| Predicted mutation | ||||||
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| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,279,705 | G→A | A943V (GCA→GTA) | ebh_3 ← | Extracellular matrix‑binding protein ebh |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 2,279,705 | 0 | G | A | 97.1% | 315.8 / NA | 106 | A943V (GCA→GTA) | ebh_3 | Extracellular matrix‑binding protein ebh |
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTATCAGTTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTGCTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGT‑G‑TTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTGTTGCAT > USA300TCH1516_ALE/2279561‑2279846 | ttATCAGTTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTGGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACtt > 1:137556/1‑147 (MQ=255)ttATCAGTTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACtt > 1:347058/1‑147 (MQ=255)ttATCAGTTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACtg > 1:666118/1‑148 (MQ=255) tCAGTTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCTTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAACTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTCGCTGATGTTACtgttg < 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aGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTGTTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCGGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGct > 1:906272/1‑147 (MQ=255) aGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCGTTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTTTTTCACCTGTTGCCGCa > 1:228273/1‑148 (MQ=255) aGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCTCCTGTTGCCGct > 2:929806/1‑147 (MQ=255) aGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCa > 1:784296/1‑148 (MQ=255) aGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCa < 2:398560/148‑1 (MQ=255) 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gTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGT‑G‑TTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTg > 2:197625/1‑148 (MQ=255) tGCTGATGTTCCTTTTGTTTCACGTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGT‑G‑TTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTGtt < 2:533540/148‑1 (MQ=255) gCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGT‑G‑TTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTGTTg < 1:809284/148‑1 (MQ=255) cTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGT‑G‑TTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGTATTTGCTGTTGc > 2:575279/1‑148 (MQ=255) cTGATGTTACTGTTATTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGT‑G‑TTGTCGGAGAGGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTGTCAGGTAAGTTAGGGTGGCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCGTTTGc > 2:232325/1‑148 (MQ=255) 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gATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTCTTTGGT‑G‑TTGTCGGAGCAGCGTCTGCTTTGCGATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGGTTTCCAGTATTTTGTGGTGTGGCGTTAGCATTTGGATTTGCTGTTGcat > 1:49138/1‑148 (MQ=255) | TTATCAGTTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACACTAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTGCTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGT‑G‑TTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTGTTGCAT > USA300TCH1516_ALE/2279561‑2279846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |