| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 979,353 | T→A | 5.2% | intergenic (+23/+36) | clpB_1 → / ← ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 979,353 | 0 | T | A | 5.2% | 722.5 / 17.5 | 211 | intergenic (+23/+36) | clpB_1/ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (88/112); new base A (7/4); total (95/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
CAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAAT > USA300TCH1516_ALE/979263‑979440 | cAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTgatgat > 1:2159918/1‑91 (MQ=255)cAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTgatgat > 2:2186537/1‑91 (MQ=255) cGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTaa < 2:1892629/91‑1 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCa > 2:1202822/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCa < 1:2287260/91‑1 (MQ=255) aaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAt < 2:211886/91‑1 (MQ=255) aGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAtt > 1:1068102/1‑91 (MQ=255) gTTACTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 1:3237513/91‑1 (MQ=255) gTTAATGTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 2:349936/91‑1 (MQ=255) ttAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCt < 1:1868851/91‑1 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 1:3458084/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 2:1625031/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAAATTAACTATTAATAATAAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCtt < 2:468679/91‑1 (MQ=16) aaTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTg > 1:2872509/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTgg > 2:132557/1‑91 (MQ=255) tttAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGt < 1:2421559/91‑1 (MQ=255) ttAAATTCAGACAATAACTTAACGTGTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGtt < 2:3528352/91‑1 (MQ=25) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 1:2851442/84‑1 (MQ=255) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAAAATAAAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttt < 2:353616/91‑1 (MQ=255) aaaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTgggtgc > 1:2053205/1‑87 (MQ=25) aaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttttt > 2:2879998/1‑91 (MQ=255) aaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCACATTCTTGGttttt > 2:2645193/1‑91 (MQ=255) aTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGtttttt < 1:1927237/91‑1 (MQ=255) ttCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTa < 1:2784343/91‑1 (MQ=255) tCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAg < 2:2994989/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa > 1:1815759/1‑91 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 2:1055089/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:769046/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:2572430/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:2023466/1‑91 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt < 2:2885987/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATCCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:816937/1‑91 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTCAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTa < 1:3490236/87‑1 (MQ=255) aCAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAttt < 2:2434405/91‑1 (MQ=255) aCAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAttt < 2:1815759/91‑1 (MQ=255) cAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTg > 1:3027695/1‑91 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 2:2273331/1‑91 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 2:1983815/1‑91 (MQ=255) aCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAtt > 1:487525/1‑91 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt > 1:1606189/1‑91 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt > 2:1087373/1‑91 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt < 1:2505168/91‑1 (MQ=255) ttAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATtta > 2:26214/1‑91 (MQ=255) tAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATttat < 1:1430497/91‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATttatta > 1:607174/1‑91 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:601060/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:2454446/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:3203790/91‑1 (MQ=255) tAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAAtt < 1:1202822/91‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGt < 2:578542/91‑1 (MQ=255) aTGCTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATGTATTATAATTGt < 1:2999991/91‑1 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt > 2:3818804/1‑91 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt > 1:2441832/1‑91 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt > 2:3819062/1‑91 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt < 2:2521921/91‑1 (MQ=255) gTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTc < 2:3389346/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCa > 1:3247916/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGCTTTGAAATTTATTATAATTGTTCAt > 1:3604048/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCAt > 1:1650954/1‑91 (MQ=255) aaaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTgg < 1:729804/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGc < 1:941435/91‑1 (MQ=255) aaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCa < 1:2865668/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:1533812/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat < 1:2023466/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat < 1:1894287/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat < 1:1358994/91‑1 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata < 2:3687053/91‑1 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata < 2:1408132/91‑1 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata > 1:208880/1‑91 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat > 2:2347508/1‑91 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat < 1:535546/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc > 1:1484549/1‑91 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc < 1:1170455/91‑1 (MQ=255) tgcaTAAAATTGAACCAAGCATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATCGGCAATCTACt > 2:3630774/4‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt < 1:3188511/91‑1 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt > 1:659673/1‑91 (MQ=255) gAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtt > 1:2006055/1‑91 (MQ=255) caaTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtt < 2:3843918/90‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:170902/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:3699943/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:889553/91‑1 (MQ=255) tGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGa < 1:3853905/91‑1 (MQ=255) tGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGa < 2:2149304/91‑1 (MQ=255) tGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGa < 2:33318/91‑1 (MQ=255) gAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAt > 1:3333419/1‑91 (MQ=255) gAACCAAGAATGTGATGATTAATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAt < 1:2645193/91‑1 (MQ=255) aaCCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAtt > 1:2202586/1‑91 (MQ=255) aCCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt < 1:1047477/91‑1 (MQ=255) aCCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 2:1910702/1‑91 (MQ=25) cAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaa < 1:344002/91‑1 (MQ=255) cAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaa > 1:1251606/1‑91 (MQ=25) aaGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaat > 1:3740874/1‑91 (MQ=255) aGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaata < 2:3301156/91‑1 (MQ=255) aGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaata > 1:2329607/1‑91 (MQ=37) aaTGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTAATATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATaaa > 2:3477801/1‑91 (MQ=255) tgtgATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAaca < 2:3053664/91‑1 (MQ=255) tgtgATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAaca < 2:2754126/91‑1 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 2:2859644/1‑91 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 1:157455/1‑91 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 2:1584625/1‑91 (MQ=255) | CAACGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAAT > USA300TCH1516_ALE/979263‑979440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |