Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 536,863 | T→A | 9.0% | intergenic (+56/‑255) | rplY → / → pth | 50S ribosomal protein L25/Peptidyl‑tRNA hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 536,863 | 0 | T | A | 9.0% | 753.6 / 47.2 | 233 | intergenic (+56/‑255) | rplY/pth | 50S ribosomal protein L25/Peptidyl‑tRNA hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (110/101); new base A (9/12); total (119/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
AAAGCAAAGAAGACGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTA > USA300TCH1516_ALE/536773‑536952 | aaaGCAAAGAAGACGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTAtt < 1:844082/91‑1 (MQ=255) aaaGCAAAGAAGACGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTAtt < 2:2823311/91‑1 (MQ=255) aaaGAAGACGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAat < 1:1614218/91‑1 (MQ=255) aagaagACGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAata < 1:2552655/91‑1 (MQ=255) aagaagACGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAata > 2:2171214/1‑91 (MQ=255) agaagaCGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAatat > 1:1210767/1‑91 (MQ=255) gaagaCGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAAtata > 2:2119120/1‑91 (MQ=255) aagaCGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACCATGCTTATATTAAAATaa < 2:2359605/91‑1 (MQ=38) agaCGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAg < 2:2508377/91‑1 (MQ=255) agaCGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACCATGCTTATATTAAAATAAg < 2:2915724/91‑1 (MQ=38) gaCGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGc < 1:42956/91‑1 (MQ=255) cGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCAt > 1:242212/1‑91 (MQ=255) cGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACCATGCTTATATTAAAATAAGCac < 1:775094/91‑2 (MQ=37) cGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACCATGCTTATATTAAAATAAGCac < 2:591991/91‑2 (MQ=37) gaagaaAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACCATGCTTATATTAAAATAAGCaca < 2:3821165/91‑3 (MQ=37) agaaAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAAtata > 2:3633014/1‑83 (MQ=255) agaaAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACCATGCTTATATTAAAATAAGCacagt < 2:731996/91‑5 (MQ=25) gaaAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTg < 1:1490433/91‑1 (MQ=255) gaaAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTg < 1:1623441/91‑1 (MQ=255) gaaAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTg < 1:471207/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGc > 2:955786/1‑91 (MQ=255) aaaaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCt < 1:1892314/91‑1 (MQ=255) aaaaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCt < 1:3513473/91‑1 (MQ=255) aaaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCtt > 2:2035301/1‑91 (MQ=255) aaaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCtt > 2:2065200/1‑91 (MQ=255) aaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCttt < 1:2948012/91‑1 (MQ=255) aaaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTGAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCttt < 2:3186025/91‑1 (MQ=255) aaCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCtttt > 1:762854/1‑91 (MQ=255) aCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCttttt > 2:1649562/1‑91 (MQ=255) aCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCttttt < 2:1550054/91‑1 (MQ=255) aCTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCttttt < 2:1032139/91‑1 (MQ=255) cTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTtg < 1:2684606/91‑1 (MQ=255) tGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTtgt > 2:2018183/1‑91 (MQ=255) gAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTtgtg > 2:3772481/1‑91 (MQ=255) agagTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGtt > 2:707323/1‑91 (MQ=255) agTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGttat < 2:1225903/91‑1 (MQ=255) gTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAACCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGttatt > 1:3078602/1‑91 (MQ=255) aTTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATtata > 1:3749180/1‑91 (MQ=255) tttAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATaaa > 1:2868942/1‑91 (MQ=255) tAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGc < 1:1551907/91‑1 (MQ=255) aaTCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCt > 2:1435378/1‑91 (MQ=255) aaTCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCt > 2:415334/1‑91 (MQ=255) aaTCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCt < 1:2850635/91‑1 (MQ=255) aaTCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCt < 2:3538774/91‑1 (MQ=255) tCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCtta < 1:2612839/91‑1 (MQ=255) tGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCttaat > 1:2641524/1‑91 (MQ=255) ttACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCttaatta < 1:1649562/91‑1 (MQ=255) ttACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCttaatta > 1:2515773/1‑91 (MQ=255) tACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCttaattaa > 2:649090/1‑91 (MQ=255) cATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAAc > 2:1466626/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACttt > 1:3141576/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTCAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACttt > 1:3360596/1‑91 (MQ=255) aaGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTttag < 1:953403/91‑2 (MQ=255) gTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTttatta < 1:1050197/91‑1 (MQ=255) tttttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATg < 2:1195792/49‑1 (MQ=255) tttttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTAc > 1:1914217/1‑91 (MQ=255) tttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACtt > 2:2863887/1‑91 (MQ=255) tttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACtt < 2:3209058/91‑1 (MQ=255) ttATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACttt < 2:3714216/91‑1 (MQ=255) tataCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTg < 1:202338/91‑1 (MQ=255) tataCTTTGTTTAACAAGCACTATGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTg < 2:3121959/91‑1 (MQ=255) ataCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAGAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGt < 2:2218806/91‑1 (MQ=255) ataCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGt < 2:1731610/91‑1 (MQ=255) taCTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTa < 1:3681623/91‑1 (MQ=255) cTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACt < 2:3623963/91‑1 (MQ=255) tttGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTa < 1:1097773/91‑1 (MQ=255) tttGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTa > 1:3802781/1‑91 (MQ=255) tttGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTa > 1:2481988/1‑91 (MQ=255) tGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTaaa > 1:3250442/1‑91 (MQ=255) tttAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGt > 2:3402720/1‑91 (MQ=255) ttAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGtt < 2:2646996/91‑1 (MQ=255) ttAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGtt < 2:1625779/91‑1 (MQ=255) tAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTAGTACAAAGTAATAAAGttt < 2:2763081/91‑1 (MQ=25) aaaaGCACCATGCTTATATTAAAATAAGCACAGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaa > 2:795440/3‑91 (MQ=21) aCAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaa > 1:2170579/1‑91 (MQ=255) cAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGttatac > 1:1434514/1‑87 (MQ=255) cAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaat < 2:747407/91‑1 (MQ=255) cAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaat < 1:660099/91‑1 (MQ=255) cAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaat > 1:3681920/1‑91 (MQ=255) aaGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTttaatt < 2:1390381/91‑1 (MQ=255) cACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTACAGTTtaattaat < 1:2986159/91‑1 (MQ=255) cACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTtaattaat > 2:2553406/1‑91 (MQ=255) accatgCTTATATTAAAATAAGCACAGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTaattaatt > 1:1943303/5‑91 (MQ=25) accatgCTTATATTAAAATAAGCACAGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTaattaatt > 2:2284791/5‑91 (MQ=25) accatgCTTATATTAAAATAAGCACAGTGCTTTTTGCGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTaattaatt > 2:237221/5‑91 (MQ=25) ccatgCTTATATTAAAATAAGCACAGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAAttt > 1:1890819/4‑91 (MQ=37) cTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAAttt > 1:2076035/1‑91 (MQ=255) cTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTAGTACAAAGTAATAAAGTttaattaagct < 1:3843260/91‑4 (MQ=18) tgtgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAAtttt > 2:243229/1‑91 (MQ=255) tgtgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAAtttt > 1:583188/1‑91 (MQ=255) gtgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTa > 1:1752011/1‑91 (MQ=255) gtgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTa > 1:2693325/1‑91 (MQ=255) tgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAg > 1:901108/1‑91 (MQ=255) tgCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAg > 1:3545520/1‑91 (MQ=255) tgCTTATATTAAAATAAGCACAGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAg > 2:2592269/1‑91 (MQ=38) cTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTg > 2:1973834/1‑91 (MQ=255) ttATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGa < 2:2868368/91‑1 (MQ=255) tATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAg > 1:2761704/1‑91 (MQ=255) tATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAg > 1:2583562/1‑91 (MQ=255) ttttAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTa > 2:2604225/1‑91 (MQ=255) | AAAGCAAAGAAGACGAAGAAAAAACTGAAGAGTAATTTTAATCTGTTACATTAAAGTTTTTATACTTTGTTTAACAAGCACTGTGCTTATTTTAATATAAGCATGGTGCTTTTTGTGTTATTATAAAGCTTAATTAAACTTTATTACTTTGTACTAAAGTTTAATTAATTTTAGTGAGTA > USA300TCH1516_ALE/536773‑536952 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |