| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 803,539 | A→G | 17.2% | intergenic (‑239/+31) | USA300HOU_RS03920 ← / ← dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 803,539 | 0 | A | G | 17.2% | 564.5 / 111.3 | 250 | intergenic (‑239/+31) | USA300HOU_RS03920/dtpT | Putative lipid kinase/Di‑/tripeptide transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (106/101); new base G (30/13); total (136/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.92e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.08e-01 | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGT > USA300TCH1516_ALE/803451‑803629 | tataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAAAAAAATATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACt < 2:55164/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 1:416639/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCtt < 1:21532/91‑1 (MQ=255) ataATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACtt > 2:2838095/1‑91 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTa < 2:2172995/91‑1 (MQ=255) taATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTa > 2:1178212/1‑91 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTAc < 1:1091071/91‑1 (MQ=255) tGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTg > 2:2931408/1‑91 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGt > 2:1958068/1‑91 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGt < 2:1139360/91‑1 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTACTAGAAACCTATAAAAATCCAGTAAGCCATGTAAATGACTCACTGtt > 2:2439442/1‑91 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGATACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGtt < 1:3358979/91‑1 (MQ=37) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGtt < 2:3171025/91‑1 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTAACTGtt < 1:3022406/91‑1 (MQ=38) tatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttttt < 2:1924861/91‑1 (MQ=255) tatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttttt < 2:239644/91‑1 (MQ=255) tatTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGtttttt > 1:1503271/1‑91 (MQ=255) ttAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGa > 2:3592008/1‑91 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGaa < 1:3155505/91‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTCAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACCGCACGCCATTTAAAGGACTTACTGTTTTTTGaa > 2:1243280/1‑91 (MQ=255) aaGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAAt > 1:260046/1‑91 (MQ=255) aaGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAAt > 1:3847547/1‑91 (MQ=255) gTTTTTATTTATACTGATATCTTGAGTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTa > 1:2003538/1‑91 (MQ=255) tatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCca > 1:3260438/1‑91 (MQ=255) atttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaa > 1:1389768/1‑91 (MQ=255) ttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaaca < 2:811478/91‑1 (MQ=255) ttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaaca < 1:3208763/91‑1 (MQ=255) tataCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCcaacaa > 1:635739/1‑91 (MQ=255) taCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAata < 1:478237/91‑1 (MQ=255) taCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAata > 2:1157964/1‑91 (MQ=255) tGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTa > 1:1267205/1‑91 (MQ=255) gATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTaa > 1:1579539/1‑91 (MQ=255) atatCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAAc < 1:355649/91‑1 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta < 2:1484300/91‑1 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 1:2218229/1‑91 (MQ=255) ttGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGtata > 2:3423943/1‑91 (MQ=255) ttGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGtata > 2:3412754/1‑91 (MQ=255) ttGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGtata < 1:2518869/91‑1 (MQ=255) tGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATAc > 2:400908/1‑91 (MQ=255) aaTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCt < 1:2245848/91‑1 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt > 1:2094057/1‑91 (MQ=255) tttAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCttt < 2:3236057/91‑1 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCAt > 1:375168/1‑91 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCAt > 1:3789529/1‑91 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATc < 1:3583714/91‑1 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATc > 1:695518/1‑91 (MQ=255) taatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGc < 2:1736153/91‑1 (MQ=255) aatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCt > 2:1999173/1‑91 (MQ=255) gAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtga < 2:2984807/91‑1 (MQ=255) gAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtga < 1:2809710/91‑1 (MQ=255) aaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTCACGTATACCTTTCATTGCTTtgctg > 2:822130/1‑91 (MQ=255) aCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGAGTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTCTCATCGCTTtgatga < 1:3314093/91‑1 (MQ=255) aCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatga < 1:953035/91‑1 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTa > 2:3321419/1‑91 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTa > 2:140080/1‑91 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTa > 1:2645198/1‑91 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTa > 2:2614995/1‑91 (MQ=255) ataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTaa > 2:3772097/1‑91 (MQ=255) ataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTaa > 1:1705216/1‑91 (MQ=255) aaaaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGt > 2:1042295/1‑91 (MQ=255) aaaCCGTAAGAAATTTACATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCGAACCATATTAACGTATACATTTCATAGCTTTGATGATTAAAGGTga < 1:3084051/91‑1 (MQ=255) aaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga < 1:882446/91‑1 (MQ=255) aaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga < 1:1776142/91‑1 (MQ=255) aaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga < 2:2351113/91‑1 (MQ=255) aaaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga > 2:713848/1‑91 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGGCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGTTGATTAAAGGTgaga > 2:2101982/1‑91 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGAATAAAGGTgcga > 2:2702267/1‑91 (MQ=255) gTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg > 1:1161782/1‑91 (MQ=255) gTAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg > 2:2305584/1‑91 (MQ=255) gTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg < 2:894369/91‑1 (MQ=255) tAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 2:637616/1‑91 (MQ=255) tAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 1:1482441/1‑91 (MQ=255) tAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 2:3044332/1‑91 (MQ=255) tAAGTCATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 1:3451669/1‑91 (MQ=255) tAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 1:649061/1‑91 (MQ=255) aagtcATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt > 1:132245/5‑91 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt > 1:66571/1‑91 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt < 2:654694/91‑1 (MQ=255) agtcATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGCGCGATTGCTa > 2:1606553/4‑91 (MQ=38) agtcATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGCATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGAGAGATTGCTa > 1:1402876/4‑91 (MQ=38) gCCATTTATTTGACTTACTGTTTTTTGAATTTGTCCAACTCTATTAACGTATACCTTTTGTCGCTTTGGTGATTCGAGGTGAGATTGCTaa < 2:2413839/91‑1 (MQ=255) gCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTaa < 2:3471778/91‑1 (MQ=255) gCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTaa > 1:2079482/1‑91 (MQ=255) tcATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt > 2:2263481/2‑91 (MQ=255) ccATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt < 2:47169/91‑1 (MQ=255) cATTTAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt > 1:2384854/1‑90 (MQ=255) cATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATa > 2:2648622/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATAc < 2:1768045/91‑1 (MQ=255) aTTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATAc < 1:287036/91‑1 (MQ=255) aTTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATAc > 1:524777/1‑91 (MQ=255) tttAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATATCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa > 2:3399590/1‑91 (MQ=255) ttAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa > 2:438126/1‑91 (MQ=255) ttAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa < 1:61571/91‑1 (MQ=255) tAAATGGCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAt > 1:2443112/1‑91 (MQ=255) tAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAt > 2:1000702/1‑91 (MQ=255) aaTGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAttg > 1:3040775/1‑91 (MQ=255) aTGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAttgt < 1:2350793/91‑1 (MQ=255) gACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAttgttg > 1:3023384/1‑91 (MQ=255) aCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATtgttgt > 1:747344/1‑91 (MQ=255) aCTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAACACAATtgttgt > 1:3520682/1‑91 (MQ=255) | TATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGT > USA300TCH1516_ALE/803451‑803629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |