Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_012417	1537	1780	244	4 [1]	[0] 3	USA300HOU_RS14895	USA300HOU_RS14895

TTTTTGTTTGTGAAATTACCATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTT  >  NC_012417/1388‑1545                                                                                                                                                     |          tttttGTTTGTGAAATTACCCTATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATATCCCCTAAACCTTTTATATTCCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGa           <  1:244583/149‑1 (MQ=25) tttttGTTTGTGAAATTACCATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGa           <  1:1203496/149‑1 (MQ=255) tttttGTTTGTGAAATTACCATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGa           <  1:69260/149‑1 (MQ=255)          gtgAAATTACCATATATTTATTTGGCTCATATTTGAGTTTTAACAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCtt  <  2:417777/149‑1 (MQ=255)                                                                                                                                                     |          TTTTTGTTTGTGAAATTACCATATATTTATTTGGCTCATATTTGCGTTTTAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTT  >  NC_012417/1388‑1545

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑