| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1283492 | 181 (0.950) | 17 (0.100) | 8/138 | NT | 9.1% | coding (57/4317 nt) | polC_1 | DNA polymerase III PolC‑type |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1283506 | 184 (1.120) | coding (71/4317 nt) | polC_1 | DNA polymerase III PolC‑type | |||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
GTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCATATTAC > USA300TCH1516_ALE/1283402‑1283581 | gTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCA > 1:2637100‑M1/1‑91 (MQ=255)gTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCA > 1:1673766‑M1/1‑91 (MQ=255)gTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCA > 2:3049094‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaaGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCaaa > 1:704790/1‑91 (MQ=255) aaaGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAAt > 1:1596718/1‑91 (MQ=255) aaaGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAAt > 1:3247496/1‑91 (MQ=255) aGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCa > 1:380255/1‑91 (MQ=255) aGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCa < 1:1205951/91‑1 (MQ=255) tAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAAt < 1:45417/91‑1 (MQ=255) aTTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGCCAGAGCAACCACAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCACATCAAATa > 2:2641397/1‑91 (MQ=255) ttCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGa > 2:3022728/1‑91 (MQ=255) tCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGAt > 2:2889639/1‑91 (MQ=255) cTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATg < 2:879783/91‑1 (MQ=255) cTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATg < 1:897055/91‑1 (MQ=255) tATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGc < 1:3375662/91‑1 (MQ=255) tttAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtg > 1:1490347‑M2/1‑89 (MQ=255) aGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaat > 2:3770512‑M2/1‑85 (MQ=255) ggtggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaatt < 1:241938‑M2/91‑8 (MQ=255) ggtggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaatt > 2:1557364‑M2/1‑84 (MQ=255) gtggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattt < 1:2751322‑M1/91‑23 (MQ=255) gtggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattt < 2:2825389‑M1/91‑23 (MQ=255) gtggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattt < 2:548643‑M1/91‑23 (MQ=255) tggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaatttt > 1:3664688‑M2/1‑82 (MQ=255) ggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaatttta < 1:539560‑M1/91‑25 (MQ=255) ggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaatttta < 1:1568646‑M2/91‑11 (MQ=255) gtACTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaa > 1:3003953‑M2/1‑80 (MQ=255) gtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaa < 1:2118155‑M2/91‑12 (MQ=255) gtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaa > 2:1521265‑M2/1‑80 (MQ=255) aaTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAATTTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatt < 1:19004‑M1/91‑28 (MQ=255) aaTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAAt < 1:3637464/91‑1 (MQ=255) aTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattttaattt < 1:1829150‑M1/91‑29 (MQ=255) aTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattttaattt < 2:263231‑M1/91‑29 (MQ=255) tGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCa > 2:3693762/1‑91 (MQ=255) tCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAgg > 1:672458/1‑91 (MQ=255) tCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAgg > 1:1708657/1‑91 (MQ=255) tCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAgg < 1:2781406/91‑1 (MQ=255) cTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGt > 1:2404210/1‑91 (MQ=255) ttGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTg < 2:3756255/91‑1 (MQ=255) ttGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTg > 1:951472/1‑91 (MQ=255) ttGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTg > 1:3066794/1‑91 (MQ=255) ggCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGaa > 2:1180687/1‑91 (MQ=255) ggCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGaa > 2:950990/1‑91 (MQ=255) cAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACt < 2:2181519/91‑1 (MQ=255) aaTGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTg < 2:2446268/91‑1 (MQ=255) tGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCa < 2:1693062/80‑1 (MQ=255) tGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGac > 1:1875205/1‑91 (MQ=255) tGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGac > 2:3582612/1‑91 (MQ=255) aCAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactt < 1:287879‑M1/91‑44 (MQ=255) cAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACg < 1:371300/91‑1 (MQ=255) agagCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGt > 2:1366593/1‑91 (MQ=255) agagCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGt > 2:1365613/1‑91 (MQ=255) agagCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGt > 2:1637354/1‑91 (MQ=255) agagCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGt > 2:2460796/1‑91 (MQ=255) agagCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGt > 2:3844290/1‑91 (MQ=255) agCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGtat < 2:440465/91‑1 (MQ=255) caacaaAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAg < 2:3362567/91‑1 (MQ=255) aacaaAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGa < 1:1576746/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTc > 1:1726752/1‑91 (MQ=255) aaTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTc > 1:561348/1‑91 (MQ=255) aaTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTc > 2:1277064/1‑91 (MQ=255) aaTTTAAAGAGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTc > 1:1945429/1‑91 (MQ=255) aTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCt < 1:1324446/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCt < 1:2946890/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCt < 1:1323673/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCt < 2:1852750/91‑1 (MQ=255) aaaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACa < 2:1170103/91‑1 (MQ=255) aaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgt < 1:288048‑M2/91‑49 (MQ=255) aaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAGCaa > 1:3122953/1‑91 (MQ=255) aaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaa > 2:1917290/1‑91 (MQ=255) aaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaa < 2:2888795/91‑1 (MQ=255) aGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaaa > 2:1813683/1‑91 (MQ=255) gcttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCAAACAAAAAc < 2:704790/91‑1 (MQ=255) cttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACa > 1:1077715/1‑91 (MQ=255) tgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgcc < 1:2353217‑M2/91‑56 (MQ=255) gctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGaa < 1:278401/91‑1 (MQ=255) ctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAAc < 2:204848/91‑1 (MQ=255) cAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATggg < 2:3632075/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGa > 2:3409883/1‑91 (MQ=255) aTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAAt > 1:1639078/1‑91 (MQ=255) ttAAAATTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattac < 2:470508‑M1/91‑81 (MQ=255) tAAAATTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattacc < 1:264699‑M2/91‑68 (MQ=255) tAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAAttt > 2:760005/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattacca < 1:2265897‑M1/91‑83 (MQ=255) aaaaTTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattacca < 1:1798670‑M2/91‑69 (MQ=255) aaaaTTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTc < 2:1055540/91‑1 (MQ=255) aaaTTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccac < 1:1796290‑M1/91‑84 (MQ=255) aaaTTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccac > 2:644353‑M1/1‑8 (MQ=255) aaaTTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccac > 1:740616‑M1/1‑8 (MQ=255) aaaTTTCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccac < 1:1765416‑M2/91‑70 (MQ=255) aTTTCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccacct < 2:2499649‑M1/91‑86 (MQ=255) tttCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccacctt > 1:2450769‑M1/1‑5 (MQ=255) tttCAAATCAATTAGATGCtgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccacctt < 2:3160936‑M2/91‑73 (MQ=255) tttCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCatat < 1:3844290/91‑1 (MQ=255) tttCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCatat < 1:3409883/91‑1 (MQ=255) ttCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCATatt > 2:1452707/1‑91 (MQ=255) ttCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCATatt < 2:2371208/91‑1 (MQ=255) tCAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccaccttaa > 1:1280541‑M1/1‑3 (MQ=255) tCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCATatta > 2:263655/1‑91 (MQ=255) cAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccaccttaaa > 1:147150‑M1/1‑2 (MQ=255) cAgcatctaattgatttgaaattttaatttgatcagcaagcactttaaatttttgttgctctgtcattgccaagacaattaccaccttaaa > 1:3430256‑M1/1‑2 (MQ=255) | GTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCATATTAC > USA300TCH1516_ALE/1283402‑1283581 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |