| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2008955 | 126 (0.660) | 21 (0.130) | 11/132 | NT | 16.1% | intergenic (+83/+108) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2008976 | 115 (0.730) | intergenic (+104/+87) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein | |||||
GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2008955‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaagcagtaaga‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGAT < USA300TCH1516_ALE/2008976‑2008888 GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA > 2:3422209/1‑91GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA < 2:2842287/91‑1GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA > 2:2777073/1‑91GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA > 1:286159/1‑91 AAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAA > 1:2642200/1‑91 AAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAA > 1:2847039/1‑91 AGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAA > 2:1074/1‑91 AGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAA > 2:1254305/1‑91 AGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAA < 2:899493/91‑1 AAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAA > 2:2224091/1‑91 AGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAG < 2:2482161/91‑1 GACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTCAATTTAAAAAAGC > 1:592224/1‑91 GACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGC > 2:2673286/1‑91 ACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCA > 2:2779079/1‑91 ACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCA > 1:237731/1‑91 CTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG < 2:2337534/91‑1 CTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG < 2:1702151/91‑1 CTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG > 1:1023432/1‑91 CTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG > 2:432412/1‑91 CTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAAATTAAAAAAGCAG < 2:2337502/91‑1 TTTGATTTATAGCATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGT < 1:3511508/91‑1 TTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGT < 2:3305784/91‑1 TTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGT > 1:885870/1‑91 TTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGT > 1:885732/1‑91 TTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGT > 1:1897250/1‑91 TTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTA > 2:1579423/1‑91 TGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAA > 2:3292811/1‑91 TGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAA < 1:2657198/91‑1 GATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAG > 2:1049116/1‑91 GATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAG > 2:1049906/1‑91 GATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAG > 1:1292312/1‑91 GATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAG < 1:213891/91‑1 ATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA > 1:3340211/1‑91 ATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA < 2:917930/91‑1 ATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA > 1:3606981/1‑91 ATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA > 1:3606899/1‑91 AAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATT < 2:3526239/91‑1 AAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATATAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATT < 2:3526294/91‑1 AACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTG < 1:514100/91‑1 TTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCTTAATTGAAAA < 1:201259/91‑1 TTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCTTAATTGAAAAT < 2:743242/91‑1 AATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTA < 1:3434125/91‑1 AATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTA < 1:3432599/91‑1 AATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTA < 2:754553/91‑1 AATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTA < 2:754621/91‑1 ATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTAC < 2:1910252/91‑1 ATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTAC < 1:2854951/91‑1 ATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTAC < 1:875968/91‑1 AATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGC < 2:3585582/91‑1 AATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGC < 1:2807132/91‑1 TGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCT < 1:3316370/91‑1 ACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTT < 2:958389/91‑1 ACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTT < 1:2596672/91‑1 CAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTA < 2:180101/91‑1 AATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAA < 1:3069384/91‑1 AATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAA < 1:3646059/91‑1 AATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAA < 1:24090/91‑1 AAAAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTG < 1:2134334/91‑1 AAAAGCAGTAAGA‑CATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCGTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGG < 1:3883309/91‑1 AAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGC > 1:3768949/1‑91 AAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGC > 2:671594/1‑91 AAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGC > 2:670520/1‑91 AAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGC > 1:2789313/1‑91 AAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGC > 1:3769031/1‑91 AAAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGC > 1:2025877/1‑91 AAGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCA < 2:1917343/91‑1 AGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGTAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCAT > 2:514527/1‑91 AGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCAT < 1:1566463/91‑1 AGCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCAT < 2:3102990/91‑1 AGCAGTAAGA‑GATATTCTTGATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCAT > 1:532290/1‑91 GCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAACTTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATT > 2:2694213/1‑91 GCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATT > 1:2648511/1‑91 GCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATT > 1:2872053/1‑91 GCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATT > 2:3204796/1‑91 GCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATT > 2:177366/1‑91 GCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATT > 2:1589343/1‑91 GCAGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATCTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATT > 2:3054307/1‑91 AGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAA > 1:2054963/1‑91 AGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAA > 1:1824736/1‑91 AGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAA > 1:1406935/1‑91 AGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAA > 1:1406918/1‑91 AGTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAA > 1:436354/1‑91 GTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAAT > 2:2892344/1‑91 GTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAAT > 2:1930862/1‑91 GTAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAAT > 2:1930653/1‑91 TAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATT > 1:1987877/1‑91 TAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATT > 2:3175691/1‑91 TAAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATT < 1:706419/91‑1 AAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTG < 1:117864/91‑1 AAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTG > 2:2639509/1‑91 AAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTG < 2:191380/91‑1 AAGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTG > 2:1878330/1‑91 AGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGTTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGA > 1:1422119/1‑91 AGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGA < 2:349253/91‑1 AGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGA > 2:283908/1‑91 AGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGA < 1:2865538/91‑1 AGA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGA > 1:3396298/1‑91 GA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGAT < 1:2677001/91‑1 GA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGAT < 2:1137492/91‑1 GA‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTCGCATTAATTGAT < 1:2979994/91‑1 GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2008955‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaagcagtaaga‑GATTTTCTTAATTGAAAATAATCTTACTGCTTTTTTAAATTTAATTTCGAGATTCAATATTAGTTTATCTCATTGTGGCATTAATTGAT < USA300TCH1516_ALE/2008976‑2008888 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |