| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,366,121 | A→T | 12.2% | intergenic (+420/‑34) | rpmG2_1 → / → rpsN2 | 50S ribosomal protein L33 2/Alternate 30S ribosomal protein S14 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,366,121 | 0 | A | T | 12.2% | 654.6 / 70.0 | 221 | intergenic (+420/‑34) | rpmG2_1/rpsN2 | 50S ribosomal protein L33 2/Alternate 30S ribosomal protein S14 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (96/98); new base T (14/13); total (110/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TAAATATGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGTAAATAAA > USA300TCH1516_ALE/1366031‑1366211 | tAAATATGATGGTTTAGAAAATGCTTTAACAAAGAAATGAAACGTTACTGGTGAGTTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAAGCGtaata < 2:3607595/91‑1 (MQ=255) aaaTATGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGtaataa > 2:2648252/1‑91 (MQ=255) tatGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTa < 1:716132/91‑1 (MQ=255) tatGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTa < 1:3231804/91‑1 (MQ=255) atgatgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTAc < 2:870889/91‑1 (MQ=255) atgatgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTAc < 1:1525314/91‑1 (MQ=255) gatgGTTTAGAACATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGa > 1:2975494/1‑91 (MQ=255) gatgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTACGa > 1:1335145/1‑91 (MQ=255) gatgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGa > 1:2574997/1‑91 (MQ=255) atgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAt > 2:1773909/1‑91 (MQ=255) atgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAt > 1:1467003/1‑91 (MQ=255) tgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAtt < 2:1756787/91‑1 (MQ=255) tgGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGAtt > 2:2286907/1‑91 (MQ=255) gTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTACGAttta < 1:59675/91‑2 (MQ=255) gTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTg > 1:1432856/1‑91 (MQ=255) tttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGa < 1:2102564/91‑1 (MQ=255) tttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGa < 1:1078296/91‑1 (MQ=255) ttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTACGAtttata < 2:2998505/91‑4 (MQ=255) ttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATTATTACGAtttata < 1:3385988/91‑4 (MQ=255) ttAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGAt < 1:3815458/91‑1 (MQ=255) tAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATa > 1:355069/1‑91 (MQ=255) tAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATa > 1:1111089/1‑91 (MQ=255) aGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATaa > 1:2636086/1‑91 (MQ=255) gAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATaaa < 2:574590/91‑1 (MQ=255) aaaaTGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATaaaa < 2:1179580/91‑1 (MQ=255) gATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGa < 1:2228071/91‑1 (MQ=255) gATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGa < 2:2429895/91‑1 (MQ=255) gATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAAGCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGa < 1:1644586/91‑1 (MQ=255) aTTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTCTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAg > 2:2208346/1‑91 (MQ=255) tttAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAgg < 2:130637/91‑1 (MQ=255) ttAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGt > 2:2890962/1‑91 (MQ=255) ttAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGt > 2:2035604/1‑91 (MQ=255) ttAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGt > 2:2167178/1‑91 (MQ=255) tAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTa > 2:1643629/1‑91 (MQ=255) tAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTa < 2:3212378/91‑1 (MQ=255) aCAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAAc < 1:2956953/91‑1 (MQ=255) aCAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAAc > 1:77389/1‑91 (MQ=255) aCAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAAc < 2:1866299/91‑1 (MQ=255) aGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACtata > 2:2598321/1‑91 (MQ=255) aGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACtata < 2:3252581/91‑1 (MQ=255) gAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACtatat > 1:3493065/1‑91 (MQ=255) gAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACtatat < 1:3637425/91‑1 (MQ=255) aaTGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTatatat < 2:2330624/91‑1 (MQ=255) aTGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATg < 2:206074/91‑1 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg > 2:706562/1‑91 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg < 1:1799904/91‑1 (MQ=255) tGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATgg > 1:3167371/1‑91 (MQ=255) aaaCTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCt > 1:2049031/1‑91 (MQ=255) aaaCTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATAGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGCTTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCt > 2:492111/1‑91 (MQ=255) aaCTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATTGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTa < 2:3480326/91‑1 (MQ=255) aaCTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTa > 2:2194043/1‑91 (MQ=255) aaCTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTa < 2:2379161/91‑1 (MQ=255) aCTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTaa > 2:3862605/1‑91 (MQ=255) cTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAg > 1:3862246/1‑91 (MQ=255) cTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAg < 2:344256/91‑1 (MQ=255) cTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAg < 2:1467003/91‑1 (MQ=255) tttACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGa < 1:463774/91‑1 (MQ=255) tACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGaaa > 1:2557792/1‑91 (MQ=255) tACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGaaa > 2:272795/1‑91 (MQ=255) tACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGaaa < 1:1603208/91‑1 (MQ=255) tGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCt < 2:1819510/91‑1 (MQ=255) aTTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAATGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATa < 2:3650734/91‑1 (MQ=255) ttATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAg > 2:890865/1‑91 (MQ=255) ttATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAg < 2:1975504/91‑1 (MQ=255) tATGTGAGGATTGTGTTATTCTATAGATCGTAATATTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGTCTAAGAAATCTAAAATAGc < 2:2108713/91‑1 (MQ=255) gtgAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCaaa > 2:3258459/1‑91 (MQ=255) gAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGGGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAag < 1:1773892/91‑1 (MQ=255) gAGGATTCTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAag < 1:1941436/91‑1 (MQ=255) aGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGAaaaaaa < 2:3814291/91‑3 (MQ=255) gtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaaaaa < 1:3352773/91‑1 (MQ=255) gtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaaaaa < 1:119847/91‑1 (MQ=255) gtTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGaaaaa > 1:3257126/1‑91 (MQ=255) tatataAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagagaa < 1:1095423/91‑1 (MQ=255) tatataAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAaagagaa < 1:2320227/91‑1 (MQ=255) taAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGt < 1:1931757/91‑1 (MQ=255) caaaTCGTAATTATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGt > 1:656157/2‑91 (MQ=255) aaaTCGTAATTATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGtt > 2:2340072/1‑91 (MQ=255) aaaTCGTAATTATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGtt > 2:3782612/1‑91 (MQ=255) aaaTCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGtt > 1:1422593/1‑91 (MQ=255) aaaTCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGtt < 1:1713343/91‑1 (MQ=255) aaaTCGTAATAATTACGATATGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGtt < 2:2254720/91‑1 (MQ=255) aaTCGTAATTATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTa > 1:3041631/1‑91 (MQ=255) aTCGTAATTATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAg > 1:1388537/1‑91 (MQ=255) aTCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAg > 1:461891/1‑91 (MQ=255) aTCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAg > 1:416062/1‑91 (MQ=255) aTCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAg > 1:808436/1‑91 (MQ=255) tCGTAATTATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGt > 1:2723429/1‑91 (MQ=255) tCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGt > 2:2572770/1‑91 (MQ=255) gTAATTATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAGAAGAGAAGAGTTAGtaa > 1:3329593/1‑91 (MQ=255) gTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaa < 2:1001918/91‑1 (MQ=255) gTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaa > 1:216705/1‑91 (MQ=255) taattaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 2:197000/1‑91 (MQ=255) taattaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 1:527787/1‑91 (MQ=255) taattaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 2:1290815/1‑91 (MQ=255) taattaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 2:3681171/1‑91 (MQ=255) taattaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 1:2839874/1‑91 (MQ=255) taattaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 1:416709/1‑91 (MQ=255) taataaTTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaa > 1:791199/1‑91 (MQ=255) aataatTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaat > 2:281223/1‑91 (MQ=255) aataatTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGtaaat < 2:3318219/91‑1 (MQ=255) | TAAATATGATGGTTTAGAAAATGATTTAACAAAGAAATGAAACTTTACTGTTGAATTATGTGAGGATTGTGTTATTATATAAATCGTAATAATTACGATTTGATAAAAAGTGAGGTAACTATATATGGCTAAGAAATCTAAAATAGCAAAAGAGAGAAAAAGAGAAGAGTTAGTAAATAAA > USA300TCH1516_ALE/1366031‑1366211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |