| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,254,017 | A→T | 6.9% | intergenic (+114/‑74) | rpsP → / → rimM | 30S ribosomal protein S16/Ribosome maturation factor RimM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,254,017 | 0 | A | T | 6.9% | 826.8 / 34.6 | 246 | intergenic (+114/‑74) | rpsP/rimM | 30S ribosomal protein S16/Ribosome maturation factor RimM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (124/105); new base T (2/15); total (126/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
ATAAGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTGG > USA300TCH1516_ALE/1253927‑1254107 | aaGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAAt < 2:854299/91‑1 (MQ=255) aaGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAAt > 2:2738889/1‑91 (MQ=255) aGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATg < 2:3762617/91‑1 (MQ=255) aGAATAACTCGTGTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATg < 2:683997/91‑1 (MQ=255) gAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATgg < 2:78818/91‑1 (MQ=255) gAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGCATTGGGTACCATAATgg > 1:3319701/1‑91 (MQ=255) gAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTAGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATgg > 1:3003888/1‑91 (MQ=255) aaTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGt > 2:1980355/1‑91 (MQ=255) aaTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGt < 1:2614173/91‑1 (MQ=255) aaTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGt < 1:3458305/91‑1 (MQ=255) aaTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGt < 1:2595320/91‑1 (MQ=255) aTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTg > 2:3311019/1‑91 (MQ=255) aTAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTg > 2:426675/1‑91 (MQ=255) tAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGc < 2:1304033/91‑1 (MQ=255) tAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGc < 1:1288784/91‑1 (MQ=255) aaCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGCACCATTATGGtacc < 1:970238/91‑4 (MQ=255) aaCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAACATCACATGTTAGTAATATAGAACCTATTGGGTACCATAATGGTGcc > 2:3128006/1‑91 (MQ=255) aCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGccc < 1:721072/91‑1 (MQ=255) aCTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGccc < 2:45954/91‑1 (MQ=255) cTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCt > 2:3285374/1‑91 (MQ=255) cTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCt < 2:1376670/91‑1 (MQ=255) tCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCtt < 1:1022366/91‑1 (MQ=255) ttACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTc < 2:2262432/91‑1 (MQ=255) ttACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTc < 1:2348665/91‑1 (MQ=255) acacTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCtt > 1:1961940/1‑91 (MQ=255) cacTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCttt < 2:704074/91‑1 (MQ=255) cTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGa > 1:2261262/1‑91 (MQ=255) gACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAat > 1:101140/1‑91 (MQ=255) gACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAat > 2:2659572/1‑91 (MQ=255) aGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAattat < 1:1259287/91‑1 (MQ=255) gTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAattatt > 2:512868/1‑91 (MQ=255) ttattaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTAttt < 2:1141367/91‑1 (MQ=255) ttattaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTAttt > 1:1080451/1‑91 (MQ=255) tattaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTActtt > 1:3132314/1‑91 (MQ=255) attaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTc > 1:575583/1‑91 (MQ=255) ttaCTCAATGATACGTTGGTCATATCCCATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTcc > 1:1684087/1‑90 (MQ=255) ttaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCa > 1:2919525/1‑91 (MQ=255) ttaCTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCa < 2:3694089/91‑1 (MQ=255) cTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAAtt < 1:1804032/91‑1 (MQ=255) tCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTa > 2:3515092/1‑91 (MQ=255) tCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTa > 2:1993956/1‑91 (MQ=255) aaTGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTaaa > 1:2850462/1‑91 (MQ=255) aaTGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTaaa > 1:657602/1‑91 (MQ=255) aTGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTaaaa < 1:2797239/91‑1 (MQ=255) tGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAAt > 2:2319709/1‑91 (MQ=255) aCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGaa > 2:1799895/1‑91 (MQ=255) aCGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGaa > 1:2243910/1‑91 (MQ=255) cGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAg > 2:1455399/1‑91 (MQ=255) ttGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtg > 1:2389985/1‑91 (MQ=255) ttGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtg < 1:1535512/91‑1 (MQ=255) tGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtgt < 2:3509740/91‑1 (MQ=255) tGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtgt < 2:652564/91‑1 (MQ=255) tGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAgtgt < 1:500822/91‑1 (MQ=255) aaTATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCaa < 2:1684669/91‑1 (MQ=255) atatCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCaaa < 2:1656013/91‑1 (MQ=255) atCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGc < 2:2054568/91‑1 (MQ=255) atCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGc > 2:3670501/1‑91 (MQ=255) atCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGc > 1:3597578/1‑91 (MQ=255) tCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCa < 2:2509424/91‑1 (MQ=255) cacaTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCAt < 1:1348203/91‑1 (MQ=255) acaTG‑TAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATag < 2:730030/91‑1 (MQ=255) caTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATag > 2:1050308/1‑91 (MQ=255) caTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATag < 1:3215429/91‑1 (MQ=255) aTGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATaga < 2:26241/91‑1 (MQ=255) ttAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGtt < 1:1821133/91‑1 (MQ=255) aGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTgg > 1:190202/1‑91 (MQ=255) aGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTgg > 1:2943350/1‑91 (MQ=255) gTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGa > 2:2117904/1‑91 (MQ=255) ataGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTaa > 1:2380737/1‑91 (MQ=255) taGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAAt > 2:1085613/1‑91 (MQ=255) taGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAAt > 2:1085476/1‑91 (MQ=255) aGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCCTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATa < 2:2576631/91‑1 (MQ=255) aaCGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGa > 1:2201744/1‑91 (MQ=255) aaCGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGa < 2:1015609/91‑1 (MQ=255) aaCGTATGGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGa < 2:3447450/91‑1 (MQ=255) aCGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGaa < 1:2185603/91‑1 (MQ=255) aCGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGaa < 1:3444132/91‑1 (MQ=255) aCGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGaa < 1:374746/91‑1 (MQ=255) gTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATg > 2:3844811/1‑91 (MQ=255) tATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATga < 2:749224/91‑1 (MQ=255) aTTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATgag > 1:1151877/1‑91 (MQ=255) aTTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATgag > 2:3253133/1‑91 (MQ=255) ttGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATgaga > 1:1601261/1‑91 (MQ=255) tGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGagag < 1:3670501/91‑1 (MQ=255) gggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGt > 2:1622434/1‑91 (MQ=255) gggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGt > 1:2024711/1‑91 (MQ=255) gggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGt < 2:3003962/91‑1 (MQ=255) ggtgccATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGtt > 1:452437/5‑91 (MQ=255) ggcaCCATTATGGTACCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGtt > 1:3659740/4‑91 (MQ=255) ggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGtt < 2:575583/91‑1 (MQ=255) ggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGtt < 1:2659572/91‑1 (MQ=255) ggTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGtt < 1:816475/91‑1 (MQ=255) tACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGa > 2:2770713/1‑91 (MQ=255) ccATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAg < 1:915897/91‑1 (MQ=255) cATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGt > 2:3099909/1‑91 (MQ=255) aTAATGGTGCCCTTTTTTTTTTAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGtt > 2:3406758/1‑91 (MQ=255) aTAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGtt > 1:288397/1‑91 (MQ=255) aaTGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTgg < 1:3390359/91‑1 (MQ=255) aaTGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTgg < 2:2901030/91‑1 (MQ=255) aaTGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTgg < 2:1326718/91‑1 (MQ=255) | ATAAGAATAACTCGTTTACACTGACAGTTATTACTCAATGATACGTTGGGAATATCACATGTTAGTAATATAGAACGTATTGGGTACCATAATGGTGCCCTTTTTCTTTGAATTATTTTCAATTAAAATAGAAGTGTTCAAAGCATAGAGTTGGAGGTAATAGAATGAGAGTTGAAGTTGG > USA300TCH1516_ALE/1253927‑1254107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |