| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,137,597 | T→C | 5.8% | S213S (TCA→TCG) | isdB ← | Iron‑regulated surface determinant protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,137,597 | 0 | T | C | 5.8% | 828.1 / 26.2 | 260 | S213S (TCA→TCG) | isdB | Iron‑regulated surface determinant protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (138/106); new base C (8/7); total (146/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
ATTGAAGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAATTTCT > USA300TCH1516_ALE/1137507‑1137687 | aTTGAAGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTAt > 1:302082/1‑91 (MQ=255)aTTGAAGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTAt > 2:2312170/1‑91 (MQ=255)aTTGAAGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTAt > 2:2557231/1‑91 (MQ=255)aTTGAAGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTAt > 2:3699126/1‑91 (MQ=255) gAAGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGAt > 1:1379968/1‑91 (MQ=255) gAAGAGTGTTGCACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGCTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGAt > 2:1941538/1‑91 (MQ=255) aGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATAc < 1:2691181/91‑1 (MQ=255) gtgtgtTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACt > 1:244668/1‑91 (MQ=255) gtgtgtTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACt < 1:762033/91‑1 (MQ=255) tgtgtTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACta > 2:748936/1‑91 (MQ=255) tgtTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACtaat > 1:2894730/1‑91 (MQ=255) gtTGAACTTACGATTTTAACTGCTTTTGTTCCATTTGAAACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAGTCTTTAACAGTATCATATGATACtaatt > 1:844152/1‑91 (MQ=25) gtTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCATACGATACtgtta < 1:1245011/91‑5 (MQ=255) tGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACtaattta < 2:590051/91‑1 (MQ=255) tGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACtaattta > 1:1513083/1‑91 (MQ=255) gAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACtaatttaa > 1:233187/1‑91 (MQ=255) cTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTg > 2:609679/1‑91 (MQ=255) tAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTgg < 1:1077273/91‑1 (MQ=255) tAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTgg < 2:1832508/91‑1 (MQ=255) aaCAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGc > 2:1658061/1‑91 (MQ=255) aaCAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGc < 1:677243/91‑1 (MQ=255) aaCAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGc > 1:1883080/1‑91 (MQ=255) cAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCaa < 2:853107/91‑1 (MQ=255) cAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCaa < 1:2800906/91‑1 (MQ=255) aaTTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAAc > 2:874634/1‑91 (MQ=255) aaTTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAAc < 1:268112/91‑1 (MQ=255) aTTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACt > 2:1758058/1‑91 (MQ=255) aTTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACt > 2:1758024/1‑91 (MQ=255) aTTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACt > 1:2995685/1‑91 (MQ=255) ttttAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACtt > 1:3644702/1‑91 (MQ=255) tttAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACttt < 1:1916832/91‑1 (MQ=255) tAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACttttt > 1:992592/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGt > 2:1234114/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGt > 1:1150413/1‑91 (MQ=255) cAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTc < 1:1620257/91‑1 (MQ=255) cAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTc < 2:33345/91‑1 (MQ=255) aGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCa > 1:2927392/1‑91 (MQ=255) gCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCAc < 2:488879/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCAc < 1:2858781/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCAc < 2:1978082/91‑1 (MQ=255) cTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCAcc < 1:3514756/91‑1 (MQ=255) cTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCAcc > 1:1264409/1‑91 (MQ=255) cTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCAcc > 1:2193956/1‑91 (MQ=255) cTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCAcc < 2:1605144/91‑1 (MQ=255) tttGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCtt < 1:3215961/91‑1 (MQ=255) ttGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTc > 2:1431125/1‑91 (MQ=255) tGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCa < 2:502442/91‑1 (MQ=255) tGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCa < 2:2458920/91‑1 (MQ=255) gTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCAt < 1:3201518/91‑1 (MQ=255) ttCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATa < 1:3471752/91‑1 (MQ=255) ccGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATaaa < 1:530120/91‑1 (MQ=255) gtatGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATTAACt < 2:1518640/88‑1 (MQ=255) gTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACt < 1:1026872/91‑1 (MQ=255) gTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACt > 2:2223213/1‑91 (MQ=255) gTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACt > 2:2695839/1‑91 (MQ=255) ttGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTc > 2:3080815/1‑91 (MQ=255) ttGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTc < 2:789949/91‑1 (MQ=255) tGATACAGAGAAGCGAGTGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCa < 2:3713041/91‑1 (MQ=255) aTACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCaaa < 2:2995685/91‑1 (MQ=255) aTACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCaaa < 1:2287547/91‑1 (MQ=255) cAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAAttt < 2:1185666/91‑1 (MQ=255) agagAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAAtttt > 1:964776/1‑91 (MQ=255) gagaAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTtc < 2:32315/91‑1 (MQ=255) gagaAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTtc < 1:1691247/91‑1 (MQ=255) aaGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTcc < 2:38850/91‑1 (MQ=255) gCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCaa < 2:157192/91‑1 (MQ=255) gCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCaa < 2:158472/91‑1 (MQ=255) gCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATCTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCaa > 2:2988631/1‑91 (MQ=255) cGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCaaa > 1:1305852/1‑91 (MQ=255) gTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGa > 2:3152796/1‑91 (MQ=255) tAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGAc > 2:3611771/1‑91 (MQ=255) tAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGAc > 2:2601985/1‑91 (MQ=255) aGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCt < 1:2351790/91‑1 (MQ=255) gCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTg < 2:3767226/91‑1 (MQ=255) gCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTg > 1:2144427/1‑91 (MQ=255) gCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTg < 1:653448/91‑1 (MQ=255) aTAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGAt < 1:1786788/91‑1 (MQ=255) tCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTa < 1:211183/91‑1 (MQ=255) ttAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATc > 2:1340888/1‑91 (MQ=255) tAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATcc > 2:1132872/1‑91 (MQ=255) aaCAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCt > 2:2815725/1‑91 (MQ=255) aaCAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCt < 1:3848246/91‑1 (MQ=255) aaCAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCt > 1:94065/1‑91 (MQ=255) aaCAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCt < 1:2739985/91‑1 (MQ=255) aaCAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCAT‑AACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTa > 2:3278647/1‑91 (MQ=255) ttaGTATCATACGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTa > 2:3378478/3‑91 (MQ=37) ttaGTATCATACGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTa > 1:3833682/3‑91 (MQ=37) cAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTaa > 2:2845510/1‑91 (MQ=255) aGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAAt > 2:268214/1‑91 (MQ=255) gTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAAtt > 2:2060993/1‑91 (MQ=255) tATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTc < 2:1477331/91‑1 (MQ=255) aTCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCa < 1:479071/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAAtt < 1:3115521/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAAtt < 1:3284650/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAAtt < 1:116920/91‑1 (MQ=255) gTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAAtt > 2:3464711/1‑91 (MQ=255) tATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAAttt > 1:1294319/1‑91 (MQ=255) tATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAAttt > 1:3805730/1‑91 (MQ=255) tATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAAttt > 2:1630964/1‑91 (MQ=255) tGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAATTTCt > 1:1415025/1‑91 (MQ=255) | ATTGAAGTGTGTTGAACTAACAATTTTAACAGCTTTTGTTCCGTTTGATACAGAGAAGCGAATGTAAGCATAATCTTTAACAGTATCGTATGATACTAATTTAATTGGCAACTTTTTGTCACCTTCATAAACTTCAAATTTTCTCCAAAATTGACCTGATTGTAATCCTAATTCAATTTCT > USA300TCH1516_ALE/1137507‑1137687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |