| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2380474 | 170 (0.890) | 36 (0.230) | 13/132 | NT | 20.2% | intergenic (+147/+40) | USA300HOU_RS12230/swrC | hypothetical protein/Swarming motility protein SwrC |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2380492 | 145 (0.920) | intergenic (+165/+22) | USA300HOU_RS12230/swrC | hypothetical protein/Swarming motility protein SwrC | |||||
Only 100 of 374 total aligned reads displayed.
ATGTTGAATGCCAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTTAAAGTAAAGAGAATTTCATATATTAC > USA300TCH1516_ALE/2380384‑2380564 | aTGTTGAATGCCAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAG > 1:1184804‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTGAATGCCAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAagta > 2:3790202/1‑91 (MQ=255) gCCAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAata < 2:16046/91‑1 (MQ=255) ccAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAatat > 1:952971/1‑91 (MQ=255) ccAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAatat < 1:2019953/91‑1 (MQ=255) cAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAagtag > 1:3182860/1‑83 (MQ=255) cAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATc < 1:3872053/91‑1 (MQ=255) aGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGAACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatat < 2:891886‑M1/91‑13 (MQ=255) gTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCAt < 1:668083/91‑1 (MQ=255) tATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATg < 1:1741433/91‑1 (MQ=255) tATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATg < 2:1903059/91‑1 (MQ=255) aTTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGa > 2:1927998/1‑91 (MQ=255) gTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCg < 1:3302173/91‑1 (MQ=255) gTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCg > 2:1040717/1‑91 (MQ=255) agtaatatatgaaattctctttactttaaaaaaacgattcactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCTATATCATGACCg > 1:2978715‑M1/60‑91 (MQ=255) agtaatatatgaaattctctttactttaaaaaaacgattcactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCg > 2:1164615‑M1/60‑91 (MQ=255) agtaatatatgaaattctctttactttaaaaaaacgattcactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCg > 1:1132077‑M1/60‑91 (MQ=255) ttttATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactac < 2:2307772‑M1/91‑20 (MQ=255) gtaatatatgaaattctctttactttaaaaaaacgattcactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGc > 1:3038249‑M1/59‑91 (MQ=255) gtaatatatgaaattctctttactttaaaaaaacgattcactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGc > 2:2854761‑M1/59‑91 (MQ=255) tttATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactact < 1:2270681‑M1/91‑21 (MQ=255) tttATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGct < 1:3410360‑M2/91‑3 (MQ=255) attaACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATGTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactactttt < 2:3193958‑M1/91‑24 (MQ=255) taACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttat < 1:2779545‑M1/91‑26 (MQ=255) taACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttat < 2:555160‑M1/91‑26 (MQ=255) acacATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatgg > 2:3410360‑M2/1‑82 (MQ=255) gaaattctctttactttaaaaaaacgattcactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGc > 1:1417647‑M1/50‑91 (MQ=255) cacaTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatggc < 2:465294‑M2/91‑11 (MQ=255) acaTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcgtgatattgactacttttatggct < 2:150613‑M1/91‑30 (MQ=255) acaTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggct < 1:2313090‑M1/91‑30 (MQ=255) acaTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggct < 1:1896666‑M1/91‑30 (MQ=255) acaTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggct < 1:29023‑M1/91‑30 (MQ=255) acaTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggct < 2:3153139‑M1/91‑30 (MQ=255) caTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctt < 1:3148814‑M1/91‑31 (MQ=255) caTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatggctt > 1:1969495‑M2/1‑79 (MQ=255) caTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatggctt > 2:3736453‑M2/1‑79 (MQ=255) caTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatggctt > 2:3306930‑M2/1‑79 (MQ=255) caTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTGTAAAAAGCTATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctt < 1:3090082‑M1/91‑31 (MQ=255) aTCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatggcttt < 2:2029555‑M2/91‑14 (MQ=255) tCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttt < 2:2443281‑M1/91‑33 (MQ=255) tCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttt < 1:3793141‑M1/91‑33 (MQ=255) tCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatggctttt < 1:2377478‑M2/91‑15 (MQ=255) cGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTta < 1:1879419/91‑1 (MQ=255) cGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTta > 2:147963/1‑91 (MQ=255) gATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTtat < 1:268963/91‑1 (MQ=255) aTTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTtata < 2:791827/91‑1 (MQ=255) ttAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTatat < 1:2499898/91‑1 (MQ=255) ctttactttaaaaaaacgattcactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTatat > 1:2931930‑M1/42‑91 (MQ=255) aaaTCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTAtatta < 1:2812442/91‑1 (MQ=255) aaaTCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTAtatta < 1:2128077/91‑1 (MQ=255) aaaTCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTAtatta > 2:1835584/1‑91 (MQ=255) tCGCACGTGAATTAAGTTCTAAAATTACAAAGTTTAAAAAGCCATAAAAGcggtcatgatattgcctacttttatggctttttaaaatttg < 1:1347956‑M1/91‑42 (MQ=255) cGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATtatcta > 1:3530893/1‑91 (MQ=255) cGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATtatcta > 2:1289570/1‑91 (MQ=255) cGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATtatcta < 2:709393/91‑1 (MQ=255) gCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATtatctat > 1:3767996/1‑91 (MQ=255) gCACGTGAAATAAGGTCTAAAATCTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCCTTTATATtatcaat > 2:3508216/1‑91 (MQ=255) aCGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCg < 1:1584164/91‑1 (MQ=255) gTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGtt < 1:266475/91‑1 (MQ=255) tGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGttt > 2:3024350/1‑91 (MQ=255) gAAATGAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTa < 2:3573697/91‑1 (MQ=255) aaTAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGt > 2:1378038/1‑91 (MQ=255) tAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGa > 2:2660189/1‑91 (MQ=255) tAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGa < 1:1063719/91‑1 (MQ=255) aaGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGaa < 1:235645/91‑1 (MQ=255) aaGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGaa < 2:236809/91‑1 (MQ=255) gTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCg < 1:1255896/91‑1 (MQ=255) gTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCg < 1:1378706/91‑1 (MQ=255) cactaaacgatagataatatAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCg > 1:1003320‑M1/21‑91 (MQ=255) tCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGt < 2:2179070/91‑1 (MQ=255) cTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATTTATCGTTTAGTAAATCGtt > 2:3449667/1‑91 (MQ=255) tAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGttt > 1:796782/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGtttt > 1:583113/1‑91 (MQ=255) tCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaa > 1:3625823/1‑91 (MQ=255) aaaTTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaagt > 1:3844564/1‑91 (MQ=255) aTTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaagtaa < 1:140304/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaagtaaa > 1:366458/1‑91 (MQ=255) ttttAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaagtaaa < 2:1182211/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaagtaaag < 2:2669485/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaagtaaag < 2:273611/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTtaaagtaaag < 2:644155/91‑1 (MQ=255) tAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTTAAAGTAAagag > 2:1700906/1‑91 (MQ=255) aaaaGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcga < 1:1781710‑M1/91‑78 (MQ=255) aGCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgt > 2:2336485‑M1/1‑11 (MQ=255) gCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtg < 2:1115732‑M1/91‑82 (MQ=255) gCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtg < 1:1851726‑M1/91‑82 (MQ=255) gCCATAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtg > 1:1657979‑M1/1‑10 (MQ=255) gCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGctttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgt < 2:3180992‑M2/91‑64 (MQ=255) CCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTTAAAGTAAAGAGAATTTCa > 2:3770653‑M1/1‑91 (MQ=255) aTAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgtta < 1:3695713‑M1/91‑85 (MQ=255) aTAAAAGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgtta > 1:3491304‑M1/1‑7 (MQ=255) tAAAAGTAGTCAATATCATGACCGcttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgttaa < 1:2936438‑M2/91‑68 (MQ=255) TAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTTAAAGTAAAGAGAATTTCatat > 1:2245641‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgttaata > 2:2614230‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgttaata > 2:2520266‑M1/1‑4 (MQ=255) aaGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgttaataa < 2:2111089‑M1/91‑89 (MQ=255) aGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgttaataaa > 2:1630684‑M1/1‑2 (MQ=255) aGcggtcatgatattgactacttttatggctttttaaaatttgaaattttagaccttatttcacgtgcgatttaatcgatgtgttaataaa > 2:1571913‑M1/1‑2 (MQ=255) AGTAGTCTATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTTAAAGTAAAGAGAATTTCATATATTa > 1:1946604‑M1/1‑91 (MQ=255) GTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTTAAAGTAAAGAGAATTTCATATATTAc > 2:2912079‑M1/1‑91 (MQ=255) | ATGTTGAATGCCAGTATTGTTTTATTAACACATCGATTAAATCGCACGTGAAATAAGGTCTAAAATTTCAAATTTTAAAAAGCCATAAAAGTAGTCAATATCATGACCGCTTTTATGGCTTTTATATTATCTATCGTTTAGTGAATCGTTTTTTTAAAGTAAAGAGAATTTCATATATTAC > USA300TCH1516_ALE/2380384‑2380564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |