| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2136880 | 74 (0.700) | 4 (0.040) | 4/256 | 12.4 | 5.6% | intergenic (+66/+787) | ktrB_2/ypeA_1 | Ktr system potassium uptake protein B/Acetyltransferase YpeA |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2136884 | 66 (0.680) | intergenic (+70/+783) | ktrB_2/ypeA_1 | Ktr system potassium uptake protein B/Acetyltransferase YpeA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TATTAAGAACATTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGATTAAGAAATTTTAAA > USA300TCH1516_ALE/2136744‑2137022 | aaataAGAACAATTATACCACCAAAAATTACTAAAAATCACCGCTACACTAAAGGACAAAATTATCTATAAAATAACTAACCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAAc < 2:338878/138‑1 (MQ=255) ttaAGAACATTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAg > 2:840193/1‑141 (MQ=255) taAGCACATTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGAGAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATAAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAga > 2:734605/1‑140 (MQ=255) gAACATTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAg > 2:537320/1‑141 (MQ=255) aCATTTATACCACCAAAAAGTCCTCAAAATTACCGCTACACTAACGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTCTTACATTAAAAAAACTACCTAAGCAGGTAGtt > 1:2021/1‑141 (MQ=255) aCATTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGtt > 2:689723/1‑141 (MQ=255) aCATTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTACATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAAGCGCTTAACTTCAAAAAACTACATAAACAggcattt > 2:569732/1‑136 (MQ=255) aTTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGtttt > 1:833584/1‑141 (MQ=255) tttATAACACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGttttt < 2:694255/141‑1 (MQ=255) tataCCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGttttttt > 2:212221/1‑140 (MQ=255) ataCCCACAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTtttat < 1:162855/141‑1 (MQ=255) ataCCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTtttat > 1:619818/1‑141 (MQ=255) ataCCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTtttat > 2:483260/1‑141 (MQ=255) ataCCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTtttat > 2:342283/1‑141 (MQ=255) taCCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTtttatt > 1:769455/1‑141 (MQ=255) accaccAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTtttattt > 1:48338/1‑141 (MQ=255) gccaAAAAGTCCTAAAAATTACCGCAACACGAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTCCGTAATCAGGTAGTTTTTtacttatt < 2:705189/140‑1 (MQ=255) ccaAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTATACAGGTAGTCTTTTatttattt > 2:1138382/1‑141 (MQ=255) caAAAAGTCCTAAAAAGTACCGCGACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTAtttt < 1:534064/141‑1 (MQ=255) aaaaaGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTa > 2:1114935/1‑141 (MQ=255) aaaaaGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTa > 2:533142/1‑141 (MQ=255) aaaaGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAg > 1:587442/1‑141 (MQ=255) aaaGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAgg < 1:160058/141‑1 (MQ=255) aGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGCACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGcc > 1:762203/1‑141 (MQ=255) tCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGa > 1:511615/1‑141 (MQ=255) tCCTAAAAATTACCGCTACAATCATGGACGAATTTATGGATAAAATAACTATCCATATTTAATAAGAAATGAACAAGTGTCTTAATCTATTACATTAAAAAACCTACATAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTGTGCCGa > 2:259321/1‑141 (MQ=255) cTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGact > 2:858976/1‑139 (MQ=255) tAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAAAAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTa < 1:1041726/141‑1 (MQ=255) aaaTTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAat < 1:128690/141‑1 (MQ=255) ccGCTACACTAAAGGACAAATGTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAGACTACCAATACAGGTAGGTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAatgtctta < 2:198584/141‑1 (MQ=255) cTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCtttt > 1:679984/1‑140 (MQ=255) aaGGACAAATTTATCTATAAAATAACTCTCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTGAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTACATCTCTTATGTCTttaatt > 2:552081/1‑141 (MQ=255) aCAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTATTAGTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGt < 1:1138419/141‑1 (MQ=255) aCAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTCTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGt < 1:1138382/141‑1 (MQ=255) aTTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTaaaa < 2:769455/141‑1 (MQ=255) tttATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAAt > 1:208438/1‑141 (MQ=255) aTCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGca > 2:949498/1‑141 (MQ=255) aTCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTCTTTAACTGACATCAGTCCGATGAAAGGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGca > 2:543874/1‑141 (MQ=255) tCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATTcac < 2:405908/141‑1 (MQ=255) tCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGcac < 1:840193/141‑1 (MQ=255) tataAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACaa < 2:1064547/141‑1 (MQ=255) aCTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCtt > 2:59376/1‑141 (MQ=255) cTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCttt < 1:398381/141‑1 (MQ=255) cTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCAATTACATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTCAAATGCGCAAGTACACGttt > 2:1208600/1‑141 (MQ=255) tCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTaaa < 2:983667/141‑1 (MQ=255) cATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTaaaaa > 1:679025/1‑141 (MQ=255) cATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGACGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTaaaaa > 1:889571/1‑141 (MQ=255) cTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGAt > 2:216666/1‑141 (MQ=255) tttAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACCCCTTTAAAAAGAtt < 2:1108646/141‑1 (MQ=255) ataaGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACt > 1:394617/1‑141 (MQ=255) taaGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTc < 1:922147/141‑1 (MQ=255) taaGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTc < 1:499629/141‑1 (MQ=255) taaGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTc < 1:537320/141‑1 (MQ=255) aaGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCa > 1:974748/1‑141 (MQ=255) aGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCaa > 1:417819/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) tgtTTTAATCTATTGCATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATAc > 1:661608/1‑141 (MQ=255) ttttAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACAAAACTATACCt > 2:679042/1‑141 (MQ=255) aTCTATTACATTAAAAAAGCTACCTAAGCAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTa < 2:1137005/141‑1 (MQ=255) tCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTACGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTaa > 2:864860/1‑141 (MQ=255) tCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAAATAAACTATAACTAGTTaa > 1:285446/1‑141 (MQ=255) cTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAAc < 2:48338/141‑1 (MQ=255) tACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCt < 1:977953/141‑1 (MQ=255) cATTAAAAAAACTACCTAAACAGTTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTTAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTtg < 1:533142/141‑1 (MQ=255) aaaaaaCTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGAtt > 1:347821/1‑141 (MQ=255) aaaaaaCTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGAtt > 1:347744/1‑141 (MQ=255) aaaaaCTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACAATACCTAGTTCACCGCTTGTGATTa > 2:279706/1‑141 (MQ=255) aaCTACCTAAACAGGTAGTTTATTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAGGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGATTAAGa > 2:825153/1‑141 (MQ=255) aCCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCATAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGATTAAAAAAtt > 2:1096796/1‑141 (MQ=255) tAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGATTAAGAAATTTTa > 2:1133745/1‑141 (MQ=255) aaCAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGATTAAGAAATTTTaaa < 2:619818/141‑1 (MQ=255) | TATTAAGAACATTTATACCACCAAAAAGTCCTAAAAATTACCGCTACACTAAAGGACAAATTTATCTATAAAATAACTATCCATCTTTAATAAGAAATGAACTAGTGTTTTAATCTATTACATTAAAAAAACTACCTAAACAGGTAGTTTTTTATTTATTTTAGGCCGATTAAATGTCTTATGTCTTTAATTAAGTAAAATGCACAAGTACACCTTTAAAAAGATTTACTCAAAACTAAACTATACCTAGTTAACCGCTTGTGATTAAGAAATTTTAAA > USA300TCH1516_ALE/2136744‑2137022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |