Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 1,064,016 | G→A | A158V (GCA→GTA) | ywtF ← | Putative transcriptional regulator YwtF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 1,064,016 | 0 | G | A | 97.5% | 276.2 / ‑2.8 | 81 | A158V (GCA→GTA) | ywtF | Putative transcriptional regulator YwtF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (39/39); total (41/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
AAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATGCTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGCCAACTTTAGGAAT > USA300TCH1516_ALE/1063882‑1064146 | aaGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCa < 1:388081/141‑1 (MQ=255) aGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCat > 4:95296/1‑141 (MQ=255) gCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCata > 2:223886/1‑141 (MQ=255) tcatcaCCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTg < 1:424210/141‑1 (MQ=255) catcaCCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCATGCTCATTTCCAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGa > 2:411278/1‑141 (MQ=255) atcaCCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGAc < 2:439326/141‑1 (MQ=255) tcaCCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGAct > 1:461261/1‑141 (MQ=255) tcaCCATTTAATTTTTGGTACCCTTTGTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGTct < 2:112318/141‑1 (MQ=255) caCCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTTATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGActc > 2:385646/1‑141 (MQ=255) aCCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGActct < 2:608591/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTTTTGTTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTcac < 1:303536/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTcac < 4:80603/141‑1 (MQ=255) tAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACata > 1:165537/1‑141 (MQ=255) tAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACata > 1:165719/1‑141 (MQ=255) aaTTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACataa < 1:79123/141‑1 (MQ=255) tttttGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACataata < 1:417242/141‑1 (MQ=255) tttttGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACataata > 4:241648/1‑141 (MQ=255) ttGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATc < 1:429324/141‑1 (MQ=255) tGGTACCCTTTTTTTTTTTTTTTCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATTCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATTCTTTCATATTTACTCTCACATAATAATCa > 2:471387/1‑141 (MQ=255) tGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCa > 1:162135/1‑141 (MQ=255) aCCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATGCTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAg > 3:196389/1‑141 (MQ=255) cccTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTTACTCTCACATAATAATCAACAgg > 4:298257/1‑141 (MQ=255) ccTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGt < 1:32529/141‑1 (MQ=255) cTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTa < 4:113963/141‑1 (MQ=255) ttttaattttaaTCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACAt < 1:371637/141‑1 (MQ=255) ttttaattttaaTCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACAt > 1:239069/1‑141 (MQ=255) taattttaatCTTACCTGTATTATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATGCTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCa < 2:552053/141‑1 (MQ=255) ttttaatCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACataa < 1:209630/119‑1 (MQ=255) ttttaatCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACataa > 2:209630/1‑119 (MQ=255) ttttaatCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATgg > 1:371582/1‑141 (MQ=255) tttaatCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGt > 3:82931/1‑141 (MQ=255) ttaatCTTACCAGTATCATATGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCGCACATAATAATCAACAGGTACATTCAttctg < 2:653870/141‑5 (MQ=255) atCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCt < 2:496634/141‑1 (MQ=255) ttACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCt > 4:105447/1‑141 (MQ=255) tACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCtc > 3:256518/1‑140 (MQ=255) gaCCAGTATCATCTGGGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGTGACATTCATGGTAGCTTTTa > 4:138601/2‑141 (MQ=255) aCCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTAc < 1:446358/141‑1 (MQ=255) cAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCg < 1:337161/141‑1 (MQ=255) atcatcTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATc > 1:172001/1‑141 (MQ=255) tcatcTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATcc > 1:231517/1‑141 (MQ=255) tcTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCAtt < 3:124668/141‑1 (MQ=255) tgtTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAGCAGGTACATTCATGCTAGCTTCTACCGAATCCCTTGCgg < 2:257961/141‑1 (MQ=255) ttAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCa > 1:395342/1‑141 (MQ=255) aGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATGATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAAt < 2:364934/141‑1 (MQ=255) gTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTg < 2:461261/141‑1 (MQ=255) ttCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTgg > 4:178748/1‑141 (MQ=255) ttCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTgg < 3:83018/141‑1 (MQ=255) ttCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACAAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTgg < 1:536469/141‑1 (MQ=255) cATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGac < 2:657222/141‑1 (MQ=255) aTTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGacc < 3:230826/141‑1 (MQ=255) tttAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGacca > 2:264369/1‑141 (MQ=255) aGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGAccacca > 3:88606/1‑140 (MQ=255) aGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGAccacca < 4:88606/140‑1 (MQ=255) aGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCat > 2:259803/1‑141 (MQ=255) cGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATAtg < 1:467560/141‑1 (MQ=255) gTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATAtgc > 3:93044/1‑141 (MQ=255) tATGGCACATCATATTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCACGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATAtgca < 2:264481/141‑1 (MQ=255) tATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATAtgca > 4:218957/1‑141 (MQ=255) tATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATAtgca < 3:95296/141‑1 (MQ=255) acaTCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGAGCCACCAGAtgcatgtgca > 1:393161/1‑141 (MQ=255) atcatAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATGTTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATAtgcatgtgcatg > 3:234093/1‑141 (MQ=255) atAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGt < 1:674605/141‑1 (MQ=255) gTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAAt > 2:367712/1‑141 (MQ=255) tGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTAt > 2:394156/1‑141 (MQ=255) ccaccaAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTa > 3:140089/1‑67 (MQ=255) ccaccaAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTa < 4:140089/67‑1 (MQ=255) ccaccaAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCg > 4:170196/1‑141 (MQ=255) ccaccaAGCTCATTTACAGCCTAGACAAATAATTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCTATTGCGGCAATTGGACTACCATATGCATGTGCATGGGTAATATTATCg > 4:44294/1‑141 (MQ=255) aGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGa > 1:306211/1‑102 (MQ=255) aGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGa < 2:306211/102‑1 (MQ=255) aGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAg < 3:38912/141‑1 (MQ=255) aGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAg < 2:269341/141‑1 (MQ=255) aGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAg > 4:166811/1‑141 (MQ=255) aGCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAg < 2:64297/141‑1 (MQ=255) gCTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGc > 4:7254/1‑141 (MQ=255) cTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGcc > 1:200224/1‑141 (MQ=255) cTCATTTACAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGcc < 2:606962/141‑1 (MQ=255) cAGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGCCAACTTTAg < 2:656617/141‑1 (MQ=255) aGCCTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGCCAACTTTAgg < 3:281601/141‑1 (MQ=255) cTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGCCAACTTTAGGAAt > 1:617355/1‑141 (MQ=255) cTCGACAAATACTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGCCAACTTTAGGAAt > 1:446235/1‑141 (MQ=255) | AAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTATCATCTGTGTTAGGTTCATTTAAGTCGTATGGCACATCATAGTATATGCCACCAAGCTCATTTACAGCCTCGACAAATGCTTTCATATTGACTCTCACATAATAATCAACAGGTACATTCATGGTAGCTTCTACCGAATCCATTGCGGCAATTGGACCACCATATGCATGTGCATGGGTAATCTTATCGTAATAGCCAACTTTAGGAAT > USA300TCH1516_ALE/1063882‑1064146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |