| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2640242 = | 95 (1.050) | 3 (0.040) | 3/258 | 14.3 | 3.2% | intergenic (‑94/+60) | rspR/zntR | HTH‑type transcriptional repressor RspR/HTH‑type transcriptional regulator ZntR |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2640290 = | 92 (1.100) | intergenic (‑142/+12) | rspR/zntR | HTH‑type transcriptional repressor RspR/HTH‑type transcriptional regulator ZntR | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGTCACTCCTTCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCTGTATGTTT > USA300TCH1516_ALE/2640152‑2640430 | aGTCTCTCCTTCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATcac < 1:411501/141‑1 (MQ=255)aGTCACTCCTTCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATcac < 2:101952/141‑1 (MQ=255)aGTCACTACTTCATTACACGACATTCTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTATATTTAAAGGAAATGGTCACTATcac < 2:219474/141‑1 (MQ=255) gTCACTCCTTCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATcaca < 4:251919/141‑1 (MQ=255) tCACTCCTTCGTTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCacac < 2:673173/141‑1 (MQ=255) ccTCCTTCTTTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGa < 1:110826/140‑1 (MQ=255) aCTCCTTCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGa < 2:377076/141‑1 (MQ=255) tCCTTCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGGCCGTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATGTAGAGGAAATGGTCACTATCACACGAAt > 2:407498/1‑141 (MQ=255) ttCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGaa > 2:503363/1‑140 (MQ=255) ttCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGAt < 2:578094/141‑1 (MQ=255) tCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAattatt > 2:598665/1‑141 (MQ=255) acacGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAAtt > 1:192703/1‑141 (MQ=255) acGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGt > 1:82935/1‑141 (MQ=255) acGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGt > 3:13194/1‑141 (MQ=255) cGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGtt < 1:512725/141‑1 (MQ=255) cATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTAtg > 4:253612/1‑141 (MQ=255) cTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTAtgttgt > 4:220080/1‑141 (MQ=255) cTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCACTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTAtgttgt < 1:32766/141‑1 (MQ=255) ttGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTa > 2:636363/1‑141 (MQ=255) ttGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTa > 2:543818/1‑141 (MQ=255) tGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAATGTAATGGTCACTATCCCACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTAt < 2:240654/141‑1 (MQ=255) gTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTAtg > 1:283508/1‑141 (MQ=255) gTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTAtg > 3:159119/1‑141 (MQ=255) tataCAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTAtgt > 1:163150/1‑141 (MQ=255) taCAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTgg > 3:45005/1‑141 (MQ=255) cAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGa > 3:239992/1‑141 (MQ=255) cAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGa < 1:280460/141‑1 (MQ=255) cAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGa < 2:286809/141‑1 (MQ=255) cAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGa < 4:203352/141‑1 (MQ=255) aGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGata > 1:185177/1‑141 (MQ=255) tGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTc > 2:667326/1‑141 (MQ=255) gTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCt > 3:204622/1‑141 (MQ=255) ttAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTa < 1:207165/141‑1 (MQ=255) aaTATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAAt > 2:275378/1‑141 (MQ=255) atatAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAAtt < 1:524280/141‑1 (MQ=255) tataGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTg > 2:82945/1‑141 (MQ=255) gTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCt > 4:284298/1‑141 (MQ=255) gTTATTAAGAGATTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACAAATGATTTAATTGTTATGATGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCt > 2:555251/1‑141 (MQ=255) ttattaTGAGTTCGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTGTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCCCTATCCCACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTg < 2:402741/141‑1 (MQ=255) tattatGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGt > 3:92641/1‑141 (MQ=255) atGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTc > 1:379505/1‑141 (MQ=255) tGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTAATCa > 1:178073/1‑141 (MQ=255) gAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCat > 2:460914/1‑141 (MQ=255) aGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCata > 2:422934/1‑141 (MQ=255) gTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCatat > 1:416007/1‑141 (MQ=255) tttGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATg < 4:275880/141‑1 (MQ=255) gCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTTTGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATgcgc > 1:506162/1‑141 (MQ=255) gCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATgcgc < 4:106237/141‑1 (MQ=255) cAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTATAGTAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCt < 2:664124/141‑1 (MQ=255) aaGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCtt < 2:449179/141‑1 (MQ=255) aaGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCtt < 1:510266/141‑1 (MQ=255) cgcTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAg > 1:447713/1‑141 (MQ=255) cgcTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAACGGCATCGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAg < 1:525420/141‑1 (MQ=255) gcTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAgg < 1:433059/141‑1 (MQ=255) gcTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTAATCATATGCGATTTAgg > 2:607813/1‑141 (MQ=255) ctttctttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGt < 1:638324/141‑1 (MQ=255) ctctctttACGAGCACTACAATATTGCCCAACTCTTTGCAGATGT‑TATTGAAAAAAAATTCACACGAGCACACGAATGATTTAATTGTGATGTTGTATGTGGTATATTTCTAAATGTTCGGTACTCATATGCGCTTTAGGt < 3:188928/138‑1 (MQ=255) tttctttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTa > 2:656793/1‑141 (MQ=255) tctttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACt < 1:317424/141‑1 (MQ=255) ctttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACtt > 2:350935/1‑141 (MQ=255) ctttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAAT‑GTCACTATCACACGAATGATTTAACTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTc > 2:663330/1‑141 (MQ=255) tttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑TTTTTATTTTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTc > 4:274009/1‑141 (MQ=255) tttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTGTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTc > 2:293068/1‑141 (MQ=255) ttACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCa > 1:650888/1‑141 (MQ=255) tACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCaa < 3:253051/141‑1 (MQ=255) cGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATg < 1:327278/141‑1 (MQ=255) gAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGc > 2:33986/1‑141 (MQ=255) gAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGc > 1:239921/1‑141 (MQ=255) atcACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTTTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCa < 4:53317/139‑1 (MQ=255) cTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCaataa > 4:64496/1‑141 (MQ=255) cTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCaataa > 1:358829/1‑141 (MQ=255) aaaaTAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAAGGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATg > 1:173130/1‑141 (MQ=255) aaTAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCg > 3:73722/1‑141 (MQ=255) aaTAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCg > 2:668897/1‑141 (MQ=255) aGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGttt > 3:15197/1‑141 (MQ=255) gACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCAt < 2:163150/141‑1 (MQ=255) accaccCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATg > 1:370165/1‑141 (MQ=255) ccaccCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCaataa > 3:137080/1‑129 (MQ=255) ccaccCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCaataa < 4:137080/129‑1 (MQ=255) ccaccCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGa < 2:343181/141‑1 (MQ=255) ccaccCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGa > 4:268022/1‑141 (MQ=255) accCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACa < 4:271844/141‑1 (MQ=255) tttC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTgg < 1:639055/141‑1 (MQ=255) atttaaatttaaAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTTGTGTCTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACAtt > 1:519638/1‑141 (MQ=255) atttaaaGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATc < 1:462597/141‑1 (MQ=255) taaaGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGAc < 3:141146/141‑1 (MQ=255) aaaGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACg > 1:128754/1‑141 (MQ=255) aaaGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACg > 2:162251/1‑141 (MQ=255) aaaGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACg > 2:134365/1‑141 (MQ=255) aaGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACgt > 2:458982/1‑141 (MQ=255) aaGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGGATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACgt > 4:122001/1‑141 (MQ=255) aaTGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGtgttgt < 1:16736/141‑1 (MQ=255) gTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCt > 2:542520/1‑141 (MQ=255) tCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCTg > 3:259855/1‑141 (MQ=255) aCTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCTGTa > 2:24561/1‑141 (MQ=255) aCTATCACACGAATGATTTAATTGTGATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCTGTa > 2:352955/1‑141 (MQ=255) cTATCACACGAATGATTTGATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCTGTAt < 4:71781/141‑1 (MQ=255) cacaCGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCTGTATGttt < 3:235929/141‑1 (MQ=255) cacaCGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTAGGACATTCGAATCGAAGTCTTGTCGCTGTATGttt > 1:438993/1‑141 (MQ=255) | AGTCACTCCTTCATTACACGACATACTTGTATACAAGTATGTTAATATAGTTATTATGAGTTTGCAAGCGCTTTCTTTACGAGCACTAAAATAGTGACCACCCCTTTTC‑GATTTAAATTTAAAGGAAATGGTCACTATCACACGAATGATTTAATTGTTATGTTGTATGTGGGATATTTCTAATTGTTCTGTACTCATATGCGCTTTAGGTACTTCAATGCAATAATGCGTTTCATGACAGTTTGGACATTCGAATCGACGTGTTGTCGCTGTATGTTT > USA300TCH1516_ALE/2640152‑2640430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |