| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 979,351 | G→T | 5.2% | intergenic (+21/+38) | clpB_1 → / ← ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 979,351 | 0 | G | T | 5.2% | 734.2 / 23.8 | 210 | intergenic (+21/+38) | clpB_1/ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (88/111); new base T (7/4); total (95/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
ACAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAAT > USA300TCH1516_ALE/979262‑979440 | aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 1:1313143/1‑91 (MQ=255)aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 1:2262245/1‑91 (MQ=255)aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 2:1121796/1‑91 (MQ=255)aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 2:1885925/1‑91 (MQ=255)aCAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGtgatga > 1:1933327/1‑91 (MQ=255) ttAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAGCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCg > 1:3516142/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAACATTGAACCAAGAATGTGATGATTCATCGCa > 2:3879350/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATcatc < 2:2159918/91‑4 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCa > 2:1202131/1‑91 (MQ=255) aaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAt > 2:510872/1‑91 (MQ=255) aaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAt > 1:261629/1‑91 (MQ=255) aaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAt > 1:3680397/1‑91 (MQ=255) aGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAtt > 1:1068102/1‑91 (MQ=255) gTTACTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 1:3237513/91‑1 (MQ=255) gTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 1:1918934/91‑1 (MQ=255) gTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTAAATAATGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 2:3247779/91‑1 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 1:3458084/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCtt < 1:2404622/91‑1 (MQ=25) aTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTgg > 2:2650894/1‑91 (MQ=255) ttAAATTCAGACAATAACTTAACGTGTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGtt < 2:3528352/91‑1 (MQ=25) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 1:2851442/84‑1 (MQ=255) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAAAATAAAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttt < 2:353616/91‑1 (MQ=255) aaaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTgggtgc > 1:2050578/1‑87 (MQ=25) aaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttttt < 1:1214057/91‑1 (MQ=255) aaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttttt > 1:1585947/1‑91 (MQ=255) aaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttttt > 2:332649/1‑91 (MQ=255) ttCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTa < 1:2784343/91‑1 (MQ=255) tCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGTATTCTTGGTTTTTTAg > 2:2975379/1‑91 (MQ=255) tCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAg < 2:2994989/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 2:1055089/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:2572430/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:769046/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt < 2:1691339/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:2023466/1‑91 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATCCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:816937/1‑91 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTCAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTa > 2:3490236/1‑87 (MQ=255) aCAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAttt < 2:1815759/91‑1 (MQ=255) cAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTg > 1:3027695/1‑91 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 2:1983815/1‑91 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 2:2273331/1‑91 (MQ=255) aCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAtt < 2:211840/91‑1 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt < 2:336926/91‑1 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt < 1:2505168/91‑1 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt > 1:1606189/1‑91 (MQ=255) ttAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATtta > 2:26214/1‑91 (MQ=255) tAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATttat < 1:1430497/91‑1 (MQ=255) gTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATtata < 2:2392760/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:2454446/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:601060/91‑1 (MQ=255) ttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAAt < 1:1853590/91‑1 (MQ=255) ttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAAt < 2:124146/91‑1 (MQ=255) tAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAAtt < 2:1372815/91‑1 (MQ=255) aaTGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTACTCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTg > 2:3426572/1‑91 (MQ=255) aTGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGt < 1:1870890/91‑1 (MQ=255) aTGCTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATGTATTATAATTGt < 1:2999991/91‑1 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt < 2:2521921/91‑1 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt > 2:3818851/1‑91 (MQ=255) ttGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCa > 1:3247916/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGCTTTGAAATTTATTATAATTGTTCAt > 1:3604048/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCAt > 1:1650954/1‑91 (MQ=255) gAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCAtt < 2:2127858/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTg > 1:2066779/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTTCATGAAGAAAATTGACACAAGAATGTGATGATTAAACGCATTTTTGTTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTTTTCATTg < 2:3608245/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTgg < 1:729804/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGc < 1:941435/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGc > 2:37483/1‑91 (MQ=255) aaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGcc > 2:3178666/1‑90 (MQ=255) aaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCa < 1:2865668/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:2440058/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:538570/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:1533812/91‑1 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata > 1:208880/1‑91 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata < 2:1408132/91‑1 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata < 2:3687053/91‑1 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata > 1:1257537/1‑91 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat > 2:2347508/1‑91 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat < 1:534022/91‑1 (MQ=255) cATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAAtata < 1:2296416/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc > 1:1484549/1‑91 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc < 1:1170455/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc > 1:2880479/1‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt > 1:659673/1‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt < 1:3188511/91‑1 (MQ=255) gAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtt > 1:2006055/1‑91 (MQ=255) caaTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtt < 2:3843918/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:889553/91‑1 (MQ=255) aTTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAAt < 1:2240657/91‑1 (MQ=255) tGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGa < 1:3853905/91‑1 (MQ=255) gAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAt > 1:3333419/1‑91 (MQ=255) aCCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 1:1738350/1‑91 (MQ=255) aCCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt < 1:1047477/91‑1 (MQ=255) aCCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 2:1910702/1‑91 (MQ=25) aCCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 1:2172801/1‑91 (MQ=25) cAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaa < 1:344002/91‑1 (MQ=255) aaGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaat > 1:3740874/1‑91 (MQ=255) tgtgATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAaca < 2:2754126/91‑1 (MQ=255) tgatgaTTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACAcc < 1:442045/91‑1 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 2:2859644/1‑91 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 2:1584625/1‑91 (MQ=255) tgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAat < 2:2880479/91‑1 (MQ=255) | ACAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAAT > USA300TCH1516_ALE/979262‑979440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |