| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2600614 = | 171 (0.900) | 14 (0.080) | 10/148 | NT | 7.7% | intergenic (‑26/+841) | dapF/USA300HOU_RS13395 | Diaminopimelate epimerase/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2600771 = | 178 (1.010) | intergenic (‑183/+684) | dapF/USA300HOU_RS13395 | Diaminopimelate epimerase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
TGAACAAGTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAATTTTTTAGAA > USA300TCH1516_ALE/2600524‑2600703 | tgaaCAAGTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTa < 2:14069/91‑1 (MQ=255)acttacctaatagatagagctattaggttcagcttctaaaaaattacagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataa < 1:708555‑M1/1‑1 (MQ=255)acttacctaatagatagagctattaggtacagcttctaaaaaattacagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataa > 2:3688698‑M1/91‑91 (MQ=255) aaCAAGTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTaga > 1:1864012/1‑91 (MQ=255) cAAGTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACATGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGc < 1:3356436/91‑1 (MQ=255) acctaatagatagagctattaggttcagcttctaaaaaattacagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataAGAGc > 1:1256482‑M1/87‑91 (MQ=255) cctaatagatagagctattaggttcagcttctaaaaaattacagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataAGAGcc < 1:86721‑M1/6‑1 (MQ=255) cctaatagatagagctattaggttcagcttctaaaaaattacagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataAGAGcc < 2:1322493‑M1/6‑1 (MQ=255) aaGTATCGTCATATTCCTCGAAGGATTATACTTAGAAATTTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGcc < 1:3323265/91‑1 (MQ=255) aGTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCct < 1:2473834/91‑1 (MQ=255) gTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCctc > 1:3578024/1‑91 (MQ=255) gTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCctc > 1:3725655/1‑91 (MQ=255) gTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCctc > 1:2625616/1‑91 (MQ=255) gTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCct > 2:1073/1‑90 (MQ=255) tATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCctct > 1:1736781/1‑91 (MQ=255) tATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCctct > 2:2288458/1‑91 (MQ=255) aTCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑g < 1:1205841/91‑1 (MQ=255) cGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTa > 1:2167231/1‑91 (MQ=255) gTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTaa > 2:1992100/1‑91 (MQ=255) tCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAAt < 2:1527675/91‑1 (MQ=255) tCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAAt < 2:2308562/91‑1 (MQ=255) tagagctattaggttcagcttctaaaaaattacagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataAGAGc < 2:2972498‑M1/5‑1 (MQ=255) atatTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAAttt < 1:464377/91‑1 (MQ=255) atTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTa < 2:3866510/91‑1 (MQ=255) atTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTa < 1:984434/91‑1 (MQ=255) tCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAAt < 1:2537652/91‑1 (MQ=255) tCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAAt < 2:1034728/91‑1 (MQ=255) cccGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTAAATTa > 2:3139279/1‑91 (MQ=255) attaggttcatcttctaaaaaattacaggtttagaggaatacagttgtttgcttcgcaacaactgcataAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTa > 2:56465‑M1/70‑91 (MQ=255) ttaggttcatcttctaaaaaattacaggtttagaggaatacagttgtttgcttcgcaacaactgcataAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTAc > 2:2400733‑M1/69‑91 (MQ=255) ccGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTAc > 2:2635432/1‑91 (MQ=255) taggttcatcttctaaaaaattacaggtttagaggaatacagttgtttgcttcgcaacaactgcataAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACt > 1:2131478‑M1/68‑91 (MQ=255) cGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACt < 1:653564/91‑1 (MQ=255) cGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACt < 2:427676/91‑1 (MQ=255) cGAAGGATTATACTTAGAAAATTCCATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACt > 2:1613864/1‑91 (MQ=255) gAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTa > 2:935133/1‑91 (MQ=255) gttcatcttctaaaaaattacaggtttagaggaatacagttgtttgcttcgcaacaactgcataAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTaga > 1:2911842‑M1/65‑91 (MQ=255) ggATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTagag < 2:2878249/91‑1 (MQ=255) ggATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTagag > 2:3252595/1‑91 (MQ=255) gATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCTAGTAATTAAAATTAC‑AGAgg < 1:3453067/91‑1 (MQ=37) ttATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGct < 2:487560/91‑1 (MQ=255) tataCTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGctc < 1:2828832/91‑1 (MQ=255) ataCTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGctct > 1:1870836/1‑91 (MQ=255) ataCTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGctct > 1:3058779/1‑91 (MQ=255) taCTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCtt > 1:3553302/1‑91 (MQ=255) tctaaaaaattacagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataAGAGcc < 2:3555523‑M1/6‑1 (MQ=255) cTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTAt < 2:646932/91‑1 (MQ=255) cTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTAt < 1:2706081/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATg < 1:3064287/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATg > 2:2630131/1‑91 (MQ=255) tAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTGATTTTAATTACTCGAGTCTCTTATGc > 1:508751/1‑91 (MQ=255) gAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAg < 1:1337429/91‑1 (MQ=255) gAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAg > 1:2634859/1‑91 (MQ=255) aaaaTTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAgt < 1:1047287/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAgtt < 2:1455015/91‑1 (MQ=255) aTTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAgttgt < 2:743722/91‑1 (MQ=255) aTTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAgttgt < 2:2730864/91‑1 (MQ=255) ttCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAgttgtt < 1:1785962/91‑1 (MQ=255) tCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGttgttg < 1:2247140/91‑1 (MQ=255) tCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTAGTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGttgttg > 2:866140/1‑91 (MQ=255) cagttttagaggaatacagttgtttgcttcgcaacaactgcataag > 2:332134‑M1/45‑46 (MQ=255) cagttttagaggaatacagttgcttgcttcgcaacaactgcataag < 1:332134‑M1/2‑1 (MQ=255) cTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGc < 1:2430728/91‑1 (MQ=255) ataACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGa > 1:1602627/1‑91 (MQ=255) aCCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGc < 1:1189221/91‑1 (MQ=255) aCCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGc < 2:259684/91‑1 (MQ=255) aCCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGc < 1:894642/91‑1 (MQ=255) aCCTGCCGATACATCCGTCCCTCCGTTGGATGTAGTTGTTGAGCCTCT‑GTGATTTTATTTTCTAGGGGCTCTTGTGCAGTTGTTGCGAAGc < 2:2193749/91‑1 (MQ=255) tGCCGATTCATACGACTCTCCTTTGGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCaaa < 1:1992253/91‑1 (MQ=255) tGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCaaa > 2:3490518/1‑91 (MQ=255) ccGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAaaca < 1:3175225/91‑1 (MQ=255) cGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAaacaa > 2:3276359/1‑91 (MQ=255) aTTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACt > 1:396267/1‑91 (MQ=255) ttCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GCAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTg > 2:2505745/1‑91 (MQ=255) tCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGt > 2:317371/1‑91 (MQ=255) cATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTa > 1:2767707/1‑91 (MQ=255) aTACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAAAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTAt > 1:2350704/1‑91 (MQ=255) tACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTAtt > 2:3778215/1‑91 (MQ=255) cGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTcc > 2:260104/1‑91 (MQ=255) tCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTaaa > 2:1497211/1‑91 (MQ=255) gtttAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAAGTTTAATTACTAGATGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAAcc < 2:2768032/90‑1 (MQ=255) tttAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCt < 2:1814265/91‑1 (MQ=255) tttAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCt < 1:3630585/91‑1 (MQ=255) ttAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTg < 1:1078186/91‑1 (MQ=255) ttAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTg > 2:366318/1‑91 (MQ=255) tAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGt < 1:1546573/91‑1 (MQ=255) tAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGt < 1:1127713/91‑1 (MQ=255) aaacaactgtataAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGt > 2:3725655‑M1/14‑91 (MQ=255) gATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTaa > 2:411411/1‑91 (MQ=255) aTGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAt < 1:1137103/91‑1 (MQ=255) aTGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAt < 1:3436128/91‑1 (MQ=255) aTGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAt < 2:3635570/91‑1 (MQ=255) tGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCATATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAtt > 1:3362497/1‑91 (MQ=255) tATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAtttt > 1:1347854/1‑91 (MQ=255) tATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAtttt < 2:2117860/91‑1 (MQ=255) tATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAtttt > 2:1999057/1‑91 (MQ=255) aTTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAAttttt > 2:234602/1‑91 (MQ=255) tttAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAATTTTTTag < 2:1736781/91‑1 (MQ=255) tttAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAATTTTTTag > 1:2903649/1‑91 (MQ=255) tAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAATTTTTTagaa > 2:1343796/1‑91 (MQ=255) | TGAACAAGTATCGTCATATTCCCCGAAGGATTATACTTAGAAAATTCTATAACCTGCCGATTCATACGACACTCCTTTAGATGTATTTTTAGAGCCTCT‑GTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAAACAACTGTATTCCTCTAAACCTGTAATTTTTTAGAA > USA300TCH1516_ALE/2600524‑2600703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |