Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 890,015 | T→G | 5.6% | intergenic (+28/‑130) | mgsR → / → gcvH | Regulatory protein MgsR/Glycine cleavage system H protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 890,015 | 0 | T | G | 5.6% | 803.0 / 30.0 | 240 | intergenic (+28/‑130) | mgsR/gcvH | Regulatory protein MgsR/Glycine cleavage system H protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (122/104); new base G (8/6); total (130/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
ATGGGCGATAAGATAACATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTATGGC > USA300TCH1516_ALE/889925‑890105 | gggCGATAAGATAACATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCg < 1:3627884/91‑1 (MQ=255) gCGATAAGATAACATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGat > 1:537040/1‑91 (MQ=255) gCGATAAGATAACATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGat > 2:3536604/1‑91 (MQ=255) cGATAAGATAACATTGGGATGTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCGAGata < 2:2581780/91‑1 (MQ=255) cGATAAGATAACATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGata > 2:1050988/1‑91 (MQ=255) ataagataaCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATAtt < 1:1966552/91‑1 (MQ=255) taagataaCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATAttt < 1:2554602/91‑1 (MQ=255) taagataaCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCGAGATAttt < 2:2486187/91‑1 (MQ=255) gataaCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGa < 2:3661473/91‑1 (MQ=255) gagaaCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTGAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGa < 2:2326393/88‑1 (MQ=255) ataaCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGAt > 2:3448949/1‑91 (MQ=255) aCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCa < 2:2373721/91‑1 (MQ=255) aCATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCa > 2:660316/1‑91 (MQ=255) ttAGGATTTAAAGAAGATGAATTGAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTACGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTa < 1:54456/91‑1 (MQ=255) aGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACa > 1:1724014/1‑91 (MQ=255) ggATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACAt > 2:3036597/1‑91 (MQ=255) aTTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGt < 1:3326586/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGt < 2:2651396/91‑1 (MQ=255) aTTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGt > 1:2459788/1‑91 (MQ=255) ttAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTaa > 2:2256054/1‑91 (MQ=255) aaaGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTaaaa < 1:1143057/91‑1 (MQ=255) aagaTCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGaa > 2:3276481/1‑91 (MQ=255) agaTCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGaaa > 1:1602112/1‑91 (MQ=255) gaTCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAAt > 2:434495/1‑91 (MQ=255) gaTCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAAt > 2:2452492/1‑91 (MQ=255) cAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAg > 2:149688/1‑91 (MQ=255) aaTATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGc > 1:1793334/1‑91 (MQ=255) atatAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCt < 2:349030/91‑1 (MQ=255) tataAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCta > 1:2180367/1‑91 (MQ=255) ataAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCtat < 1:3774924/91‑1 (MQ=255) aaaGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATAc < 1:1516839/91‑1 (MQ=255) aaaGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATAc > 1:71436/1‑91 (MQ=255) gagaCTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAAt < 2:3287315/91‑1 (MQ=255) agaCTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGCAAAATGAAATAAGCTATACAAtt < 2:2853104/91‑1 (MQ=255) gaCTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTg < 1:3216143/91‑1 (MQ=255) gaCTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTg < 1:472536/91‑1 (MQ=255) aCTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGt < 2:478349/91‑1 (MQ=255) ttGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTa > 1:606320/1‑91 (MQ=255) tGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTaa > 1:2518364/1‑91 (MQ=255) tGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTaa > 1:3783375/1‑91 (MQ=255) ggTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAt > 1:2531473/1‑91 (MQ=255) ggTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAt > 2:1983853/1‑91 (MQ=255) ggTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAt > 1:732156/1‑91 (MQ=255) ggTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAt > 2:3729288/1‑91 (MQ=255) gTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAtt > 2:3875056/1‑91 (MQ=255) gTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATGTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAtt < 1:3078547/91‑1 (MQ=255) tAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAtttt < 1:3729850/91‑1 (MQ=255) tAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAtttt < 1:897704/91‑1 (MQ=255) aGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTCCTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAttttt < 2:3597932/91‑1 (MQ=255) gCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTta < 1:3875056/91‑1 (MQ=255) gCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTta > 1:2708104/1‑91 (MQ=255) gCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTta > 2:1173559/1‑91 (MQ=255) gCGGAAGGGAAATGTAAGCGTTTACTTAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTta > 2:1313134/1‑91 (MQ=255) gTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTtata > 2:3237210/1‑91 (MQ=255) gTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTtata > 1:2048694/1‑91 (MQ=255) gTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTtata < 2:2167986/91‑1 (MQ=255) gTAAGTGAAATGTAAACGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTtata > 2:1840032/1‑91 (MQ=255) aGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAat > 1:1036395/1‑91 (MQ=255) aGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAat > 2:3332292/1‑91 (MQ=255) aGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAat > 1:2737073/1‑91 (MQ=255) gTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAata > 1:2666676/1‑91 (MQ=255) tGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAatat < 1:1008976/91‑1 (MQ=255) aaaTGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAg < 1:2211720/91‑1 (MQ=255) aaaTGTAAGCG‑TTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGt < 2:533809/91‑1 (MQ=255) aaTGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAAtatatt > 1:3051602/1‑89 (MQ=255) aaTGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGt > 1:1913565/1‑91 (MQ=255) aTGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGtt > 1:781707/1‑91 (MQ=255) tGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTg > 2:2891060/1‑91 (MQ=255) tGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTg < 2:2159874/91‑1 (MQ=255) tGTAAGCGTTGACTATATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTg < 2:1128427/91‑1 (MQ=255) gTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGa > 1:2870588/1‑91 (MQ=255) gTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGa > 1:183176/1‑91 (MQ=255) tAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGaa > 2:918619/1‑91 (MQ=255) tAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGaa < 1:1409226/91‑1 (MQ=255) aaGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAAt < 2:3404636/91‑1 (MQ=255) aGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATa > 1:2973440/1‑91 (MQ=255) aGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATa < 1:3580215/91‑1 (MQ=255) gCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAg < 2:314135/91‑1 (MQ=255) gCGTTTACTAAATATCTCGATACTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAg < 2:3449265/91‑1 (MQ=255) cGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGc > 2:1476739/1‑91 (MQ=255) gTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCa < 1:3595915/91‑1 (MQ=255) ttACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATc < 2:2196185/91‑1 (MQ=255) tACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCt > 1:587947/1‑91 (MQ=255) atcTAAATATCGAGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCt > 2:548634/3‑91 (MQ=255) atcTAAATATCGAGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCt > 1:1561154/3‑91 (MQ=255) aCTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATATCTTCTa > 2:1698150/1‑91 (MQ=255) cTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAg > 2:2016392/1‑91 (MQ=255) cTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAAGTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAg < 1:124433/91‑1 (MQ=255) aaaTATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGcc > 2:1465879/1‑91 (MQ=255) aaaTATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTATTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGcc > 1:3110947/1‑91 (MQ=255) aaaTATCGAGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGcc > 1:2239566/1‑91 (MQ=255) aaTATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCt < 1:1313134/91‑1 (MQ=255) aaTATCGAGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCt > 2:2706616/1‑91 (MQ=255) atatCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCtt < 2:2566552/91‑1 (MQ=255) tatCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACGATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTa < 2:2997446/91‑1 (MQ=255) tatCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACGATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTa < 2:2997007/91‑1 (MQ=255) tatCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTa < 2:3640417/91‑1 (MQ=255) tctcGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTATg < 1:2833719/91‑1 (MQ=255) ctcGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTATgg > 1:2403408/1‑91 (MQ=255) tcGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTATGGc < 2:1002163/91‑1 (MQ=255) | ATGGGCGATAAGATAACATTAGGATTTAAAGAAGATCAATATAAAGAGACTTGGTTAGCGTAAGTGAAATGTAAGCGTTTACTAAATATCTCGATATTTAGATTCATTACATGTAAAATGAAATAAGCTATACAATTGTTAATTTTTATAAATATAGTTGAATAGCATCTAGCCTTATGGC > USA300TCH1516_ALE/889925‑890105 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |