| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,172,067:1 | +G | 6.7% | coding (116/1047 nt) | leuB → | 3‑isopropylmalate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,172,067 | 1 | . | G | 6.7% | 846.6 / 53.2 | 195 | coding (116/1047 nt) | leuB | 3‑isopropylmalate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (83/99); new base G (4/9); total (87/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
CTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCAGATGCTAT > USA300TCH1516_ALE/2171977‑2172157 | cTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATaga > 1:983884/1‑91 (MQ=255) ggTGATGGAATCCGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gc > 1:2973983/1‑91 (MQ=255) gTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gca > 2:673699/1‑91 (MQ=255) gATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gcacc > 1:1719670/1‑91 (MQ=255) gATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gcacc < 2:1351150/91‑1 (MQ=255) aTGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gcacca < 2:2868725/91‑1 (MQ=255) aTGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gcacca < 2:1027863/91‑1 (MQ=255) tGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gcaccac > 2:2724606/1‑91 (MQ=255) tGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑Gcaccac < 1:913920/91‑1 (MQ=255) ggAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACg < 1:547076/91‑1 (MQ=255) aaTCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGaa < 2:1968373/91‑1 (MQ=255) aaTCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGaa < 1:227154/91‑1 (MQ=255) tCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAAtt < 2:2796912/91‑1 (MQ=255) tCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAAtt < 2:1196235/91‑1 (MQ=255) tCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAAtt < 1:606141/91‑1 (MQ=255) ggTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTtg > 1:2736319/1‑91 (MQ=255) ggTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTtg < 1:1988434/91‑1 (MQ=255) cAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTtggtgg > 1:1426536/1‑91 (MQ=255) cAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTtggtgg > 1:2092645/1‑91 (MQ=255) aGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTggtggt > 1:1394763/1‑91 (MQ=255) aGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTggtggt > 1:1271953/1‑91 (MQ=255) aGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTggtggt > 2:1250231/1‑91 (MQ=255) aGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTggtggt < 1:1788269/91‑1 (MQ=255) gAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGgtggtg > 2:2739348/1‑91 (MQ=255) gAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGgtggtg < 1:2282282/91‑1 (MQ=255) aaaTTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGc < 2:2146839/91‑1 (MQ=255) aaaTTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACCAAATTCGTGGTGc < 1:2495925/91‑1 (MQ=255) aaTTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATGGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGcc > 2:746775/1‑91 (MQ=255) aaTTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGGCACCACCAAATTCGTGGTGc < 1:3478555/91‑1 (MQ=37) aTTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCct < 2:847230/91‑1 (MQ=255) ttttGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCctc > 1:2401683/1‑91 (MQ=255) tttGATCGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGGCACCACCAAATTCGTGGTGctct < 2:3579061/91‑4 (MQ=25) tttGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGAGGCACCACCAAATTCGTGGTGctct < 2:2345224/91‑4 (MQ=25) tttGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCctct > 1:167681/1‑91 (MQ=255) tGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGcc > 1:3872826/1‑86 (MQ=255) tGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGcc < 2:3872826/86‑1 (MQ=255) tGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑t < 1:3407095/91‑1 (MQ=255) tGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑t < 1:2328963/91‑1 (MQ=255) tGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑t < 2:341452/91‑1 (MQ=255) gAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑tt > 1:3642801/1‑91 (MQ=255) gAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑tt > 2:3795928/1‑91 (MQ=255) aCGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGa > 1:3842827/1‑91 (MQ=255) aCGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGa < 1:469949/91‑1 (MQ=255) aCGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGa < 2:3557578/91‑1 (MQ=255) cGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGAt > 1:3730179/1‑91 (MQ=255) cGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGAt < 1:1422822/91‑1 (MQ=255) ggATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATa > 1:3178538/1‑91 (MQ=255) tctcTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACAt < 2:1658039/91‑1 (MQ=255) ctctATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACAtt > 1:1845637/1‑91 (MQ=255) ctATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCg > 2:3350654/1‑91 (MQ=255) ctATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCg < 1:3229893/91‑1 (MQ=255) tCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCg < 2:3169117/91‑1 (MQ=255) tCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCg < 1:709014/91‑1 (MQ=255) aTTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAg < 1:1212964/91‑1 (MQ=255) tGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGcc < 2:2529400/91‑1 (MQ=255) tGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGcc < 1:3285473/91‑1 (MQ=255) cTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCtt > 2:2673222/1‑91 (MQ=255) cTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCtt > 2:1437323/1‑91 (MQ=255) ttGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCttt > 2:3824802/1‑91 (MQ=255) ttGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCttt > 2:3041442/1‑91 (MQ=255) tGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTa > 2:1826202/1‑91 (MQ=255) gacaTTATAAGTAATAAATATAACTATAATTATCCAATAGA‑GCACGACTAATTAGGTGTTGCCACTA‑TTGATACATCCGACGAGCCTTTat > 2:3569570/4‑90 (MQ=255) aaaTTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAAc < 1:3784153/91‑1 (MQ=255) tataAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTgag > 2:1652817/1‑91 (MQ=255) tataAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTgag > 2:1592671/1‑91 (MQ=255) ataAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTgaga < 2:1362289/91‑1 (MQ=255) aaGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGaaa > 1:1037347/1‑91 (MQ=255) taataaATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAAcc > 1:1644485/1‑91 (MQ=255) taataaATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAAcc > 2:1170059/1‑91 (MQ=255) aataaataTAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCt < 1:573236/91‑1 (MQ=255) aataaataTAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCt > 2:648981/1‑91 (MQ=255) aagaaagaTAACGTTAATTAGCAAATAGA‑GCAGCACGAATTGGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCt < 2:3517550/88‑1 (MQ=255) ataaataTAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCtt < 1:2918628/91‑1 (MQ=255) aataTAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTaaa < 2:921312/91‑1 (MQ=255) tataACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATg < 1:2770108/91‑1 (MQ=255) tataACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATg > 2:1953319/1‑91 (MQ=255) tataACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATg < 2:1810063/91‑1 (MQ=255) tataACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATg < 2:1092534/91‑1 (MQ=255) aaCTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCgt < 2:2580211/91‑1 (MQ=255) aCTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCgtg < 1:2439036/91‑1 (MQ=255) cTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCgtgt > 2:3848705/1‑91 (MQ=255) aTTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAag < 2:1301621/91‑1 (MQ=255) aTTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAag > 1:40842/1‑91 (MQ=255) tATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAagag < 2:1719670/91‑1 (MQ=255) tATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAagag < 1:3659803/91‑1 (MQ=255) aTCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGTGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGc > 2:3229273/1‑91 (MQ=255) aTCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGc > 2:3289946/1‑91 (MQ=255) aTCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGc > 1:762036/1‑91 (MQ=255) tCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAATAGCa < 2:2973983/91‑1 (MQ=255) tCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCa < 1:1890860/91‑1 (MQ=255) tCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCa > 2:2471090/1‑91 (MQ=255) tCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCa < 1:2961689/91‑1 (MQ=255) atcaaTAGAGGCACCACCAAATTCGTGGTG‑CTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCa > 1:1748364/4‑91 (MQ=21) tcaaTAGAGGCACCACCAAATTCGTGGTG‑CTCTATTTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCa > 1:2849582/3‑91 (MQ=17) cAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAACGCGTGTAAAAGAGCAg > 2:3703046/1‑91 (MQ=255) cAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCACTA‑GTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCAg > 2:3702413/1‑91 (MQ=255) cAAATAGA‑GCACCACGAATTTGATGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCAg < 2:3121208/91‑1 (MQ=255) caaTAGAGGCACCCCCAAATTCGTGGCG‑CTCTATTTGATACATTCGGCGAGCCTTTAAATGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCAg > 2:868059/2‑91 (MQ=255) aaTAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCAGAt > 1:2346467/1‑91 (MQ=255) a‑gCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCAGATGCTAt > 1:2969314/1‑91 (MQ=255) | CTGGTGATGGAATCGGTCCAGAAATTTTGAACGGATCTCTATCATTGCTTGAAATTATAAGTAATAAATATAACTTTAATTATCAAATAGA‑GCACCACGAATTTGGTGGTGCCTCTA‑TTGATACATTCGGCGAGCCTTTAACTGAGAAAACCTTAAATGCGTGTAAAAGAGCAGATGCTAT > USA300TCH1516_ALE/2171977‑2172157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |