| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 614093 | 155 (0.910) | 11 (0.070) +CGATTCAGAT |
4/276 | 13.5 | 6.5% | coding (2405/2844 nt) | sdrC | Serine‑aspartate repeat‑containing protein C |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 622324 = | 185 (1.090) | coding (2887/3465 nt) | sdrE | Serine‑aspartate repeat‑containing protein E | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
CGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAT > USA300TCH1516_ALE/613950‑614241 | gattcagattcaGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCgattc > 2:880956/1‑149 (MQ=255) attcagattcagACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattca < 1:1013129/149‑1 (MQ=255) ttcagattcaggCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcag < 1:874912/149‑1 (MQ=255) tcagattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCGGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcaga < 1:1257044/149‑1 (MQ=255) cagattcagaCAGCGACTCCGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGAGAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcagat < 1:1018648/149‑1 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGGTTCGGATAGCGACTGGGAAGCGGAGAAGGATTACGATTCAAATAGCGATTCGGACTCGGACAGAgattcagata > 2:784293/1‑148 (MQ=17) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATCGCGCCTCAGACTCAGGTAACGATCCAGATTCAGATAGAGATTCGGACACAGACCGCggctcagatt > 1:776041/1‑149 (MQ=14) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGCTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTaattcagatt > 1:514758/1‑149 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgattcagatt < 1:461587/149‑1 (MQ=255) agattcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTgagccagatt > 2:1356678/1‑149 (MQ=255) attcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGAGTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCgactgagattca > 2:1508398/1‑149 (MQ=11) ttcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGAGTCAGAAAGCGACTCAGATTGGGATAGCGACTCAGACGCAGATAGCGATTCAGAGTGTGATAGCGATTCAGAACAAAACAGTGattaagattcag > 2:399145/1‑149 (MQ=17) ttcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGattcagattcag < 1:207542/149‑1 (MQ=255) ttcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGACTCGGAGTGAGACAGCGattcagattcag > 2:96857/1‑149 (MQ=255) tcagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGAttcagagtcaga > 2:1453513/1‑149 (MQ=255) cagaCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCCGACTCAGATAGCGACTCAGAGTCGGATAGCGACCCAGACTGCGACACAGACTCAGAGTCAGAAAGCGATTCGGACGCAGACACGgactcagagacgaaa > 2:1136230/1‑142 (MQ=14) gcccgCGAATCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTc < 1:335290/145‑1 (MQ=255) aCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCGGACTCGGATAGCGACTCAGACTCCGATAGCGTCTCAGCTTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGCTTCGGACGCAGACAGTGAATCAGATTCAGACTCa > 1:1047003/1‑149 (MQ=18) aCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCa > 1:1626519/1‑149 (MQ=255) aCAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGAcaca > 2:1537458/1‑149 (MQ=255) tcagactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCACATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGa < 1:1180442/149‑1 (MQ=255) gactcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCCGAAAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTc < 1:1610697/149‑1 (MQ=255) actcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGGTAGCGACTCa > 1:331812/1‑149 (MQ=255) ctccactaGCGATTACGACTCGGAAAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAg < 2:841671/142‑1 (MQ=18) ctcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAg < 2:1591359/149‑1 (MQ=255) ctcagacAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAAGGATCCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAg > 1:382520/1‑149 (MQ=255) ctcagacAGCGATTCAGACTCGGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGAGAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGAGACTCAg < 2:1704200/149‑1 (MQ=255) gCGATTCAGACTCGGATGGCGATTCGGACTGAGGTGGGGAGTGAGATTAGGATGGGGTCTCAGAGGCGGATAGCGATTTGGTTGCAGATTGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCGGGGTCAGACTGGGATTGCGAGTCAGATTCGGaa > 2:403860/1‑148 (MQ=255) gCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCCGTATCCGCTAGAGCCTCAGAGTCGGATAGCGACTCGGATGCAGATAGCGACTCAGATTCAGAGAGCGATTCGGACTCAGACAGCGACTCAGGTTGAGACTCAGATTGAGACTCAGATGCGGAc > 2:1626134/1‑149 (MQ=9) gCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGAGAGCGATACAGACTCAGATTGTGag > 2:224971/1‑148 (MQ=17) gcttCAGACTCGGCTACCGACTCAGATGCAGATAGCGTCTCAGATTCGTATAGCGACTCAGACTCAGAGAGCGATTCATATTCAGATAGCGAGTCGGACTCAGACAGTGATTCAGAATCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAg < 2:45028/147‑1 (MQ=21) gATTCAGACTCGGACAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGATAGCGATTCGGGCTCGGACAGTGATTCAGATGCAGAATCAGATAGCGACGCAGATTCTGACAg > 2:1082217/1‑149 (MQ=18) ttCAGCCTCCGATCGCGACTCAGCCTCAGATAGCGACTCAGATGCCGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCg < 2:1532378/149‑1 (MQ=18) ttCAGACTCGGACAGCGCCTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCg < 1:722008/149‑1 (MQ=255) aCTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACCCAGATAGCGCATCAGAATCTCACACCGCTtca > 1:126088/1‑149 (MQ=17) aCTCGGACAGCGACTCAGACCCAGATAGCGACTCAGATTCGGCAAGCGACACAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtca < 1:131880/149‑1 (MQ=21) ggATAGCGACTCAGCCTCAGATAGCGACTCAGACTCGGATCGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcagact < 2:1397872/149‑1 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCAGTTAGCGACTCGGATTCGGACAGCGACTCAGACTCAGATGGCGATTCAGATTCACACAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTAAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcagact < 2:228543/149‑1 (MQ=25) ggATAGCGACTCAGACTCAGATGGCGGCTCAGATTCGGATAGCGACTCTGACTCAGATTGAGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATtcagact < 1:918953/149‑1 (MQ=25) tccgactcagaTAGCGACTAAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCCGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCga < 1:158808/146‑1 (MQ=255) tcagactcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTGCGATACAGACTCAGATTCTGACAGCGATtcagacccaggcgaaga > 2:196233/1‑142 (MQ=18) ctcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGGaactcgg > 2:547966/1‑147 (MQ=255) ctcagaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACTCAGATCGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCCGACAGCgactcag > 2:523651/1‑149 (MQ=255) gctagtcaCTCAGATCCGGCTAGCGACTCAGCCTCAGATCGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACCGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCgacgcagactc < 2:1056981/142‑1 (MQ=21) gaTAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCgactcagactc > 1:1374567/1‑149 (MQ=255) gCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACtcagactcagac < 1:1615054/149‑1 (MQ=255) cGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACa > 1:26463/1‑149 (MQ=255) cGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACa > 1:1386247/1‑149 (MQ=255) cTCCGATTCGCATAGCGACGCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATCCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACCGCGATTCAGACTCAGCCAGCGACTCAGACTCAGACAGTg < 1:855675/149‑1 (MQ=25) cAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGGTTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACaccgat > 1:175682/1‑144 (MQ=255) cAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTAAGATTCTGACAGCGAGTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgct > 2:288031/1‑147 (MQ=255) cAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACACAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTGAGACTCAGAAAGCGAATCAGACGCAGACAgcgct > 2:1353747/1‑145 (MQ=21) cAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCGGACAGCGATTCAGACTCAGACGCCGACTCAGACTCAGAAAgagcg > 2:290868/1‑145 (MQ=18) gatcccgATATCGACTAAGACTCAGATACCGACTGAGATTCAGATAGCGAGTCGGATACAGACTGAGATGAAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattc < 2:34105/143‑1 (MQ=18) cactccgATAGGGACTCAGACTCCGATAGCGATTCAGATTCAGATCCCGATTCGGACTAAGACTCTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGCCTCAGACTCAGACAGTgattc < 2:1704035/143‑1 (MQ=21) ttCGGATAGCGGCTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCATATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGAGTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgcttcac > 1:1236758/1‑148 (MQ=255) cGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACCCAGACAGCGACTCAGACACAGCCACTgattcagat > 2:220729/1‑149 (MQ=255) ggATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTgattcagatt > 1:681646/1‑149 (MQ=255) gATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTGAGGAAGTGATTCAGATTCAGGCTCAGATAGCGACTCAGATTTTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGAGAGTgattgagattc > 2:141959/1‑149 (MQ=21) cGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCATACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACa < 1:1033488/149‑1 (MQ=255) cGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACa > 1:893314/1‑149 (MQ=255) cGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACa > 1:378021/1‑149 (MQ=255) cagactcagaTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCCGATAGCGACTCAGAGTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTAAGATTCAGACAGCGAc > 2:887597/1‑149 (MQ=255) agactcagaTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGGGAGTCAGATTCAGACAGCGAcg > 2:1485639/1‑148 (MQ=255) ctcagaTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGTCAGCGAGtcag > 1:542994/1‑149 (MQ=255) agaTAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagatt < 1:1542683/149‑1 (MQ=255) tAGCGATTCAGATGCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagattcag < 1:139020/149‑1 (MQ=255) gaGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACtcagattcag < 1:1293212/148‑1 (MQ=255) cGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagata > 2:1628704/1‑149 (MQ=255) cggctcagagAGCGAGTCGGACCCAGACAGTGCTTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCCGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTGCGACTCAGATtcagatagcgact < 1:859339/145‑1 (MQ=17) agtttcagatAGCGATGCGGCCTGAGACAGTGACTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgact < 1:311016/146‑1 (MQ=17) agcttcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgact < 1:149898/146‑1 (MQ=255) agattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgact < 1:424961/149‑1 (MQ=255) agattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgact > 2:1235875/1‑149 (MQ=255) agattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgact > 2:776930/1‑149 (MQ=255) agattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgact < 1:1001211/149‑1 (MQ=255) agattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagaaagcgact > 2:1388084/1‑149 (MQ=255) agattcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACACAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGAGATACAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCGGAGAGGGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGAGtcagatagcgacc > 2:553044/1‑148 (MQ=21) ttccgatATCGATTCGGAATCAGCCAGTGAATCAGATTCAGACGCAGACAGCGACTCAGATTCAGATGATGGATCAGGCTCTGACAGCGAGTCATGCTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcag < 1:405225/149‑1 (MQ=17) ttcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGCCATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTTTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTGAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcag > 1:1117211/1‑149 (MQ=255) tgcagatAGTGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcag < 1:527927/147‑1 (MQ=255) tcagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcaga > 1:19190/1‑149 (MQ=255) tcagatAGCGATTCGGAATCGGACAGTGGTTCGGACTTGCTCACAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGAGTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACCCAGATtcagaaagcgactcaga > 2:717249/1‑149 (MQ=14) cagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagac < 1:1700823/149‑1 (MQ=255) cagatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagac < 1:1542715/149‑1 (MQ=255) gatAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactc < 1:1352170/149‑1 (MQ=255) acaGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactca < 1:852071/147‑1 (MQ=255) aGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcggatagggactcagactaagg > 2:1585831/1‑148 (MQ=255) aGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcaga > 1:281229/1‑149 (MQ=255) cGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagata > 1:1522030/1‑149 (MQ=255) gACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactc > 1:1446218/1‑149 (MQ=255) aCTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactca > 1:651175/1‑149 (MQ=255) cTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgcctcagactcagatagcgactcag > 1:808941/1‑149 (MQ=255) cAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATtcagatggcgactcagactcagatggcgactgagat > 2:1034768/1‑148 (MQ=255) cAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagaccaagatagcgactcaccc > 2:47681/1‑146 (MQ=255) ggcAGTGATTCAGATCCAGCTTCAGATACCGACTCAGATTGTGACAGCGATTCAGACTCCGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactc < 2:12386/147‑1 (MQ=17) gACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactc > 1:1123554/1‑149 (MQ=255) aCAGTGATTCAGATTGCGACTCAGATAGCGACTCAGACTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagagactcagactca < 1:1212410/149‑1 (MQ=255) cAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcag < 1:1192709/149‑1 (MQ=255) cAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagatagcgactcagactcag < 1:1668540/149‑1 (MQ=255) | CGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGACTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCTGACAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGAT > USA300TCH1516_ALE/613950‑614241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |