Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 722,992 | A→G | 12.0% | I44V (ATA→GTA) | feuB → | Iron‑uptake system permease protein FeuB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 722,992 | 0 | A | G | 12.0% | 574.5 / 63.7 | 216 | I44V (ATA→GTA) | feuB | Iron‑uptake system permease protein FeuB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (83/107); new base G (19/7); total (102/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.05e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.87e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TCCTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTAATTG > USA300TCH1516_ALE/722902‑723082 | tCCTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATta > 1:1870737/1‑91 (MQ=255) tCCTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATta > 1:3918868/1‑91 (MQ=255) tCCTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATta > 1:1025363/1‑91 (MQ=255) cTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATtata > 1:2057766/1‑91 (MQ=255) tataTTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTag < 1:1294794/91‑1 (MQ=255) atatTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATaga < 1:65608/91‑1 (MQ=255) tattatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTagag < 1:2641857/91‑1 (MQ=255) tattatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATagag < 1:1252494/91‑1 (MQ=255) tattatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATagag > 2:3904478/1‑91 (MQ=255) ttatAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGc < 2:1086888/91‑1 (MQ=255) tataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTAGAGGCt < 1:1191451/91‑1 (MQ=255) tataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTAGAGGCt < 1:28123/91‑1 (MQ=255) tataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCt < 1:869494/91‑1 (MQ=255) ataGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTATAATTGTAGAGGCtt < 1:3855707/91‑2 (MQ=255) taGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTAt > 1:2510505/1‑91 (MQ=255) ggTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTAttt > 2:321061/1‑91 (MQ=255) ttAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTa > 2:2787152/1‑91 (MQ=255) tAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTaa < 2:2827652/91‑1 (MQ=255) aaGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAt < 2:3276369/91‑1 (MQ=255) aaGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAt < 1:1773867/91‑1 (MQ=255) aaGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAAt < 1:2763588/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATta > 2:1549826/1‑91 (MQ=255) gTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATta > 1:2406062/1‑91 (MQ=255) tGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAACATTCAAGCCTTTTCACTTATAAAGGCCATTTTTAATTATaa > 1:2655373/1‑91 (MQ=255) tGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACCATTATAGAGGCTATTTTTAATTATaa > 2:2417359/1‑91 (MQ=255) tGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATaa > 1:3773929/1‑91 (MQ=255) tGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATaa > 1:3489509/1‑91 (MQ=255) aTACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATc < 1:506208/91‑1 (MQ=255) ctactaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTa > 1:106404/1‑91 (MQ=255) tactaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAg < 2:3711156/91‑1 (MQ=255) tactaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAg < 2:3847977/91‑1 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc > 1:400037/1‑91 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc < 1:2008872/91‑1 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc < 2:1133835/91‑1 (MQ=255) actaATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGc > 2:122916/1‑91 (MQ=255) aaTCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGCGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCaac > 2:3929477/1‑90 (MQ=255) aTCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATc > 1:1723169/1‑91 (MQ=255) aTCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATc > 1:3759238/1‑91 (MQ=255) tCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCa > 1:2742855/1‑91 (MQ=255) cacaCTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCaa > 2:2897544/1‑91 (MQ=255) cacaCTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCaa < 2:1293723/91‑1 (MQ=255) cTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGc < 1:1738769/91‑1 (MQ=255) cTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGc > 2:2594342/1‑91 (MQ=255) ttatttCTACATTAATAGGTGACGCCAAATTGCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCaaaa < 1:3166113/91‑1 (MQ=255) ttatttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCaaaa > 2:836129/1‑91 (MQ=255) tatttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAc < 1:325012/91‑1 (MQ=255) atttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACGATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAca < 2:3463036/91‑1 (MQ=255) atttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAca < 2:2227921/91‑1 (MQ=255) ttCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcatc < 2:1651922/91‑1 (MQ=255) tCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcatca < 1:1258237/91‑1 (MQ=255) cTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAAcatcat < 2:947629/91‑1 (MQ=255) tACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACatcatc > 1:1300428/1‑91 (MQ=255) tACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACatcatc < 1:1598371/91‑1 (MQ=255) tACATCAAGAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTAGAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACatcatc < 2:3643927/91‑1 (MQ=255) aaTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATgag < 1:2345136/91‑1 (MQ=255) aaTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATgag > 1:1480127/1‑91 (MQ=255) aaTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATgag < 2:528214/91‑1 (MQ=255) aaTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATgag < 1:527317/91‑1 (MQ=255) aaTAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATgag < 2:1007182/91‑1 (MQ=255) tAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGAt < 2:3076804/91‑1 (MQ=255) aGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGAtt > 1:3572474/1‑91 (MQ=255) tGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAgg > 2:771895/1‑91 (MQ=255) gACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGTCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGa > 1:2095736/1‑91 (MQ=255) gACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGa < 1:2118506/91‑1 (MQ=255) gACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGa < 1:2118822/91‑1 (MQ=255) aCGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGAt > 1:1349147/1‑91 (MQ=255) aCGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGAt > 1:1647939/1‑91 (MQ=255) aCGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGAt > 1:700062/1‑91 (MQ=255) aCGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGAt > 1:3342146/1‑91 (MQ=255) aCGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGAt > 2:1614177/1‑91 (MQ=255) cGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGAtt > 2:240007/1‑91 (MQ=255) aaaaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCa < 1:2758498/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCa < 2:2586905/91‑1 (MQ=255) aaaTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAg > 1:2276185/1‑91 (MQ=255) aTTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGaa < 2:1649654/91‑1 (MQ=255) tCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAat < 2:1898479/91‑1 (MQ=255) cAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAata > 2:3303545/1‑91 (MQ=255) cAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTATAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAata > 2:2923807/1‑91 (MQ=255) aaGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAatat < 2:505832/91‑1 (MQ=255) gCCTCTATAATTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATag > 1:3534439/1‑91 (MQ=255) gCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATag > 2:88070/1‑91 (MQ=255) gCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATag > 2:616015/1‑91 (MQ=255) gCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATag < 2:3141816/91‑1 (MQ=255) ccTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagc < 1:2557407/91‑1 (MQ=255) tctATAATTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAACATagcag > 2:2453224/1‑91 (MQ=255) ctataaTTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAATACATCATCAATGAGATTAGGATTCACAGAAATATagcagc > 2:199329/5‑91 (MQ=255) ctataaTTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagcagc > 2:3792064/5‑91 (MQ=255) ctataaTTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagcagc > 1:2592870/5‑91 (MQ=255) ctACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagcagc < 1:1613958/91‑1 (MQ=255) ctACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATagcagc < 2:1724789/91‑1 (MQ=255) aCAATTATCGAGGCTATTTTTAATTAGAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGcagcag < 2:3431629/91‑1 (MQ=255) aCAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGcagcag > 2:3585731/1‑91 (MQ=255) cAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGt < 2:402819/91‑1 (MQ=255) aaTTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTa > 1:3278412/1‑91 (MQ=255) aaTTGTAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTa > 1:59454/1‑91 (MQ=255) aaTTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACACCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTa < 1:665127/91‑1 (MQ=255) aTTGTAGAGGCTATTTCGAATTATAATCCTAGCAATCCACAGCAACACATAATAGATGAGATAAGGATTCCTAGAAATATAGCAGGAGTaa > 2:1427192/1‑91 (MQ=255) ttATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTAAt < 2:774483/91‑1 (MQ=255) tataGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAAAATAGCAGCAGTAAtt > 1:783507/1‑91 (MQ=255) ataGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTAATTg > 2:447393/1‑91 (MQ=255) | TCCTATATTATAGGTTTAAGTATGATACTACTAATCACACTATTTATTTCTACATTAATAGGTGACGCCAAAATTCAAGCCTCTACAATTATAGAGGCTATTTTTAATTATAATCCTAGCAATCAACAGCAAAACATCATCAATGAGATTAGGATTCCCAGAAATATAGCAGCAGTAATTG > USA300TCH1516_ALE/722902‑723082 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |