| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2551423 | 94 (0.880) | 3 (0.030) | 3/250 | 12.9 | 3.7% | intergenic (‑367/+85) | bioD1/USA300HOU_RS13150 | ATP‑dependent dethiobiotin synthetase BioD 1/putative ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2555628 | 71 (0.750) | intergenic (‑599/+270) | irtA/yfdG | Iron import ATP‑binding/permease protein IrtA/Prophage bactoprenol‑linked glucose translocase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTTAATAAAAAGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATAAAGTCTTGATACATTC > USA300TCH1516_ALE/2551283‑2551563 | cTTAATAAAAAGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTAt < 1:953069/141‑1 (MQ=255)cTTAATAAAAAGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTAt < 1:364762/141‑1 (MQ=255)cTTAATAAAAAGACATCCTAGCTTTACCAAACTTTTTAACAATCCATTAATTGAAAGATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTAt > 2:850299/1‑141 (MQ=21) taataaAAAGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTCATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCACCTCACTATTg > 2:593820/1‑141 (MQ=255) actaaAAAGACATCCTAGCTTTACCATCTTCTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAACGCTCTAATTCGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGc < 2:885672/139‑1 (MQ=255) ataaAAAGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTAGATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCGCTCACTAtggca < 1:849766/141‑5 (MQ=255) tgaaaaGACATCCTAGCCTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAAAATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGcac > 2:1170890/3‑139 (MQ=255) aaaaaGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATTTAAATACACCAATTCCCCTCACTATTGCCCt > 1:1097732/1‑141 (MQ=255) aaaaaGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCt > 1:167120/1‑141 (MQ=255) aaaaaGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCACCTCACTATTGccat > 2:290166/1‑139 (MQ=255) aaGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGt < 2:67379/141‑1 (MQ=255) aCATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAACTGAACTTCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAg < 2:906859/141‑1 (MQ=255) aTCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAggg < 2:70645/141‑1 (MQ=255) ccTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGa > 2:1056140/1‑141 (MQ=255) ccTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGa > 2:341934/1‑141 (MQ=255) cTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTTTTGCCCTGGTGAGGGGat > 1:529984/1‑141 (MQ=255) cTAGCTTAACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAggggtt > 1:765932/1‑139 (MQ=255) tAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGatt > 1:273141/1‑141 (MQ=255) aGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGattt > 1:327257/1‑141 (MQ=255) gCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGattta > 2:415596/1‑141 (MQ=255) cATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACTCCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCt < 2:734973/141‑1 (MQ=255) cATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCt < 2:734971/141‑1 (MQ=255) aTCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTg > 1:1001984/1‑141 (MQ=255) tCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGt < 1:367494/141‑1 (MQ=255) tgAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGAtt < 1:1154164/141‑1 (MQ=255) tgAAACAATCCAGTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGAGATTTATTTTGCTGTTGAtt < 1:1195798/141‑1 (MQ=255) aaaCAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATtat > 2:548971/1‑141 (MQ=255) ccATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCAc > 2:132838/1‑141 (MQ=255) aTTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTCTTTTGCTGTTGATTATCTATCAccc > 2:322752/1‑141 (MQ=255) aTTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCAccc < 1:1017648/141‑1 (MQ=255) aTTGTAATATTAGGGTTGGCGGCTTGTTTATCAATGTTATAATTAGTTACATAATAAATTGGACATCTTAGTACTCCAAAATCCCTTACTTTTGTCCTAGGGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCCCCCtttt < 2:734560/141‑1 (MQ=255) gagatgaCGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTAttt < 2:1073902/135‑1 (MQ=255) tatTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTcc < 1:713103/141‑1 (MQ=255) tagtACGTTGAGCGCCTTGTTAATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACAATTGCCCGAGTGAGAGGATGTATGTTGCTGTTGAATATATATCACCCTTTTTATTTcc > 2:309522/4‑141 (MQ=18) atTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAGTTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTGTTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTGTTTcta > 1:117130/1‑139 (MQ=255) atTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCa < 1:839342/141‑1 (MQ=255) ttACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTAATGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCaa > 2:793656/1‑141 (MQ=255) cttttaGCGCCTTGTCCATCAATGCCATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGTGATTTATTTTGCTGTTGGTTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAAtt < 2:646649/136‑1 (MQ=18) cGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAAtt > 2:395179/1‑141 (MQ=255) gAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGa < 2:963517/141‑1 (MQ=255) cgcCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTc < 2:196693/141‑1 (MQ=255) cgcCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTc > 2:1079776/1‑141 (MQ=255) cgcCTTGTTCATCAATCCTATTATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAATGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATGCCCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTc > 1:618483/1‑141 (MQ=21) gcCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTcc < 2:327257/141‑1 (MQ=255) gcCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTcc > 1:1013001/1‑141 (MQ=255) gcCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTcc < 1:850299/141‑1 (MQ=255) gcCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTcc > 1:211331/1‑141 (MQ=255) gcCTTGTTCATCAATGCTATAATGAGTTACATAATAAATTGAACATCTAGATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTcc < 2:293853/141‑1 (MQ=255) cTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCat < 1:132838/141‑1 (MQ=255) ttGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCata > 1:253483/1‑141 (MQ=255) catcgATGCTATACTTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAACTCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTCATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGCTTCCATATCaaa < 2:288142/141‑1 (MQ=21) tcaATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATTTTAAACt > 2:418801/1‑141 (MQ=255) aTGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTTTTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACtttt > 2:647467/1‑141 (MQ=255) gTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACCATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAATTATTATTTATAATTTc < 1:597191/141‑1 (MQ=255) aCATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAg < 2:701542/141‑1 (MQ=255) cATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCACATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTACAGc < 1:861536/141‑1 (MQ=255) cATAATAAATTGAACAGCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGc < 2:15192/141‑1 (MQ=255) taataaATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAGTTTCCCGCct > 2:32301/1‑141 (MQ=255) aataaATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCctg < 1:395179/141‑1 (MQ=255) aaaTTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTTAGTGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCctgctg > 1:527310/1‑141 (MQ=255) aaTTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTTACGATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCctgctgt > 1:1197763/1‑140 (MQ=255) aTTGAACATGTAAGTTCTCCACATCCCCGCCCTATGGCCCTCGTGAGGGGAGTTCTTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGAt < 2:645435/141‑1 (MQ=255) aTTGAACATCTAAATACACCGAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGAt > 2:656775/1‑141 (MQ=255) aTTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGAt < 2:977632/141‑1 (MQ=255) aTTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGAt > 2:387731/1‑141 (MQ=255) aTTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGGGAGAGGATTTATTTTGCTGATGATTATCTATCACCCTTGTTATTTCCAAATTCTGATTCCCTATTAAACTATTATTTATAATTTCAAGCcttgtgct > 2:5377/1‑135 (MQ=37) ttGAACATCTAAATACACCAAATCCCCACACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGAtt < 1:290166/141‑1 (MQ=255) tGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTCTCCGTACATAAGCCGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGAttt > 1:226397/1‑141 (MQ=25) tGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTAAGGGGATTTATTTTGCTGTTGCTGATCTATCAGACGTTTCATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAACCTATTATTCATAATTTCCACCCTGCTGCttt > 1:278286/1‑141 (MQ=25) aacaacTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTAc > 1:817835/1‑141 (MQ=255) aaCATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTAc < 1:341934/141‑1 (MQ=255) aaCATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCACCCTGCTGATTTAc > 2:133278/1‑141 (MQ=255) aCATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCAGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACt > 1:1164649/1‑141 (MQ=255) cATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACtt < 1:1114052/141‑1 (MQ=255) aaTACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCACATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTAtt > 2:786794/1‑141 (MQ=255) aaTACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTAtt > 2:786848/1‑141 (MQ=255) aaTACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTAtt < 2:365063/141‑1 (MQ=255) aaTACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTAtt > 2:69313/1‑141 (MQ=255) tACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCt < 1:79416/141‑1 (MQ=255) tACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCt < 1:651729/141‑1 (MQ=255) tACACACAAGCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTTATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCt < 2:1168353/141‑1 (MQ=255) tcgtcAAATCTCCTCGCTGTTGCCCTTGTGATGTGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCTAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCtt < 2:672873/137‑1 (MQ=255) actccAACTCCCCTTCCTATTGCCCTAGTGCGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCtt < 2:374939/138‑1 (MQ=255) acacCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCtt < 1:369513/141‑1 (MQ=255) acCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTATTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCGAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTtat > 1:836452/1‑141 (MQ=255) ccAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTtata < 2:751899/141‑1 (MQ=255) ccAAATCCCCTCACTATTGCCCAAGTGAGGGGATCTATATTGCTATTGATTACCTACCAACCTTTTAATTTCACCATTCTGATTACCCATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTtata > 2:587656/1‑141 (MQ=255) aaTTCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAGACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATAAAg > 2:798435/1‑141 (MQ=255) tCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCAAATTAGACGATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTGTTCTTATAAAGTc > 1:1185315/1‑141 (MQ=255) tCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGAATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATAAAGTc > 2:747561/1‑141 (MQ=255) ccccTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATACAGTCt > 1:371045/1‑141 (MQ=255) cccTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGGTTTATTTTGCTGTTGATTATCTATACCTCTTCTTATTTCCAAATTCTGATTCCATCTTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGGTTTCCTTTTTATTCTTTTaaggcttt > 1:521806/1‑135 (MQ=255) cccTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATAAAGTCtt > 1:316857/1‑141 (MQ=255) cccTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATGATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATAAAGTCtt < 2:411845/141‑1 (MQ=255) cccTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTACTGTTGATTATCTGTCACCCTTTTAACATCCAAATTCTGATTCCATCTTAAACTTTTATTCTAAAATACCAGCTGGCTGATTTACATTTTTTTCTTATaaatccat > 2:678911/1‑136 (MQ=255) cccTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTCGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCAGACTTACTTTTTATTCTTATACACTCtt > 2:614666/1‑141 (MQ=255) aCTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTAGTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTGCAAATTCTGATGCCATATTAAACTATTCTGTGTAGTTTACAGCCTGCTGATTTGCTGTTTATTCTTGTAAAGTCTTGATAc > 1:584440/1‑141 (MQ=255) ttGCCCTAGTGAGGTGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATAAAGTCTTGATACATTc < 2:273141/141‑1 (MQ=255) | CTTAATAAAAAGACATCCTAGCTTTACCATCTTGTGAAACAATCCATTAATTGTAATATTACGTTGAGCGCCTTGTTCATCAATGCTATAATTAGTTACATAATAAATTGAACATCTAAATACACCAAATCCCCTCACTATTGCCCTAGTGAGGGGATTTATTTTGCTGTTGATTATCTATCACCCTTTTTATTTCCAAATTCTGATTCCATATTAAACTATTATTTATAATTTCCAGCCTGCTGATTTACTTTTTATTCTTATAAAGTCTTGATACATTC > USA300TCH1516_ALE/2551283‑2551563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |