| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 803,528 | C→T | 20.7% | intergenic (‑228/+42) | USA300HOU_RS03920 ← / ← dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 803,528 | 0 | C | T | 20.7% | 589.1 / 134.3 | 268 | intergenic (‑228/+42) | USA300HOU_RS03920/dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (89/122); new base T (8/48); total (98/170) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.63e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
AGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAT > USA300TCH1516_ALE/803438‑803618 | gTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGCTATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATACACACAAAGTAAGcc > 2:2472390/1‑91 (MQ=255) gTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGcc > 2:1643721/1‑91 (MQ=255) gTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGcc > 1:1910059/1‑91 (MQ=255) gTTATAGCCGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATAAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGcc < 2:3440322/91‑1 (MQ=255) tataGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCAt < 1:3891110/91‑1 (MQ=255) aGCTGTCTATAATGAGCATATTGAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTa < 2:3189192/91‑1 (MQ=255) aGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTa < 2:2098274/91‑1 (MQ=255) aGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTa < 1:950998/91‑1 (MQ=255) aGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATAGCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTa < 2:434186/91‑1 (MQ=255) tGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAAt < 2:572584/91‑1 (MQ=255) cTATAATGTGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTGGAATTTAATTAATAGAATCCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATggc < 2:3692142/91‑3 (MQ=38) cTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGT‑AGCCATTTAAATGACt > 2:1301098/1‑91 (MQ=255) tataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATggct < 1:2054865/91‑4 (MQ=255) tataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAAAAAAAAGAAATTTAAATAAca > 2:3346614/1‑90 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 2:1221517/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 2:1045187/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACtt < 2:2874463/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACtt < 1:1760204/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACtt < 2:1440264/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:402803/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:2872624/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTa < 1:1644622/91‑1 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTAc < 2:189766/91‑1 (MQ=255) aaTCAGCATGTTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTAc < 1:3554370/91‑1 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt > 1:2703874/1‑91 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt > 1:503043/1‑91 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt > 1:212383/1‑91 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTg < 1:3661600/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTg < 1:3037088/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTg < 1:2745393/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTg < 2:1829350/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTGTTATTTATACTGATATCGTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTg < 2:2155934/91‑1 (MQ=37) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATGTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 2:660598/91‑1 (MQ=38) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 1:1070818/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGt < 1:655751/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGt > 1:1454280/1‑91 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGt < 2:3924446/91‑1 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATGTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAACAAAACAGTAAGCCATTTAAAGGACTTACTGt > 2:778855/1‑91 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGtt < 2:827016/91‑1 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtt > 2:535680/1‑91 (MQ=255) gCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGttt < 1:1250485/91‑1 (MQ=255) gCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGttt < 2:3871727/91‑1 (MQ=255) cATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttt > 1:2270554/1‑91 (MQ=255) cATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttt < 2:1200981/91‑1 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGttttt < 2:3839477/91‑1 (MQ=255) atatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGttttt < 2:3051523/91‑1 (MQ=255) atTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTg < 1:2547031/91‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGaa < 1:3476075/91‑1 (MQ=255) aGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAAtt < 1:3858438/91‑1 (MQ=255) gTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTa < 1:3152573/91‑1 (MQ=255) tttttATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAg < 2:2786797/91‑1 (MQ=255) ttttATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAgg > 2:1957055/1‑91 (MQ=255) ttttATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAgg < 2:15000/91‑1 (MQ=255) tatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGACTCCTATAAAACAAAAGTAAGCGATTTACATGACTTACTGTTTTTTGATTTAGGCca > 2:3793225/1‑91 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:3867327/91‑1 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:245286/91‑1 (MQ=255) ataCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAat > 2:2522716/1‑91 (MQ=255) ataCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAat < 1:862085/91‑1 (MQ=255) cTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt < 2:3042412/91‑1 (MQ=255) cTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt < 1:2257001/91‑1 (MQ=255) atatCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAGAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAAc < 2:201279/91‑1 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 1:3802401/1‑91 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 2:1139281/1‑91 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 2:1767100/1‑91 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt < 1:3444718/91‑1 (MQ=255) taattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCa < 2:39902/91‑1 (MQ=255) taattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCa < 2:1076404/91‑1 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCAt < 1:3431753/91‑1 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATc > 1:1497307/1‑91 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATc > 2:649186/1‑91 (MQ=255) taatAGAGACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATAGTAACGTATACCTTTCAgcgc < 2:2224166/91‑1 (MQ=255) aatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCt < 1:3232374/91‑1 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCttt < 2:3578621/91‑1 (MQ=255) aGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCTATTTATATGACTCACTGGATTTTGAATTAGGCAAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg > 2:3170121/1‑91 (MQ=255) aGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg < 1:1628862/91‑1 (MQ=255) aGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg < 1:3842421/91‑1 (MQ=255) aaaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgat < 1:129369/91‑1 (MQ=255) aaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatg < 2:1452381/91‑1 (MQ=255) aaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatg < 2:207610/91‑1 (MQ=255) aCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatga > 1:2955399/1‑91 (MQ=255) ccTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTgatgat < 1:1646490/91‑1 (MQ=255) ataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTaa < 2:1269349/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaCAGTAAGTCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAg < 1:3902227/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 2:3130535/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:602238/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGCTGATTAAAGGt > 2:2179320/1‑91 (MQ=37) aaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt > 1:2354807/1‑91 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt < 1:3774425/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt > 2:102472/1‑91 (MQ=255) aaaaCAGTAAGCCATTTAAATGAATTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTTATCGATTTGATGATTAAAGGTg > 2:1713780/1‑91 (MQ=255) aaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga < 1:2610377/91‑1 (MQ=255) cAGTCAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGCTGATTACAGGTGAGAt > 2:3170923/1‑91 (MQ=255) aaGTAAGCCATTTATAGGTCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAt < 2:332935/90‑1 (MQ=255) gTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg > 1:3215309/1‑91 (MQ=255) gTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg < 1:1152508/91‑1 (MQ=255) gTAACCCATTGAAGTGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTGCATCGCTTTGATGTTTAAAGGTGAGATTg < 2:2513803/91‑1 (MQ=255) tAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 1:1685180/1‑91 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt < 1:719964/91‑1 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTAGACCTTTCATCGCTTTGATGATTATAGGTGAGATTGCt > 2:3229973/1‑91 (MQ=255) aGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTa < 1:2222084/91‑1 (MQ=255) | AGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAT > USA300TCH1516_ALE/803438‑803618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |