| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 36148 = | NA (NA) | 4 (0.040) | 4/268 | 12.7 | 5.0% | coding (404/675 nt) | USA300HOU_RS00140 | hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 76632 | 80 (0.750) | intergenic (+172/‑444) | USA300HOU_RS00140/USA300HOU_RS00350 | hypothetical protein/Monoacylglycerol lipase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAATACAGCAA > USA300TCH1516_ALE/76492‑76772 | tGATGCAGAGGGATTTACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGt > 1:664662/1‑141 (MQ=17)tGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGt > 2:273103/1‑141 (MQ=32)tGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGCCACCTTTAACGAAGGt > 2:147499/1‑141 (MQ=17)tGATGCAGAGGGATATACATAAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATAAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGt < 1:944675/141‑1 (MQ=17) gATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTa < 1:128646/141‑1 (MQ=32) agagGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAAt < 2:442996/141‑1 (MQ=32) ggggATAGACATTAGATATGTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATgg < 2:8929/140‑1 (MQ=17) gggATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGc > 1:138177/1‑141 (MQ=32) gggATATACATTAGATATCTGCTTGCCTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATggt < 2:719048/141‑2 (MQ=9) gggtataCTTTATATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCCTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGTTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCt < 2:510151/138‑1 (MQ=11) ggATATACTTTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCt < 2:683493/141‑1 (MQ=17) agaaaTAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGAc < 1:44083/137‑1 (MQ=1) aTAAGCATTCAGCATATGCGTCTATCAAACGACTCTTTAAACAATTTGGTAAACCTCACAATATAATTACCGATCAGGCACCTTCAACGAAGCTAGCAATGGCTAAAGTACTTAAAGCTGCTAACCTTAAACCTGACTGtt > 2:517249/1‑141 (MQ=11) aTCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTAtt < 2:458889/141‑1 (MQ=32) aTCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTAtt < 2:982926/141‑1 (MQ=32) tCATTCAGCATATGAGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTg > 1:787582/1‑141 (MQ=17) ttCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAAATTAAACCTGACTGTTATTGTaa > 2:1133834/1‑140 (MQ=17) tCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACa < 1:998805/141‑1 (MQ=32) tCAGCATAGGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACa < 2:480049/141‑1 (MQ=17) tCAGCATACGCGGTTAACAAATGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTACAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAACTAAAGCTTTTAAGCATAAACCTGACTGTTATTGTACa < 1:764499/141‑1 (MQ=11) tttcGTTTATCAAACGGCTCATTAAACAAGTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAat < 2:1205548/138‑1 (MQ=12) atGGGTTTGTCAGACGTCTCATTAAACATTTTGGTAAACGTCAAAAGGTAATTACAGATCGGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTAAATCGAAat > 2:924249/1‑141 (MQ=11) atGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAat < 1:354362/141‑1 (MQ=32) gCGGTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAAAGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAatat < 1:140733/141‑1 (MQ=17) gTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCt > 1:1076707/1‑141 (MQ=32) tttATCAATCGTCTCAATAAACAATTTGGCAAAACCAAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTg < 1:515173/141‑1 (MQ=11) tttATCAAACGGCTCATTAACAAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTg < 2:398967/141‑1 (MQ=12) tATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGaa > 2:246864/1‑141 (MQ=32) tATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGaa > 2:985395/1‑141 (MQ=32) taaaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAACCCTCAAAAGGTAATTACAGATCATGCACCTTCAACGAAGGTAGTAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTATACATCGAAATATCTGAATaa < 1:627611/140‑1 (MQ=255) cAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATaa < 2:603070/141‑1 (MQ=32) aaaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAc > 2:70225/1‑141 (MQ=32) aaaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAc > 2:1169288/1‑141 (MQ=32) aaCGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAACCTTACACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAcc < 2:703123/141‑1 (MQ=17) cGTCTCATTAAACAATTTGGTAAAGCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAGGCTGTCTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTc < 1:829373/141‑1 (MQ=255) ctcATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTCAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCAtt > 2:369364/1‑141 (MQ=17) tcATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTg > 1:470725/1‑141 (MQ=32) cATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAACGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGa > 2:748944/1‑141 (MQ=17) ttAAACCATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGc < 2:587363/141‑1 (MQ=17) aaCAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATTACCTCATTGAGCAAg < 1:894583/141‑1 (MQ=17) aCAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGa < 2:979583/141‑1 (MQ=32) aCAATTGGGTAAACCGCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGa < 2:335935/141‑1 (MQ=17) aaTTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAGTGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTAAATAACCTCATTGAGCAGGATc > 1:485727/1‑141 (MQ=12) tttGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCAc > 2:1051736/1‑141 (MQ=32) tgTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGTAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCTCTGt < 2:730741/140‑1 (MQ=18) gTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTc > 1:1102312/1‑141 (MQ=35) gTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTc > 1:844243/1‑141 (MQ=35) tAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACGTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCa < 1:1115596/141‑1 (MQ=21) aCCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTTTACATCGAAATATCTTAATAACCCCATTGAGCAAGATCACTGGCgtat > 1:193284/1‑141 (MQ=11) aGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATaa < 1:310038/141‑1 (MQ=38) aGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTAATTGAGCAAGATCACTGTGATATTAAAATaa > 2:690394/1‑141 (MQ=255) aGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGATAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATaa < 1:32489/141‑1 (MQ=38) ggaaTTACAGATAAGGCACCTGCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATaaga < 1:295759/139‑1 (MQ=255) gTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATAGCTGAATAACATCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATaaga > 1:158356/1‑141 (MQ=255) aaTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATGGCTAAAGTAATTAACGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATAATACATCGAAATATCTGAATAACCTCCTTGAGCAAGAACACTGTCATCTTAAAATaaaaaa > 2:1162256/1‑141 (MQ=11) catACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATaagaaaa > 2:607032/3‑140 (MQ=38) ttACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATaagaaaga < 2:1183061/141‑1 (MQ=39) tACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTAATATTAAAATaagaaagaa > 2:275774/1‑140 (MQ=37) aCAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACa < 1:6475/141‑1 (MQ=38) aCAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACa < 2:1079274/141‑1 (MQ=39) cAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACaa > 2:1177324/1‑141 (MQ=38) aGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAg < 1:922379/141‑1 (MQ=38) aGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAg < 2:805214/141‑1 (MQ=38) aTCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAATTAAGAAAGACAAGGt > 2:385224/1‑141 (MQ=21) aTCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAAAAGAACAAGGt > 2:494816/1‑141 (MQ=255) ggctcgttCAAGGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACCTCGAAACCCGTGTCTAAACACATTTATCAAGATTGGTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCa < 2:1161164/135‑1 (MQ=11) ggCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCa < 2:873591/141‑1 (MQ=39) ggCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTCATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCa < 2:322678/141‑1 (MQ=17) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAGGGTATCaa > 2:686304/1‑141 (MQ=38) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATaaa > 1:433041/1‑141 (MQ=38) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaa > 2:526618/1‑141 (MQ=38) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaa > 1:1159458/1‑141 (MQ=39) cACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaa < 2:1102312/141‑1 (MQ=38) cACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaa < 2:844243/141‑1 (MQ=39) cACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaa > 2:951430/1‑141 (MQ=38) aCCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaaa < 1:202540/141‑1 (MQ=40) ccTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAat < 2:884724/141‑1 (MQ=40) cTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAata > 1:709565/1‑141 (MQ=40) cTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAata > 2:370914/1‑141 (MQ=40) acaacaaAGATAACAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATc < 2:775345/140‑1 (MQ=255) aCGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTACTTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGAGAAGGTATCAAAATATCAAt > 1:766459/1‑141 (MQ=255) gAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACATCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAATAc < 1:234936/141‑1 (MQ=255) gAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAAGTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAATAc < 1:411657/141‑1 (MQ=255) tAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCGTATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAATACAGCaa < 2:640873/141‑1 (MQ=255) | TGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACAATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAATACAGCAA > USA300TCH1516_ALE/76492‑76772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |