| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000731 | 5,784 | A→G | 8.6% | intergenic (+301/‑1187) | cadX → / → USA300HOU_pUSA300HOUMR0010 | cadmium efflux regulator/MarR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000731 | 5,784 | 0 | A | G | 8.6% | 1899.7 / 127.0 | 648 | intergenic (+301/‑1187) | cadX/USA300HOU_pUSA300HOUMR0010 | cadmium efflux regulator/MarR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (305/287); new base G (45/11); total (350/298) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 681 total aligned reads displayed.
GCGTATTATACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGAATTA > CP000731/5694‑5874 | GCGTATTATACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCaa > 1:2026778‑M1/1‑91 (MQ=255)GCGTATTATACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCaa < 1:1951015‑M1/91‑1 (MQ=255)GCGTATTATACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCaa < 1:1853029‑M1/91‑1 (MQ=255) CGTATTATACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAAt < 1:2874114‑M1/91‑1 (MQ=255) CGTATTATACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTACAAt < 1:2768480‑M1/91‑1 (MQ=255) CGTATTATACTTATTGGCTTAGGAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAAt > 1:2242722‑M1/1‑91 (MQ=255) attatACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAgt < 2:3393846/91‑1 (MQ=255) ttatACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTATATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAgtg < 2:2993819/91‑1 (MQ=255) ataCTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGtgtg < 1:3240471/91‑1 (MQ=255) ataCTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGtgtg > 2:2824868/1‑91 (MQ=255) ataCTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATAGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGtgtg > 2:632377/1‑91 (MQ=255) taCTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTATTGCAGTAGTGTgg < 2:35298/91‑1 (MQ=255) taCTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTATTGCAGTAGTGTgg < 1:3301170/91‑1 (MQ=255) aCTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGCggg > 2:2232949/1‑91 (MQ=255) cTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTgggg < 1:1704630/91‑1 (MQ=255) cTTATTGGCGTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAAGCCCCACACTATTGCAGTAGTGTgggg < 1:1766072/91‑1 (MQ=38) ggCTTAGTAAACGCAACAAATAACTCATAGGCGTCCTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGt < 1:1283351/91‑1 (MQ=255) gCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTg < 2:1865789/91‑1 (MQ=255) cTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGc < 2:2720142/91‑1 (MQ=255) ttAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCa < 1:2824868/91‑1 (MQ=255) ttAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCa < 2:80999/91‑1 (MQ=255) tAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCAt < 1:38902/91‑1 (MQ=255) tAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCAt < 1:1367758/91‑1 (MQ=255) tAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCAt > 1:1817451/1‑91 (MQ=255) aGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCAtt > 2:21315/1‑91 (MQ=255) aGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCAtt > 2:3310495/1‑91 (MQ=255) gTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTACAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTa > 2:3616160/1‑91 (MQ=255) tAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTaa > 2:1388934/1‑91 (MQ=255) aaCGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAAtt > 1:111857/1‑91 (MQ=255) gcaacaAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGtt < 1:693219‑M2/85‑1 (MQ=255) gcaacaAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGtt < 1:3743597‑M2/85‑1 (MQ=255) acaAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAAt > 1:810636‑M2/4‑91 (MQ=255) caAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATc < 2:2759252‑M2/89‑1 (MQ=255) aataatTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCAt > 2:1585401/1‑91 (MQ=255) ataatTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCAtt < 2:860788/91‑1 (MQ=255) aattaatAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCAtttt > 2:1670475/1‑91 (MQ=255) ttaatAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCg < 1:294589/91‑1 (MQ=255) taatAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATGGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGt > 1:862925/1‑91 (MQ=255) aatAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGtt > 2:1331455/1‑91 (MQ=255) aGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTtata < 2:3827164/91‑1 (MQ=255) aGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCAGTAATTGTTAATCATTTTCGTtata > 2:3595766/1‑91 (MQ=255) ggCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTtatat < 2:3761976/91‑1 (MQ=255) ggCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTtatat < 2:522661/91‑1 (MQ=255) gCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTtatata > 2:92397/1‑91 (MQ=255) cGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATaa < 1:2349474/91‑1 (MQ=255) cGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATaa < 1:3715796/91‑1 (MQ=255) gACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATaaa < 1:2549496/91‑1 (MQ=255) gACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATaaa < 1:761480/91‑1 (MQ=255) aCTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAAt > 1:264832/1‑91 (MQ=255) cTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAAtt > 1:2213578/1‑91 (MQ=255) cTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAAtt < 2:2627701/91‑1 (MQ=255) cTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAAtt < 1:3194594/91‑1 (MQ=255) ttATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATtat < 1:2740271/91‑1 (MQ=255) ttATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGAGTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATtat < 2:3187826/91‑1 (MQ=255) tataAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATtata > 2:2472948/1‑91 (MQ=255) taAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTtat > 2:1166251/1‑79 (MQ=255) taAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTtat < 1:1166251/79‑1 (MQ=255) taAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAac < 1:1529881/91‑1 (MQ=255) aaGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAaca < 1:3046473/91‑1 (MQ=255) aGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAacac < 1:3666377/91‑1 (MQ=255) aGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAacac > 2:1800326/1‑91 (MQ=255) aGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAacac < 2:2072401/91‑1 (MQ=255) cAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTgg < 1:956589/91‑1 (MQ=255) aaGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTgg < 2:2942810/90‑1 (MQ=255) gCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGt > 2:2324484/1‑45 (MQ=255) cATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTta > 2:2881450/1‑91 (MQ=255) aTCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTtag < 2:2005564/91‑1 (MQ=255) gAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTtagtag > 2:68527/1‑91 (MQ=255) gAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTtagtag > 2:1232738/1‑91 (MQ=255) aaaaaTCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATGAATTATAACACTGGTTAGTagag > 1:1000571/1‑91 (MQ=255) aaTCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGaaa > 1:2394184/1‑91 (MQ=255) ccccACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGc < 2:3249704/91‑1 (MQ=255) ccccACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGc < 1:2904453/91‑1 (MQ=255) ccACACTATTGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaa > 2:343113/1‑91 (MQ=255) ccACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCCTTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaa > 1:3088490/1‑91 (MQ=255) ccACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaa < 1:2194906/91‑1 (MQ=255) ccACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaa < 1:3592127/91‑1 (MQ=255) ccACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaa > 2:1003842/1‑91 (MQ=255) ccACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaa > 1:2449809/1‑91 (MQ=255) cacaCTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaaa > 1:625734/1‑91 (MQ=255) acacTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCaaaa > 1:2851308/1‑91 (MQ=255) cacTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAAt < 1:572981/91‑1 (MQ=255) ctactGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAACTTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGa > 2:2533542/1‑91 (MQ=255) ctactGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGa < 2:1746648/91‑1 (MQ=255) tattGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGAt > 1:3392099/4‑91 (MQ=255) tactGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGAt < 1:3145728/91‑1 (MQ=255) tactGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTACAGAAATGCAAAATGAt > 2:3709483/1‑91 (MQ=255) attGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGAtt > 1:1619941/3‑91 (MQ=255) ttGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTCGTAGAGAAATGCAAAATGATTg > 2:3119186/2‑91 (MQ=255) ttGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTg > 1:3470297/2‑91 (MQ=255) ttGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTg > 2:430470/2‑91 (MQ=255) tGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGa > 1:2124030/1‑91 (MQ=255) tGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGa > 1:3374153/1‑91 (MQ=255) tGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGa > 1:487864/1‑91 (MQ=255) tGCAGTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGa > 2:1505768/1‑91 (MQ=255) tGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGa > 2:763577/1‑91 (MQ=255) gCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGaa < 2:1447314/91‑1 (MQ=255) aaTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGAAtt < 1:147621/91‑1 (MQ=255) aaTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGAAtt > 1:3846387/1‑91 (MQ=255) aTAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGAATTa < 2:1924609/91‑1 (MQ=255) | GCGTATTATACTTATTGGCTTAGTAAACGCAACAAATAATTAATAGGCGACTTTATAAGCCAGCATCGAAAAAATCCCCACACTACTGCAATAGTGTGGGGATTGGTGCATTAATTGTTAATCATTTTCGTTATATAAATTATAACACTGGTTAGTAGAGAAATGCAAAATGATTGAATTA > CP000731/5694‑5874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |