| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 690,101 | A→T | 10.5% | intergenic (‑30/+5) | USA300HOU_RS03320 ← / ← USA300HOU_RS03325 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 690,101 | 0 | A | T | 10.5% | 855.1 / 67.2 | 282 | intergenic (‑30/+5) | USA300HOU_RS03320/USA300HOU_RS03325 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (122/128); new base T (11/19); total (134/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
CGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAACAA > USA300TCH1516_ALE/690011‑690191 | cGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATa > 2:2236333/1‑91 (MQ=255)cGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATa > 1:3039440/1‑91 (MQ=255)cGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATa > 2:3524391/1‑91 (MQ=255) gCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAg < 2:2330602/91‑1 (MQ=255) gCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAg < 1:3471609/91‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCGTTAATTACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCAAGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAgg > 1:3365378/1‑91 (MQ=255) cAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAggg < 2:563460/91‑1 (MQ=255) cAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAggg < 1:3776523/91‑1 (MQ=255) gTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCGTACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGc < 2:622849/91‑1 (MQ=255) gTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGc < 1:3199897/91‑1 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:2781827/91‑3 (MQ=255) ttttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:3500096/91‑3 (MQ=255) ttttCGTCAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAGCCCCTATTggggtt < 1:1974929/91‑3 (MQ=255) tttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCtt > 2:120054/1‑90 (MQ=255) ttCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAt < 2:2754581/91‑1 (MQ=255) cGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAttt > 2:2853952/1‑91 (MQ=255) cGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAttt > 2:3002503/1‑91 (MQ=255) cGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTAttt > 1:3254562/1‑91 (MQ=255) ttAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTaa > 2:1916993/1‑91 (MQ=255) ttAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTaa > 2:1570419/1‑91 (MQ=255) ataaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATg < 1:163103/91‑1 (MQ=255) ataaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATg > 2:226036/1‑91 (MQ=255) taaCAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGt > 2:637359/1‑91 (MQ=255) aaaTTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAtt < 1:738028/91‑1 (MQ=255) aaTTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAttt > 1:3135007/1‑91 (MQ=255) tATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTAtttttt < 1:1561169/91‑1 (MQ=255) tctcTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTa > 1:1016683/1‑91 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAGTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt < 2:1005228/91‑1 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt < 1:114743/91‑1 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt < 1:370470/91‑1 (MQ=255) ctctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAAGTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTAt < 2:1386274/91‑1 (MQ=255) tctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATc < 1:3306417/91‑1 (MQ=255) tctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATc < 1:966325/91‑1 (MQ=255) tctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATc < 1:509005/91‑1 (MQ=255) tctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATc < 1:441295/91‑1 (MQ=255) tctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATc < 1:3939449/91‑1 (MQ=255) ctTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCa > 2:3116862/1‑91 (MQ=255) ttAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATTCCTCCAGTAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATcgt < 2:2446301/91‑3 (MQ=255) ttAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCAt > 2:1831387/1‑91 (MQ=255) aaaCCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGa > 1:3022546/1‑91 (MQ=255) ccTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGatat < 1:1479183/91‑1 (MQ=255) ccTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGatat < 2:3704544/91‑1 (MQ=255) tGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTc < 2:3244201/91‑1 (MQ=255) tGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTc > 2:2799798/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:1321591/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:937622/1‑91 (MQ=255) gCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCt > 1:1900173/1‑91 (MQ=255) cATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTa > 2:380048/1‑91 (MQ=255) tACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATCGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTAct > 1:3339696/1‑91 (MQ=255) cGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTActtc < 2:2535915/91‑1 (MQ=255) cGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTActtc > 2:3875357/1‑91 (MQ=255) ggTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTActtct < 1:3549177/91‑1 (MQ=255) gCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTtca > 2:3879841/1‑91 (MQ=255) tttAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTtcatca < 2:1288646/91‑1 (MQ=255) ttAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTcatcat > 1:2053666/1‑91 (MQ=255) ttAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTcatcat > 2:2156898/1‑91 (MQ=255) tAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATCCTACTTCTTCATCATa > 2:771505/1‑91 (MQ=255) aaaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATACCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATAATGATATTCTACTTCTGCATCATaa > 2:3433627/1‑91 (MQ=255) aaaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATaa < 2:403610/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc < 1:1751850/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAAc < 2:3222435/91‑1 (MQ=255) aTTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACt < 1:2910849/91‑1 (MQ=255) aTGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAt > 1:2615146/1‑91 (MQ=255) aTGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAt > 1:3866910/1‑91 (MQ=255) tGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAtt > 1:276444/1‑91 (MQ=255) gTCATCCCTCCAATAAAAATAACTCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAAttt < 2:3024757/91‑1 (MQ=255) tCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTa < 1:2939536/91‑1 (MQ=255) aTCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAAc > 2:678080/1‑91 (MQ=255) aTCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAAc > 1:1030914/1‑91 (MQ=255) cTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACtttt < 1:574484/91‑1 (MQ=255) cTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACtttt < 1:2638562/91‑1 (MQ=255) cTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACtttt > 1:839781/1‑91 (MQ=255) tCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTc > 1:216277/1‑91 (MQ=255) ccAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCt > 2:2605908/1‑91 (MQ=255) atttaaaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTCTTCTTaa > 2:232773/5‑91 (MQ=37) aTAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTaa < 1:1376515/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACt < 2:2638324/91‑1 (MQ=255) aaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTg < 1:2881457/91‑1 (MQ=255) aaaaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTg > 1:523182/1‑91 (MQ=255) aaaTAGCCCCTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGc > 2:1789461/1‑91 (MQ=38) aaTAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATTATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGca > 2:3273643/1‑91 (MQ=255) tAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGcaca > 1:2704856/1‑91 (MQ=255) aaCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAt > 1:794402/1‑91 (MQ=255) aaCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAt < 1:2214185/91‑1 (MQ=255) gccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt > 1:2092180/2‑91 (MQ=255) gccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATAATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt > 1:1294516/2‑91 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt < 1:2493614/91‑1 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt < 2:1699883/91‑1 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGAACAtt > 2:2603058/1‑91 (MQ=255) aCCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACCTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACAtt < 1:3420454/91‑1 (MQ=255) ccccTATTGGGGTTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTa > 2:1426488/1‑91 (MQ=255) ccccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTa > 1:1413441/1‑91 (MQ=255) cccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaa > 2:3337748/1‑91 (MQ=255) cccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaa > 2:1593587/1‑91 (MQ=255) ccAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaa < 1:362887/91‑1 (MQ=255) cAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaa < 1:3834377/91‑1 (MQ=255) cAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaa < 2:2014749/91‑1 (MQ=255) aaTAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaaa > 2:1045267/1‑91 (MQ=255) aaTAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTaaaaa < 1:168126/91‑1 (MQ=255) aGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAACaa > 2:1498881/1‑91 (MQ=255) | CGCCAGTTTTCGTTAATAACAAATTATCTCTTAAACCTGCATACGGTGCTTTTAAATTCATGTCATCCCTCCAATAAAAATAACCCCAATAGGGGCTATTTAAATGTTATTTTTTTATCATGATATTCTACTTCTTCATCATAACTTAATTTAACTTTTCTTAACTGCACATTAAAAACAA > USA300TCH1516_ALE/690011‑690191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |