| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 3,344 | A→T | 10.8% | intergenic (+28/‑362) | dnaN → / → USA300HOU_RS00015 | DNA polymerase III subunit beta/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 3,344 | 0 | A | T | 10.8% | 694.4 / 58.8 | 222 | intergenic (+28/‑362) | dnaN/USA300HOU_RS00015 | DNA polymerase III subunit beta/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (110/88); new base T (8/16); total (118/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
ATTCTAAAACCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAATAA > USA300TCH1516_ALE/3254‑3434 | ttCTAAAACCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGat < 1:3585958/91‑1 (MQ=255) tCTAAAACCAAAAGGAGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGatt < 2:3639272/91‑1 (MQ=255) aaaaCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGattaat < 2:2547316/91‑1 (MQ=255) aaaCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGattaatt > 1:1460003/1‑91 (MQ=255) aaCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGattaatta < 1:1095804/91‑1 (MQ=255) aaCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGT‑Tttaattaa < 1:2309609/91‑1 (MQ=255) aCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTATAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGAttaattaa > 2:3054731/1‑91 (MQ=255) aCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGAttaattaa < 1:1162347/91‑1 (MQ=255) aCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGT‑Tttaattaat < 1:1628299/91‑2 (MQ=39) aCCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGT‑Tttaattaat < 1:18405/91‑2 (MQ=39) cAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGT‑Tttaattaatca < 2:3784655/91‑4 (MQ=38) cAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGT‑Tttaattaatca < 2:1892960/91‑4 (MQ=38) cAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGT‑Tttaattaatca < 2:1749136/91‑4 (MQ=38) aaaGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACg > 2:3153235/1‑91 (MQ=255) aaGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGt > 1:3856435/1‑91 (MQ=255) aaGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGt > 1:1754546/1‑91 (MQ=255) ggTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCa > 2:2828309/1‑91 (MQ=255) ggTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCa > 2:2241199/1‑91 (MQ=255) ggTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCa > 2:2125397/1‑91 (MQ=255) gacgacTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATcc > 2:1545437/1‑91 (MQ=255) cgacTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AAAGTCATCCtt > 2:3559312/1‑91 (MQ=255) gacTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCttt > 2:1524747/1‑91 (MQ=255) acTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAGTAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTa > 2:3002883/1‑91 (MQ=255) acTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTa > 2:1023495/1‑91 (MQ=255) acTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTa < 1:34048/91‑1 (MQ=255) cTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTAt > 2:1197800/1‑91 (MQ=255) tCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTAtt > 2:1675568/1‑91 (MQ=255) cGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTAttt > 2:234126/1‑91 (MQ=255) cGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTAttt < 2:548151/91‑1 (MQ=255) ggTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGT‑TTTAATTAATCACGTCATCCTTTAttta < 2:1114343/91‑2 (MQ=21) aaaCGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTAtttttt < 2:67076/90‑1 (MQ=255) aCGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTgg < 2:1306967/91‑1 (MQ=255) aCGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTgg > 2:1422614/1‑91 (MQ=255) aCGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTgg > 2:3724862/1‑91 (MQ=255) cGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGc < 2:2233809/91‑1 (MQ=255) cAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCaa > 2:1568647/1‑91 (MQ=255) aattaattTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCaaa < 1:2566207/91‑1 (MQ=255) attaattTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCaaaa > 1:111598/1‑91 (MQ=255) attaattTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCaaaa > 2:887060/1‑91 (MQ=255) ttaattTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCaaaaa < 1:2199768/91‑1 (MQ=255) aattTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAaata < 1:2029081/91‑1 (MQ=255) aattTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAaata < 2:857754/91‑1 (MQ=255) attTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAaataa > 2:2185196/1‑91 (MQ=255) tttACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAAtt > 1:1220212/1‑91 (MQ=255) tttACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAAtt > 1:2885187/1‑91 (MQ=255) ttACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTc > 2:3864246/1‑91 (MQ=255) ttACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTc < 1:2508735/91‑1 (MQ=255) ccAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAg < 2:1659919/91‑1 (MQ=255) ccAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAg > 2:1117063/1‑91 (MQ=255) ccAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAg < 2:921760/91‑1 (MQ=255) cAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAgg < 2:2170461/91‑1 (MQ=255) tCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGc > 1:1195786/1‑91 (MQ=255) cAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCg < 2:2687042/91‑1 (MQ=255) cAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCg < 1:2615323/91‑1 (MQ=255) aGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGt > 1:2067362/1‑91 (MQ=255) aaCTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTa > 2:3817704/1‑82 (MQ=255) aaCTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTa < 1:3817704/82‑1 (MQ=255) aCTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATg < 1:878075/91‑1 (MQ=255) tACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTaa > 1:2692300/1‑91 (MQ=255) cTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTaaaa < 1:1568593/91‑1 (MQ=255) cTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTaaaa < 2:2398306/91‑1 (MQ=255) aaaaTAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAaaataa > 1:434629/1‑91 (MQ=255) aaaaTAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAaaataa > 1:3186639/1‑91 (MQ=255) aaaaTAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAaaataa > 1:2369707/1‑91 (MQ=255) aaataaatATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAaaataaa > 1:1335029/1‑91 (MQ=255) aaataaatATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATATTTTGGCAAAAATAATTCTAGAAGCGAAAGTAaaataaa > 2:3376461/1‑91 (MQ=255) aataaataTAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAaaataaat > 1:1443669/1‑91 (MQ=255) ataaatataaatAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAAtt > 1:61621/1‑91 (MQ=255) ataaatataaatAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAAtt > 1:1876445/1‑91 (MQ=255) taaatataaataAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAAttt < 2:1834285/91‑1 (MQ=255) aaatataaataAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTg < 1:2948453/91‑1 (MQ=255) aatataaataAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTgg < 1:344949/91‑1 (MQ=255) aatataaataAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTgg < 1:2423620/91‑1 (MQ=255) atataaataAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTaa > 1:2864121/1‑79 (MQ=255) atataaataAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTaa < 2:2864121/79‑1 (MQ=255) atataaataAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGgc > 1:1981747/1‑91 (MQ=255) ataaataaAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGgcag > 1:1973596/1‑91 (MQ=255) ataaataaAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGgcag > 2:3636107/1‑91 (MQ=255) ataaataaAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATACTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGgcag > 2:169689/1‑91 (MQ=255) aataaaGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCAt < 1:666641/91‑1 (MQ=255) aaaGGATGACGT‑TTTAATTAATCACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCAtttt > 1:2263683/1‑91 (MQ=21) aaGGATGACGT‑TTTAATTAATCACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTa > 1:2817271/1‑91 (MQ=25) aGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTaa > 2:272396/1‑91 (MQ=255) aGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTaa < 2:909137/91‑1 (MQ=255) aGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTaa < 1:2222116/91‑1 (MQ=255) tGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAg < 1:848609/91‑1 (MQ=255) gACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGc > 1:2720441/1‑91 (MQ=255) gACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGc > 2:1162925/1‑91 (MQ=255) gACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGc > 1:1125608/1‑91 (MQ=255) gACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGc > 2:1163174/1‑91 (MQ=255) aCGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGgca < 2:3751190/76‑1 (MQ=255) aCGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGgca > 1:3751190/1‑76 (MQ=255) cGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCaa > 2:457899/1‑91 (MQ=255) tGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAAt > 2:3698802/1‑91 (MQ=255) tGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAAt < 1:39576/91‑1 (MQ=255) gATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAATa > 1:3067461/1‑91 (MQ=255) gATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAATa < 1:3698802/91‑1 (MQ=255) attaattaA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAATaa > 1:100595/1‑91 (MQ=255) attaattaA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAATaa > 2:880536/1‑91 (MQ=255) attaattaA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAATaa > 2:22061/1‑91 (MQ=255) | ATTCTAAAACCAAAAGGTGACGACTCGGTAACGCAATTAATTTTACCAATCAGAACTTACTAAAAATAAATATAAATAAAGGATGACGTGATTAATTAA‑AACGTCATCCTTTATTTTTTGGCAAAAATAATTCTAGGTGCGTATGTAAAATAAATTTGGCAGCATTTTAAACAGCAAATAA > USA300TCH1516_ALE/3254‑3434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |