New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2186610 = | 206 (1.080) | 9 (0.050) | 7/142 | NT | 5.5% | coding (5/480 nt) | rsbW | Serine‑protein kinase RsbW |
? | USA300TCH1516_ALE | 2186648 = | 128 (0.760) | coding (295/327 nt) | rsbV | Anti‑sigma‑B factor antagonist |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TACATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGTTTAATGC > USA300TCH1516_ALE/2186558‑2186738 | tACATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCAt > 2:627167/1‑91 (MQ=255) tgtcagatcgtatcggtagactatttgaaattactggtcttaaggatttaaTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCAtt > 1:1768457‑M1/52‑91 (MQ=255) aCATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCAtt < 1:1036840/91‑1 (MQ=255) aCATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCAtt < 1:3693153/91‑1 (MQ=255) aCATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCAtt > 2:3698988/1‑91 (MQ=255) aCATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCAtt < 1:1623537/91‑1 (MQ=255) gtcagatcgtatcggtagactatttgaaattactggtcttaaggatttatTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTa > 1:3051829‑M1/51‑91 (MQ=255) cATACTCTGCCGGTGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTa < 2:3230019/91‑1 (MQ=255) cATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTa < 2:3025526/91‑1 (MQ=255) cATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTa < 2:2489251/91‑1 (MQ=255) cATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTa < 1:46447/91‑1 (MQ=255) cATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTa < 2:2874312/91‑1 (MQ=255) tctctGTCGTTGCTGGCACGCGCATTTCGATAAATTCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAAt < 2:2970169/90‑1 (MQ=255) aCTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAAt < 1:171399/91‑1 (MQ=255) aCTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAAt < 1:171135/91‑1 (MQ=255) aCTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAAt < 1:664462/91‑1 (MQ=255) aCTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAAt < 1:3129498/91‑1 (MQ=255) aCTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAAt < 1:2831852/91‑1 (MQ=255) gCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTa < 2:1007801/91‑1 (MQ=255) gCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTa > 2:229246/1‑91 (MQ=255) gCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTa > 2:869437/1‑91 (MQ=255) gATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGa < 2:1736375/91‑1 (MQ=255) aTGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGAc > 2:2455681/1‑91 (MQ=255) aTGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGAc > 1:2781913/1‑91 (MQ=255) aTGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGAc > 1:3471382/1‑91 (MQ=255) aTGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGAc > 1:2473123/1‑91 (MQ=255) tGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGAcc < 1:1825738/91‑1 (MQ=255) tGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGAcc > 2:462793/1‑91 (MQ=255) cTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTACTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAg < 2:1135929/91‑1 (MQ=255) ggCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTa > 1:768301/1‑91 (MQ=255) ggCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTa > 1:1355032/1‑91 (MQ=255) ggCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTa > 1:2327996/1‑91 (MQ=255) ggCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTACATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTa < 2:2736917/91‑1 (MQ=255) gCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTaa > 1:1846190/1‑91 (MQ=255) gcATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCaa < 2:1266851/91‑1 (MQ=255) gcATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCaa > 1:2613992/1‑91 (MQ=255) cATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCaaa > 2:2195923/1‑91 (MQ=255) tttCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATa > 2:2088400/1‑91 (MQ=255) tttCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATa < 1:1232023/91‑1 (MQ=255) tttCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATa > 1:2727143/1‑91 (MQ=255) ttCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAg < 2:1946101/91‑1 (MQ=255) gATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCt > 2:3012509/1‑91 (MQ=255) gATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATACGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCt < 2:1753457/91‑1 (MQ=255) tAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTAc > 2:1476068/1‑91 (MQ=255) aaaaTCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTAcc < 1:900/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCg < 2:3468300/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCg < 2:3640967/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCg > 1:2552970/1‑91 (MQ=255) cttcttTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATAc < 1:518061/91‑1 (MQ=255) cttcttTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATAc < 2:305230/91‑1 (MQ=255) ttcttTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTCAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACg < 2:3184027/91‑1 (MQ=255) ttcttTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACg < 1:2187205/91‑1 (MQ=255) cttTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGAt > 1:439145/1‑91 (MQ=255) cttTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGAt > 2:2711599/1‑91 (MQ=255) gATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGac < 1:1206770/91‑1 (MQ=255) ttGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGacac < 2:745001/91‑1 (MQ=255) ttGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGacac < 1:3116896/91‑1 (MQ=255) gcatgttaatgaaggaacggaggtcgaataacatgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGacacac > 1:1153720‑M2/38‑91 (MQ=255) GCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGacacac > 1:138708‑M1/1‑91 (MQ=255) CATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGCCCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACAcc < 2:2234873‑M1/91‑1 (MQ=255) CATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACAcc < 1:2923648‑M1/91‑1 (MQ=255) CATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACAcc > 2:2990590‑M1/1‑91 (MQ=255) CATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACAcc > 1:716888‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCt < 2:645924‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTa < 2:785557‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTa < 2:2063446‑M1/91‑1 (MQ=255) gttaatgaaggaacggaggtcgaataacatgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTaa > 1:1647551‑M2/34‑91 (MQ=255) GTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTaa > 2:3684017‑M1/1‑91 (MQ=255) ttaatgaaggaacggaggtcgaataacatgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTaaa > 1:1505608‑M2/33‑91 (MQ=255) TATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATa > 2:2831558‑M1/1‑72 (MQ=255) TATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTaaaa > 1:2537663‑M1/1‑91 (MQ=255) tCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGt < 2:1180026/91‑1 (MQ=255) tCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGt < 2:1289462/91‑1 (MQ=255) cGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGta > 1:3444208/1‑91 (MQ=255) aCCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGtata < 2:2856172/91‑1 (MQ=255) ccTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAg < 2:51135/91‑1 (MQ=255) ccTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAg > 1:1311750/1‑91 (MQ=255) ccGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTc > 2:1548832/1‑91 (MQ=255) cGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCt < 1:1535640/91‑1 (MQ=255) gTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCtt < 2:3444208/91‑1 (MQ=255) ttCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCttt < 2:1551526/91‑1 (MQ=255) tCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTa < 1:2669315/91‑1 (MQ=255) tCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTa < 2:683491/91‑1 (MQ=255) tCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTa > 1:79349/1‑91 (MQ=255) cTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATc < 2:803946/91‑1 (MQ=255) cATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCAtt > 2:1899094/1‑91 (MQ=255) cATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCAtt < 1:3455468/91‑1 (MQ=255) aTTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCAttt > 2:3399525/1‑91 (MQ=255) aTTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCAttt < 1:3200426/91‑1 (MQ=255) aTTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCAttt < 2:2781913/91‑1 (MQ=255) ttAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGta > 2:919792/1‑74 (MQ=255) aacatgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTgg > 1:976902‑M2/9‑91 (MQ=255) atgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGttt < 2:2333022‑M2/86‑1 (MQ=255) atgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGttt < 1:1195698‑M2/86‑1 (MQ=255) atgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGttt < 1:2542926‑M2/86‑1 (MQ=255) tgcaTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGTTTa < 1:3372545‑M2/87‑1 (MQ=255) aTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTGAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGTTTAATg < 1:3604964‑M2/90‑1 (MQ=255) aTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGTTTAATg > 1:178723‑M2/2‑91 (MQ=255) aTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGTTTAATg < 2:1661796‑M2/90‑1 (MQ=255) aTTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGTTTAATg < 2:3311592‑M2/90‑1 (MQ=255) | TACATACTCTGCCGATGCTGGCACGCGCATTTCGATAAAATCTTCTTTAGATTGCATGTTATTCGACCTCCGTTCCTTCATTAACATGCATTAAATCCTTAAGACCAGTAATTTCAAATAGTCTACCGATACGATCTGACACACCTAAAATGTATAGTTCTTTATCATTTTGGTTTAATGC > USA300TCH1516_ALE/2186558‑2186738 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |