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| * | USA300TCH1516_ALE | 622,314 | 0 | C | A | 97.7% | 377.6 / NA | 132 | S959R (AGC→AGA) | sdrE | Serine‑aspartate repeat‑containing protein E |
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Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TAAAGATGCAGATGGTGGCGAAGTTGACGTAACAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAACGGATACTTCGAAGAAGATACATCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGC > USA300TCH1516_ALE/622170‑622458 | tAAAGATGCAGATGGTGGCGAAGTTGACGTAACAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAACGGATACTTCGAAGAAGATACATCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTgactcagacagcgactcagactcagacagagact < 1:787230/149‑1 (MQ=255) aTGCAGATGGTGGCGAAGTTGACGTAACAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAACGGATACTTCGAAGAAGATACATCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACtcagacagcgactcagactcagacagagactccgac > 2:1630208/1‑149 (MQ=255) aTGCAGATGGTGGCGAAGTTGACGTAACAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAACGGATACTTCGAAGAAGATACATCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACtcagacagcgactcagactcagacagagactcagac < 1:1012697/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |