| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1954777 | 95 (0.830) | 8 (0.080) | 7/254 | 16.4 | 8.4% | intergenic (‑39/+26) | nisB/gdmA | Nisin biosynthesis protein NisB/Lantibiotic gallidermin |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1954783 | 87 (0.830) | intergenic (‑45/+20) | nisB/gdmA | Nisin biosynthesis protein NisB/Lantibiotic gallidermin | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TATTTAATTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACT > USA300TCH1516_ALE/1954638‑1954917 | tatTTAATTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGccc < 2:833834/141‑1 (MQ=255)tatTTAATTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGccc < 2:76354/141‑1 (MQ=255) atTTAATTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGcctg < 1:696557/141‑3 (MQ=255) tttAATTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTTAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCtt > 4:325089/1‑141 (MQ=255) tttAATTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCtt < 1:412194/141‑1 (MQ=255) aaTTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGcctgaaag < 1:278537/141‑7 (MQ=255) aTTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGcctgaaagg < 2:813816/141‑8 (MQ=255) ttGTGCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGc < 2:509110/141‑1 (MQ=255) tGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTACTCATACAAATCCTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGct < 1:869491/141‑1 (MQ=255) tGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGct < 1:13363/141‑1 (MQ=255) gTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGctc < 2:865647/141‑1 (MQ=255) ttCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGctct < 2:337611/141‑1 (MQ=255) ttCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGctct > 1:257101/1‑141 (MQ=255) gTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTAttt > 1:663180/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAAATAAATTTAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGc > 2:283405/1‑141 (MQ=255) ttAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTg < 1:586299/141‑1 (MQ=255) ttAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTg < 3:48943/141‑1 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAAAAATTCAACTGATAATCAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTa > 2:782267/1‑141 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTa < 2:17016/141‑1 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTa < 1:214115/141‑1 (MQ=255) aaataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCGTTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAAt < 4:147485/141‑1 (MQ=255) aaataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAAt > 1:420701/1‑141 (MQ=255) aaataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAAt > 2:185775/1‑141 (MQ=255) aaataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAAt > 3:137862/1‑141 (MQ=255) ataaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCt < 1:348371/141‑1 (MQ=255) aaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACTGTTCTTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCTCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTa < 1:651011/141‑1 (MQ=255) aaatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTa > 4:32849/1‑141 (MQ=255) aatTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTaa > 2:570063/1‑141 (MQ=255) tGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAAcag > 2:808320/1‑141 (MQ=255) aTTCAACTGATAATCAAGGTGTTCTAATCATACATATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCCCATATTTGAATAGACAAATAGAGCACTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTACCAGCAGAAg < 2:82006/141‑1 (MQ=38) ttCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTGATCTTAACAGCAGAAGc > 4:170591/1‑141 (MQ=255) ttCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGc < 1:424970/141‑1 (MQ=255) tCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCt < 1:730874/141‑1 (MQ=255) cAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTa < 2:624708/141‑1 (MQ=255) aaCTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTAt < 2:327395/141‑1 (MQ=255) cTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTa < 1:823703/141‑1 (MQ=255) cTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTa > 1:527795/1‑141 (MQ=255) aaaGGTGTTCTCATCATAAAAATACTTTACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTAcc > 2:439694/1‑141 (MQ=255) aaaGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTAcc > 3:64987/1‑141 (MQ=255) aGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAg > 4:321013/1‑141 (MQ=255) tCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAg > 1:802051/1‑141 (MQ=255) tCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAg > 1:273863/1‑141 (MQ=255) tcaTCATACAAATACTAGACGGTTCGTAAATGGAATTCGTTTGTAAGCACCTTACATATTTTAATATACAAATAGGCCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTGATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAgaa < 4:124497/139‑3 (MQ=21) aaTCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGcac > 2:262951/1‑141 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3:125568/1‑141 (MQ=255) aaTACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAg < 3:118658/141‑1 (MQ=255) tACTTAACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTa < 1:76513/141‑1 (MQ=255) cTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGCAcc > 2:518466/1‑140 (MQ=255) ttGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACAt < 3:32535/141‑1 (MQ=255) ttGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACAt < 3:36859/141‑1 (MQ=255) ttGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACAt < 3:32431/141‑1 (MQ=255) cGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAAc < 1:162642/141‑1 (MQ=255) ggTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCTCCTCATATATTTGAATAGTCAATTAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTATTCTTAACAGCAGAAGCTATTAATACTACCAGTCTGAGCACAACCAGGAGGACCTAAACt < 4:321495/141‑1 (MQ=25) ttCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAGACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAt < 2:18504/141‑1 (MQ=255) ttCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACAAATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAt < 1:808320/141‑1 (MQ=255) tAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACt < 1:130998/141‑1 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(MQ=255) aCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctgct < 1:12795/141‑1 (MQ=255) aCCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACctgct < 2:732529/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACCGCAGACGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 3:71945/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 2:527795/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 1:847957/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 4:197450/141‑1 (MQ=255) cTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATCAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGa < 1:731919/141‑1 (MQ=255) aaTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGtt > 2:85542/1‑141 (MQ=255) aaTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTAATACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGtt < 4:16023/141‑1 (MQ=255) aTAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTa < 2:849870/141‑1 (MQ=255) aGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTAtt < 2:156804/141‑1 (MQ=255) cAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGtt < 3:135851/141‑1 (MQ=255) cAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGtt < 2:531261/141‑1 (MQ=255) aaTATAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTg < 1:656349/141‑1 (MQ=255) aaTAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTg > 2:198104/1‑141 (MQ=255) aTAGAGCCCTTTCAGGCTCTAATTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTCCGGGTCTTAGCACAACCAGGGGTACGTATTCTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGGATCATTTGAGTTATTGTTTGc < 4:122577/141‑1 (MQ=37) agCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTa > 4:298250/1‑141 (MQ=255) cccTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAAc < 4:33980/141‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACt > 1:756673/1‑141 (MQ=255) ccTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACt > 1:574664/1‑141 (MQ=255) | TATTTAATTTGTTCAGTATTTAAAAATAAATTGAAAAATTCAACTGATAATAAAGGTGTTCTAATCATACAAATACTTGACGGTTCGTAAATAGTGTTCATTTGTAAGCACCTCACATATTTGAATAGACAAATAGAGCCCTTTCAGGCTCTATTTGCTGTAATCTTAACAGCAGAAGCTATTAAAACTACCAGTCTTAGCACAACCAGGAGTACATAAACTATGACTTGTAATACGTTCGTCACCTGCTGAATCATTTGAGTTATTGTTTGCTTTAACT > USA300TCH1516_ALE/1954638‑1954917 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |