| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 979,355 | A→C | 5.3% | intergenic (+25/+34) | clpB_1 → / ← ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 979,355 | 0 | A | C | 5.3% | 740.5 / 23.3 | 215 | intergenic (+25/+34) | clpB_1/ampR | Chaperone protein ClpB/HTH‑type transcriptional activator AmpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (90/113); new base C (8/4); total (98/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAATATTTC > USA300TCH1516_ALE/979266‑979445 | aTTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATc < 1:1885925/91‑1 (MQ=255) ttAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAGCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCg > 1:3516142/1‑91 (MQ=255) ttAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCg < 2:3337980/91‑1 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAACATTGAACCAAGAATGTGATGATTCATCGCa > 2:3879350/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCa < 1:2287260/91‑1 (MQ=255) aaaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCa > 2:1202822/1‑91 (MQ=255) aaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAt > 1:261629/1‑91 (MQ=255) aaGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAt > 1:3680397/1‑91 (MQ=255) aGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCAtt > 1:1068102/1‑91 (MQ=255) gTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc > 2:2624815/1‑91 (MQ=255) gTTAATGTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTc < 2:349936/91‑1 (MQ=255) ttAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCt < 1:3165372/91‑1 (MQ=255) ttAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCt < 1:1868851/91‑1 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt < 2:1875868/91‑1 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 2:1625031/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 1:3457542/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCtt > 1:3458093/1‑91 (MQ=255) tAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCtt < 1:2404622/91‑1 (MQ=25) aaTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTg > 1:2872509/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTgg > 2:132557/1‑91 (MQ=255) aTTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTgg > 2:2650894/1‑91 (MQ=255) ttAAATTCAGACAATAACTTAACGTGTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGtt < 2:3528352/91‑1 (MQ=25) tAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGttt > 1:629545/1‑91 (MQ=255) aaaTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTgggtgc > 1:2053205/1‑87 (MQ=25) aTTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGtttttt < 1:1927237/91‑1 (MQ=255) tCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGTATTCTTGGTTTTTTAg > 2:2975379/1‑91 (MQ=255) tCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAg < 2:2994989/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:769046/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 1:2572430/91‑1 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa > 1:1815759/1‑91 (MQ=255) cAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGa < 2:1055089/91‑1 (MQ=255) aGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAt < 2:3667561/91‑1 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:2023466/1‑91 (MQ=255) gACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATCCTTGGTTTTTTAGAtt > 2:816937/1‑91 (MQ=255) aCAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAttt < 2:2434405/91‑1 (MQ=255) aCAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGAttt < 2:383154/91‑1 (MQ=255) aaTAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGa < 1:3704486/91‑1 (MQ=255) tAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGaaa > 2:1983815/1‑91 (MQ=255) aCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAtt < 2:211840/91‑1 (MQ=255) aCTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAtt > 1:1301944/1‑91 (MQ=255) cTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAAttt > 2:1087373/1‑91 (MQ=255) ttAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATtta > 2:26198/1‑91 (MQ=255) tAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATttat > 1:3203790/1‑91 (MQ=255) tAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATttat < 1:1430497/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:2454446/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:601060/91‑1 (MQ=255) tttAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATaa < 2:3203790/91‑1 (MQ=255) tAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAAtt < 1:1202822/91‑1 (MQ=255) atgatgAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATGTATTATAATTGt < 1:3000004/91‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGt < 2:578542/91‑1 (MQ=255) tGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGtt > 2:3818851/1‑91 (MQ=255) gTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTc < 2:3389346/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCa > 1:3247916/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCAt > 1:1650954/1‑91 (MQ=255) gAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCAtt < 2:2127858/91‑1 (MQ=255) aaaaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTg > 1:2066793/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTTCATGAAGAAAATTGACACAAGAATGTGATGATTAAACGCATTTTTGTTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTTTTCATTg < 2:3608245/91‑1 (MQ=255) aaaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTgg < 1:729804/91‑1 (MQ=255) aaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGc > 2:37483/1‑91 (MQ=255) aaaaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGc < 1:941435/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:2440058/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:1533812/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:538570/91‑1 (MQ=255) aaTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATCCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCaa < 1:3814546/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat < 1:2023466/91‑1 (MQ=255) aTTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAat > 1:1591296/1‑91 (MQ=255) ttCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAata < 2:1408132/91‑1 (MQ=255) tCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAatat < 1:2485544/91‑1 (MQ=255) cATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAAtata < 1:2851092/91‑1 (MQ=255) cATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAAtata < 1:2296416/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc > 1:2858715/1‑91 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc < 1:1170455/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc < 2:22017/91‑1 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc > 1:1484549/1‑91 (MQ=255) aTGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATAc > 1:3301156/1‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt > 1:2918468/1‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt > 1:659673/1‑91 (MQ=255) tGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACt < 2:2333799/91‑1 (MQ=255) gAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtt > 1:2006055/1‑91 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:2775404/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:889553/91‑1 (MQ=255) aTAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACtttt < 1:170902/91‑1 (MQ=255) aaaTTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTaa < 1:510872/91‑1 (MQ=255) aCCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt < 1:1047477/91‑1 (MQ=255) aCCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 2:1910702/1‑91 (MQ=25) aCCAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGAttt > 1:2172801/1‑91 (MQ=25) cAAGAATGCGATTAATCATCACATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaa > 1:1251606/1‑91 (MQ=25) aaGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaat > 2:1762791/1‑91 (MQ=255) aaGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaat < 2:2372287/91‑1 (MQ=255) aGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTtaata < 2:3301156/91‑1 (MQ=255) aaTGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTAATATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATaaa > 2:3477801/1‑91 (MQ=255) tgtgATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAaca < 2:3053664/91‑1 (MQ=255) tgtgATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAaca < 2:2754126/91‑1 (MQ=255) tgatgaTTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACAcc < 1:442045/91‑1 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 2:1584625/1‑91 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 2:2859644/1‑91 (MQ=255) atgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCaa > 1:157455/1‑91 (MQ=255) tgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAat < 2:2880479/91‑1 (MQ=255) tgatTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAat < 1:3334093/91‑1 (MQ=255) aaTCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAATATTTc < 2:487525/91‑1 (MQ=255) | CGATTAAAGTTAATTTAAATTCAGACAATAACTTAACGTTTAATGTTGAAAAAATTCATGAATAAAATTGAACCAAGAATGTGATGATTAATCGCATTCTTGGTTTTTTAGATTTGAAATTTATTATAATTGTTCATTGGCAATATACTTTTTAAATGATTTAATAAACACCAATATTTC > USA300TCH1516_ALE/979266‑979445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |