| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 382471 = | 92 (1.020) | 4 (0.050) | 4/256 | 13.4 | 4.4% | intergenic (+4/+89) | USA300HOU_RS01745/ulaA | UDP‑glucose 4‑epimerase/Ascorbate‑specific PTS system EIIC component |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 382543 = | 89 (1.070) | intergenic (+76/+17) | USA300HOU_RS01745/ulaA | UDP‑glucose 4‑epimerase/Ascorbate‑specific PTS system EIIC component | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTGCGACACAAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCGACAG > USA300TCH1516_ALE/382403‑382681 | ttGCGACACAAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTta < 4:129382/141‑1 (MQ=255) gCGACACAAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTtata < 2:208707/141‑1 (MQ=255) cGACACAAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTatat > 1:29211/1‑141 (MQ=255) agACACAAGAAGAAGTAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTatat < 3:244246/140‑1 (MQ=255) cacaAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTc < 1:659086/141‑1 (MQ=255) cacaAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTc < 3:14741/141‑1 (MQ=255) cacaAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGGCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTc > 1:410332/1‑141 (MQ=255) acaAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCt < 1:227588/141‑1 (MQ=255) agaagCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTTACGGTGTTTTATATTTCTACGtaa > 2:507806/1‑139 (MQ=255) agaagCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGttt > 4:214480/1‑140 (MQ=255) agaagCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTa > 3:220099/1‑141 (MQ=255) agaagCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTa < 1:281428/141‑1 (MQ=255) gCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAacac > 2:334601/1‑141 (MQ=255) tttAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTg < 1:360364/141‑1 (MQ=255) tAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCt < 1:470644/141‑1 (MQ=255) tAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCt > 2:369202/1‑141 (MQ=255) gcagcTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGt > 1:298884/1‑141 (MQ=255) gcagcGGTCGATGGTATGGCTAAGTATCATTTAATAGAAGACGAAACAGCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATGTGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCGGt > 4:62005/1‑141 (MQ=255) agcTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTc < 1:284667/141‑1 (MQ=255) agcTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTc > 2:129146/1‑141 (MQ=255) agcTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTc > 1:481038/1‑141 (MQ=255) agcTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTc < 1:284670/141‑1 (MQ=255) gATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGa < 2:125259/141‑1 (MQ=255) aTAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGAc < 3:65424/141‑1 (MQ=255) aTAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGAc < 1:7846/141‑1 (MQ=255) gTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGc > 4:129882/1‑141 (MQ=255) tATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGTGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGcc > 1:477214/1‑141 (MQ=255) tGGCTCAGTATCATTTAATATAATACGAACGACTTCCCGCAAGTAATGTGCTGTCCTCTTGAGAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCtt < 1:132388/141‑1 (MQ=255) tGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTTTCGTCCtt > 4:232624/1‑141 (MQ=255) tGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGCCGGCCtt > 2:197868/1‑141 (MQ=255) tGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGATGTTCTTTTTGACGGCCtt > 1:518365/1‑141 (MQ=255) ggCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCttt < 3:147429/141‑1 (MQ=255) gTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTtaataa > 2:314799/1‑141 (MQ=255) tATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATaaa < 1:399532/141‑1 (MQ=255) tATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATaaa < 2:45140/141‑1 (MQ=255) tCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAAt > 1:184350/1‑141 (MQ=255) cATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAAtt > 3:169150/1‑141 (MQ=255) cATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAAtt > 3:245532/1‑141 (MQ=255) aTTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAAttg < 4:217976/141‑1 (MQ=255) taatataataCAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAAttgttg < 1:221216/141‑1 (MQ=255) tataataCAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCg < 1:488384/141‑1 (MQ=255) ataCAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGTTTGCCTTTTAATAAAATTGTTTTCGCTcc > 2:618143/1‑141 (MQ=255) ataCAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCAcc < 3:200348/141‑1 (MQ=255) ataCAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCAcc > 3:36184/1‑141 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cATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCGCTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATaataaa < 3:248458/141‑1 (MQ=255) aTAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGTGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATaataaat < 2:458555/141‑1 (MQ=255) aTAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATaataaat < 2:68106/141‑1 (MQ=255) taagtaagTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATaataaata < 1:654001/141‑1 (MQ=255) taagtaagTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATaataaata < 2:52621/141‑1 (MQ=255) aagtaagtGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAg < 2:546900/141‑1 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gATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCa > 3:116144/1‑141 (MQ=255) gATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCa > 3:22700/1‑141 (MQ=255) gATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCa > 1:276279/1‑141 (MQ=255) aTAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCat < 2:1948/141‑1 (MQ=255) aaaGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCatata < 2:505134/141‑1 (MQ=255) aaGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCatatat > 2:34297/1‑141 (MQ=255) aaGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCatatat > 2:613245/1‑141 (MQ=255) ggggCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATAttt < 3:99442/141‑1 (MQ=255) tCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCg < 2:281823/141‑1 (MQ=255) cACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGt < 2:528531/141‑1 (MQ=255) cTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTa > 1:389290/1‑141 (MQ=255) cTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTa > 2:264022/1‑141 (MQ=255) aaTACGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCg > 2:431159/1‑141 (MQ=255) atatGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGa > 2:664297/1‑141 (MQ=255) tatGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGaa > 1:614798/1‑141 (MQ=255) atGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAac > 2:425038/1‑141 (MQ=255) gtgACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAacac > 1:600985/1‑141 (MQ=255) gtTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCGa < 1:385679/141‑1 (MQ=255) ttttATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCGAc > 2:452441/1‑141 (MQ=255) ttttATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCGAc > 1:621409/1‑141 (MQ=255) ttttATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCAAc < 2:61769/141‑1 (MQ=255) ttATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCGACAg < 1:410482/141‑1 (MQ=255) ttATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCGACAg < 2:116866/141‑1 (MQ=255) | TTGCGACACAAGAAGAAGCAATTTTAGCAGCTGTCGATAGTATGGCTAAGTATCATTTAATATAATACAAAACACCGTCCATAAGTAAGTGGCTTTCCTCTTGATAAAAGGGGCATTCACTCAATATGTGACGGTGTTTTATATTTCTACGTTAACACTATTGCTGTTCTTTTTGACGGCCTTTTAATAAAATTGTTGTCGCACCTACGATAATAATAAATAGAATCGCACCAAATAATCCCATATATTTTACTGCGTTACCGAACACGATACCGACAG > USA300TCH1516_ALE/382403‑382681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |