| Predicted mutation | ||||||
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| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,330,093 | T→A | G414G (GGT→GGA) | glpD → | Aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 1,330,093 | 0 | T | A | 98.9% | 576.4 / ‑5.7 | 184 | G414G (GGT→GGA) | glpD | Aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (99/82); minor base C (1/1); total (100/84) | |||||||||||
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Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
TCAGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCAGGTGGCGATGTAGGTGGTAGCAAGAACTTTGATGCGTTTGTAGAGCAAAAAGTAGATGTAGCTAAAGGATTCGGCATTGATGAAGATGTTGCAAGACGTTTAGCATCTAAATATGGTTCAAATGTTGATGAATTGTTCAACATTGCGC > USA300TCH1516_ALE/1329947‑1330238 | acAGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCaggagg < 2:1025262/148‑1 (MQ=255) cAGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCAGGAGGc < 1:158587/149‑1 (MQ=255) aGGTTTATTAACTATTGCAGGTGGTAAATTAACAGGCTATCGTCACATGGCTCAAGACAT‑TGTTGATTTAGTATCTAAACGCTTGAAAAAAGACTACGGTTTAACATTTAGTCCATGTAATACAAAAGGTCTGGCAATTTCAGGAGGCg < 2:1953559/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |