc < 1:1751850/91‑1 (MQ=255) aTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACt < 1:2910849/91‑1 (MQ=255) cATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTaa > 2:2761205/1‑91 (MQ=255) aTGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAt < 1:764027/91‑1 (MQ=255) aTGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACGTAAt > 1:3285843/1‑91 (MQ=255) cATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTaa > 1:3499199/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAAc > 1:1030914/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAAc > 2:678080/1‑91 (MQ=255) cccTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACtt < 2:2195245/91‑1 (MQ=255) cccTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACtt < 2:2084000/91‑1 (MQ=255) cTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACtttt < 2:1745539/91‑1 (MQ=255) tCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTc > 1:2548057/1‑91 (MQ=255) tCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTc > 2:3316027/1‑91 (MQ=255) atttaaaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTCTTCTTaa > 2:232773/5‑91 (MQ=37) aTAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTaa < 1:1376515/91‑1 (MQ=255) tAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAAc < 1:3764952/91‑1 (MQ=255) aaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTg < 2:270991/91‑1 (MQ=255) aaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTg > 1:2475489/1‑91 (MQ=255) aaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTg < 1:2881457/91‑1 (MQ=255) aaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTg > 1:520011/1‑91 (MQ=255) aaaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGc > 2:1789461/1‑91 (MQ=38) aaaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGc > 2:3160829/1‑91 (MQ=39) aTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGcac > 2:1481910/1‑91 (MQ=255) agccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTA‑TTTTTTATCATGATATTCTACTTTTTCATTCTAACTTAATTTTAACTTTCTTCACTGCACAtt > 2:2595483/3‑91 (MQ=255) aaCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAt > 1:325249/1‑91 (MQ=255) gccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt > 1:2092180/2‑91 (MQ=255) gccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATAATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt > 1:1294516/2‑91 (MQ=255) ccccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTa > 1:1413441/1‑91 (MQ=255) ccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaa < 1:362681/91‑1 (MQ=255) cAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaa < 1:3358715/91‑1 (MQ=255) aaTAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaaa < 1:168126/91‑1 (MQ=255) aaTAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaaa > 2:1045223/1‑91 (MQ=255) | CTTCGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAA > USA300TCH1516_ALE/690008‑690188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |