| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 979,347 | T→C | 5.2% | intergenic (+17/+42) | clpB_1 → / ← ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 979,347 | 0 | T | C | 5.2% | 690.0 / 17.8 | 211 | intergenic (+17/+42) | clpB_1/ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (92/108); new base C (7/4); total (99/112) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
AGGTACAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACC > USA300TCH1516_ALE/979258‑979437 | aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 2:1885925/1‑91 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 1:2262245/1‑91 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga < 1:3642838/91‑1 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 1:1933327/1‑91 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 2:1379135/1‑91 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 1:406013/1‑91 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 2:3731474/1‑91 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 2:1122230/1‑91 (MQ=255) aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGcgatta > 1:544746/1‑89 (MQ=255) cAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTgatgat > 2:3553281/1‑91 (MQ=255) cAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTgatgat > 1:2159918/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATcatc < 2:2159918/91‑4 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCa > 2:1202822/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCa > 2:3879053/1‑91 (MQ=255) aaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAt > 1:261629/1‑91 (MQ=255) aGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAtt < 2:298200/91‑1 (MQ=255) gTTACTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 1:3237513/91‑1 (MQ=255) gTTAATGTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 2:349936/91‑1 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 1:3457542/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 1:3458093/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCtt < 1:2404622/91‑1 (MQ=25) tAATTTAAATTCAGACAATAAATTAACTATTAATAATAAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCtt < 2:468679/91‑1 (MQ=16) aaTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTg > 1:2872509/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTgg > 2:2650894/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTgg > 2:132557/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTgg < 1:1445487/91‑1 (MQ=255) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc > 2:2851442/1‑84 (MQ=255) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 1:2851442/84‑1 (MQ=255) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttt < 2:353541/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:2572430/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:769046/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt < 2:1691339/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt > 1:955146/1‑91 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:2023466/1‑91 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt < 2:2885987/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATCCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:816937/1‑91 (MQ=255) aCAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAttt > 2:795071/1‑91 (MQ=255) aCAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAttt < 2:1815759/91‑1 (MQ=255) cAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTg > 1:3027695/1‑91 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 2:1983815/1‑91 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 1:1552110/1‑91 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 2:2273331/1‑91 (MQ=255) aCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAtt > 1:487525/1‑91 (MQ=255) aCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAtt > 1:1301944/1‑91 (MQ=255) aCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAtt < 2:211840/91‑1 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt > 1:1606189/1‑91 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt > 2:1087373/1‑91 (MQ=255) ttAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATtta > 2:26214/1‑91 (MQ=255) ttAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATtta < 2:3019249/91‑1 (MQ=255) cGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTtattat > 2:1423210/1‑91 (MQ=255) gTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATtata < 2:2392760/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:2454446/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:3203790/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 1:1113596/91‑1 (MQ=255) ttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAAt < 1:1853590/91‑1 (MQ=255) tAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAAtt < 1:1202131/91‑1 (MQ=255) atgatgAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATGTATTATAATTGt < 1:3000004/91‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGt < 1:1870890/91‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGt < 2:578542/91‑1 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt > 2:3818804/1‑91 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt < 2:2521921/91‑1 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt > 2:3819062/1‑91 (MQ=255) gTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTc < 2:3389346/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCa > 1:3247916/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCAt > 1:1650954/1‑91 (MQ=255) gAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCAtt < 2:2127858/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTg > 1:2066779/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTgg < 1:729804/91‑1 (MQ=255) aaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCa < 1:2865668/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:2440058/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATCCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:3814546/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat < 1:1358994/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat < 1:1894287/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat < 1:2023466/91‑1 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata > 1:208880/1‑91 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat < 1:535546/91‑1 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat > 2:2347508/1‑91 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat < 1:2485544/91‑1 (MQ=255) cATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAAtata < 1:2295933/91‑1 (MQ=255) cATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAAtata < 1:3553890/91‑1 (MQ=255) tgcaTAAAATTGAACCAAGCATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATCGGCAATCTACt > 2:3630774/4‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt < 1:3188511/91‑1 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt > 1:659673/1‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt > 1:2918468/1‑91 (MQ=255) gAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtt > 1:2006055/1‑91 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:889553/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:170902/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:2775404/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:3699943/91‑1 (MQ=255) aTTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAAt < 1:2240657/91‑1 (MQ=255) tGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGa < 2:33318/91‑1 (MQ=255) gAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAt > 1:3333419/1‑91 (MQ=255) aCCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 1:935765/1‑91 (MQ=255) aCCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt < 1:1047477/91‑1 (MQ=255) aCCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 2:1910702/1‑91 (MQ=25) cAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaa > 1:1251606/1‑91 (MQ=25) aGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaata < 2:3301156/91‑1 (MQ=255) gAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaataa > 1:1495974/1‑91 (MQ=255) aaTGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTAATATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATaaa > 2:3477801/1‑91 (MQ=255) tgtgATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAaca < 2:2754126/91‑1 (MQ=255) | AGGTACAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACC > USA300TCH1516_ALE/979258‑979437 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |