| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,394,305 | A→G | 7.9% | T178T (ACA→ACG) | tqsA → | AI‑2 transport protein TqsA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,394,305 | 0 | A | G | 7.9% | 650.6 / 33.9 | 215 | T178T (ACA→ACG) | tqsA | AI‑2 transport protein TqsA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (114/84); new base G (13/4); total (127/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TATGTTAAGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGAAAAGATT > USA300TCH1516_ALE/1394215‑1394393 | tATGTTAAGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCacaaca < 1:2358423/91‑1 (MQ=255) aTGTTAAGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAacac < 2:1646770/91‑1 (MQ=255) ttAAGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAATATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCAt > 2:3817230/1‑91 (MQ=255) ttAAGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCAt < 2:2407765/91‑1 (MQ=255) tAAGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCAtt > 1:2252191/1‑91 (MQ=255) aaGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGGCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGTGTTGTGACAATCACAACGCCaata < 2:3359104/91‑4 (MQ=25) aaGTGAATTTAAAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGTGTTGTGACAATCACAACGCCaata < 1:3525075/91‑4 (MQ=25) aGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCACCGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTg < 2:719065/91‑1 (MQ=255) aGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTg < 1:1402375/91‑1 (MQ=255) tGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTa > 2:3019227/1‑91 (MQ=255) gAATTTACAGATGACTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGTAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTAc < 1:3876404/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACt < 2:435667/91‑1 (MQ=255) aaTTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACt < 2:434994/91‑1 (MQ=255) aTTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAATGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTa < 1:3093038/91‑1 (MQ=255) aTTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTa > 2:2190674/1‑91 (MQ=255) tttACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTAt > 1:2822468/1‑91 (MQ=255) tttACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTAt < 2:2086730/91‑1 (MQ=255) tACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTc < 1:397991/91‑1 (MQ=255) tACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTc > 2:1328504/1‑91 (MQ=255) tACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTc > 1:1105253/1‑91 (MQ=255) tACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATCTGTACTATTc > 2:3586038/1‑91 (MQ=255) aCAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCt < 2:3328056/91‑1 (MQ=255) aGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGCCACAACACCATTTGTACTATTCttt > 1:3609038/1‑91 (MQ=255) aTGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTAt > 1:1899945/1‑91 (MQ=255) aTGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTAt > 1:59546/1‑91 (MQ=255) ggCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGc < 2:2860642/91‑1 (MQ=255) ggCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGc < 2:2528465/91‑1 (MQ=255) cTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCtt < 1:3381050/91‑1 (MQ=255) cTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCtt < 2:147964/91‑1 (MQ=255) tttGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAATGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTa < 2:105713/91‑1 (MQ=255) tttGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTa > 1:3129396/1‑91 (MQ=255) tttGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGATTa > 1:3129627/1‑91 (MQ=255) ttGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTaa > 1:2293176/1‑91 (MQ=255) ggTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGa < 1:95433/91‑1 (MQ=255) ggTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGa > 2:1668978/1‑91 (MQ=255) cTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATgg > 2:1835498/1‑91 (MQ=255) aaTTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACAt < 1:2123690/91‑1 (MQ=255) ttGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCa > 2:753093/1‑91 (MQ=255) ttGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCa > 1:99176/1‑91 (MQ=255) gCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACt > 1:1845758/1‑91 (MQ=255) gCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACt > 1:1741110/1‑91 (MQ=255) cAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACtt > 1:1156170/1‑91 (MQ=255) aaCGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTc < 2:308245/91‑1 (MQ=255) aaCGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACACCACTTc < 1:3015252/91‑1 (MQ=255) aCGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCa > 2:3270159/1‑91 (MQ=255) aCGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCa < 2:3392592/91‑1 (MQ=255) aCGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCa > 2:1208116/1‑91 (MQ=255) gTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCaaa > 1:110984/1‑91 (MQ=255) gTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCaaa > 1:1382215/1‑91 (MQ=255) gTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCaaa < 1:1978810/91‑1 (MQ=255) gCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAAt > 2:2127700/1‑91 (MQ=255) cAGAAACGACTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAAtt > 1:1953438/1‑91 (MQ=255) aGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAAttt > 1:2642063/1‑91 (MQ=255) gAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAAtttt > 1:518245/1‑91 (MQ=255) gAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAAtttt > 2:1953156/1‑91 (MQ=255) aaaCGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTc > 1:2151367/1‑91 (MQ=255) aCGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCaa < 2:3552663/91‑1 (MQ=255) aTTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGa > 1:876561/1‑91 (MQ=255) aTTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGa > 1:464940/1‑91 (MQ=255) ttGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGaa > 1:559457/1‑91 (MQ=255) tGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAat > 1:1681810/1‑91 (MQ=255) tGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAat > 2:415700/1‑91 (MQ=255) cTAATATTGGCGTTGAGATTGTCACAACACCATTTGTACTGTTCTTTATGCTTAAAGATGGCCATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAatat > 2:3190447/1‑91 (MQ=255) aaTATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAAtatta > 1:844136/1‑91 (MQ=255) atatTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAAtattat < 1:2495325/91‑1 (MQ=255) tatTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATg > 1:3764560/1‑91 (MQ=255) atTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGc > 2:578947/1‑91 (MQ=255) ttGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGcc < 1:2207222/91‑1 (MQ=255) tGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCa < 2:3241223/91‑1 (MQ=255) gCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCAcc > 2:3746960/1‑91 (MQ=255) cGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCg > 2:845159/1‑91 (MQ=255) gTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGa < 2:3427565/91‑1 (MQ=255) ttGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGaa > 2:2157323/1‑91 (MQ=255) ttGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGaa > 1:2713787/1‑91 (MQ=255) gtgATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAAt < 2:3010117/91‑1 (MQ=255) gtgATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAAt > 1:2558652/1‑91 (MQ=255) gtgATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAAt > 1:384199/1‑91 (MQ=255) acaatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTcc > 2:2709573/5‑91 (MQ=255) acaatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTcc > 2:2709418/5‑91 (MQ=255) acaatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTcc > 1:1251481/5‑91 (MQ=255) acaatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTcc > 2:2328532/5‑91 (MQ=255) acaatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTcc > 1:3441099/5‑91 (MQ=255) acaatCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTcc > 2:940403/5‑91 (MQ=255) aTTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTcc < 2:2256004/91‑1 (MQ=255) ttGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCg > 2:2613094/1‑91 (MQ=255) ttGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCg > 2:546813/1‑91 (MQ=255) caatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCg > 1:335703/4‑91 (MQ=255) caatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCg > 1:3865808/4‑91 (MQ=255) caatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCg > 2:677501/4‑91 (MQ=255) caatCACAACGCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCg > 2:2813889/4‑91 (MQ=255) tGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGa < 2:12976/91‑1 (MQ=255) gTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGaa < 1:2432650/91‑1 (MQ=255) gTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGaa < 1:740497/91‑1 (MQ=255) gTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGaa < 1:1038430/91‑1 (MQ=255) gTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGaa < 2:2083694/91‑1 (MQ=255) acaacaCCATTTGTATTATTCTTCATGCTGAAAGATGGACATCATTTCAAAGAATTTTCAACAAATATTATGCCGCCAAAATTCCGAAAAg < 1:1471118/91‑1 (MQ=255) acaacaCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGAAAAg < 2:3041226/91‑1 (MQ=255) acaacaCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGAAAAg > 2:1744269/1‑91 (MQ=255) acaacaCCATCTGTACCATTCTGTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAGAGAATGTTCAACGAGTATTATGCCACCGAGATTCCGAAAAg < 2:3041355/91‑1 (MQ=255) aacaCCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGAAAAGAt > 2:1667038/1‑91 (MQ=255) | TATGTTAAGTGAATTTACAGATGGCTTTGGGTCTAAAATTGCAACGTTTGCAGAAACGATTGCTAATATTGGCGTTGTGATTGTCACAACACCATTTGTACTATTCTTTATGCTTAAAGATGGACATCACTTCAAAGAATTTTCAACGAATATTATGCCACCGAAATTCCGAAAAGATT > USA300TCH1516_ALE/1394215‑1394393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |