| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2090954 | 170 (0.890) | 21 (0.120) | 12/142 | NT | 11.6% | intergenic (‑188/+350) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2090971 | 169 (1.000) | intergenic (‑205/+333) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
AACATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCA > USA300TCH1516_ALE/2090864‑2091044 | aaCATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCG > 1:2088709‑M1/1‑91 (MQ=255)aaCATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCG > 1:867690‑M1/1‑91 (MQ=255) cATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaa < 2:2918272/91‑1 (MQ=255) cATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaa < 1:2822499/91‑1 (MQ=255) aTGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaaa < 2:1339278/91‑1 (MQ=255) aTGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaaa < 2:266869/91‑1 (MQ=255) aTGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaaa < 2:1162080/91‑1 (MQ=255) gcgcAAACATGGTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAAcc < 2:2597232/91‑1 (MQ=255) gcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAg > 2:715077/1‑91 (MQ=255) gcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGAGTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAg < 2:3807233/91‑1 (MQ=255) cAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGc > 1:1001623/1‑91 (MQ=255) aaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTACCCATCGAAACCAGCCa > 2:3706311/1‑91 (MQ=255) cATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCaaa < 1:1713819/91‑1 (MQ=255) aTGTGACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAg < 1:1898890/91‑1 (MQ=255) tGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGt > 1:129917/1‑91 (MQ=255) gTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggt < 1:2749195‑M1/91‑16 (MQ=255) ttACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtt < 1:383625‑M1/91‑17 (MQ=255) tACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggttt < 1:3526296‑M1/91‑18 (MQ=255) tACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAg > 1:1974038/1‑91 (MQ=255) ccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcga < 1:1852189‑M1/91‑21 (MQ=255) ccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcga < 1:2003400‑M2/91‑4 (MQ=255) cTAATGAGCCTGTTAAATAGACGGTGGCGATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATTACAATTTAACCATCGctaactttggctggtttcgat < 1:2132654‑M1/91‑22 (MQ=255) cTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcgat < 1:1490475‑M1/91‑22 (MQ=255) tAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatg < 1:445498‑M2/91‑6 (MQ=255) tAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATGAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatg > 1:3365900‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggt > 2:31468‑M2/1‑84 (MQ=255) aTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggt > 1:3212286‑M2/1‑84 (MQ=255) gAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtta > 2:1213681‑M2/1‑82 (MQ=255) aGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAt > 1:1755077/1‑91 (MQ=255) aGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAt < 1:1034364/91‑1 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt > 1:1873077/1‑91 (MQ=255) ccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAtttt > 2:3750713/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTa > 2:2774155/1‑91 (MQ=255) aaaaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTAtt < 1:1357253/91‑1 (MQ=255) aaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGc < 1:551541/91‑1 (MQ=255) aaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCt < 2:2732967/91‑1 (MQ=255) gACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTa > 1:3478882/1‑91 (MQ=255) gACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTa < 1:608507/91‑1 (MQ=255) gACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTa > 2:2184676/1‑91 (MQ=255) aCGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTACTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCttca > 2:624319/1‑89 (MQ=255) aCGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTaa > 2:2789353/1‑91 (MQ=255) cGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAAt < 1:1338380/91‑1 (MQ=255) gTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTc > 2:423612/1‑91 (MQ=255) gTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTc > 2:3860451/1‑91 (MQ=255) tGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCa > 2:3164570/1‑91 (MQ=255) tGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCa < 2:1627104/91‑1 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa < 2:3527890/91‑1 (MQ=255) gCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAAt > 2:1112444/1‑91 (MQ=255) cTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATa < 2:2224020/91‑1 (MQ=255) tttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCt < 2:1398801/91‑1 (MQ=255) tAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTg < 1:1117168/91‑1 (MQ=255) tAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTg < 1:172156/91‑1 (MQ=255) gattaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGAt > 1:2917849/1‑91 (MQ=255) attaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGAtt < 2:867690/91‑1 (MQ=255) attaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGAtt < 1:1826020/91‑1 (MQ=255) attaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGAtt < 2:1814061/91‑1 (MQ=255) taaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTAc < 2:1873040/91‑1 (MQ=255) taaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTAc > 1:657061/1‑91 (MQ=255) aaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACt > 1:2990620/1‑91 (MQ=255) agattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAg > 1:2318919/1‑91 (MQ=255) agattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAg > 2:514589/1‑91 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:2678169/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc > 2:2104689/1‑91 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:1961216/91‑1 (MQ=255) aattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTAt < 2:1776666/91‑1 (MQ=255) ttaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCa < 2:3351324/91‑1 (MQ=255) taataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCaa < 2:1946353/91‑1 (MQ=255) aaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCa < 1:258401/91‑1 (MQ=255) aCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCaa < 2:2726461/91‑1 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt > 1:863754/1‑91 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt > 2:2503020/1‑91 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt < 2:2631425/91‑1 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGCTATTTTTTATTGCCTAATTCAATAAGCGTGATTACTAGACCTATCAACGCAAt > 1:3605277/1‑91 (MQ=255) cATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTa < 2:1998908/71‑1 (MQ=255) aTTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATaa < 2:771735/91‑1 (MQ=255) aTTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATaa < 2:3431262/91‑1 (MQ=255) tttAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAg < 1:934227/91‑1 (MQ=255) ttAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggct < 1:1004657‑M2/91‑65 (MQ=255) ttAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAgg < 1:1493901/91‑1 (MQ=255) ttAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAgg < 1:395214/91‑1 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctc > 2:1510165‑M1/1‑9 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctc < 2:3586786‑M1/91‑83 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctc > 1:527033‑M1/1‑9 (MQ=255) aaCCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGaa < 1:3300860/91‑1 (MQ=255) aaCCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGaa < 1:781769/91‑1 (MQ=255) aCCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttactctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcat > 2:374245‑M1/1‑7 (MQ=255) aCCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcat > 1:3212252‑M1/1‑7 (MQ=255) ccATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttgatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatt > 2:3826021‑M1/1‑6 (MQ=255) ccATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatt < 1:167785‑M1/91‑86 (MQ=255) cATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattcatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatta > 1:3366093‑M1/1‑5 (MQ=255) cATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatta > 1:3645646‑M1/1‑5 (MQ=255) cATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATaa < 2:2316248/91‑1 (MQ=255) aTCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcactag > 1:3123764‑M1/1‑4 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattag < 1:3842486‑M2/91‑71 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAGTTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATaaa < 1:3077789/91‑1 (MQ=255) tCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAAc > 1:3691871/1‑91 (MQ=255) cGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattaggg < 2:312257‑M1/91‑90 (MQ=255) cGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattaggg < 2:1033712‑M2/91‑73 (MQ=255) cGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAAcc < 1:2455325/91‑1 (MQ=255) cGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAAcc < 2:2088709/91‑1 (MQ=255) | AACATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCA > USA300TCH1516_ALE/2090864‑2091044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |