| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,582,474 | G→A | 8.6% | H107H (CAC→CAT) | clpP1 ← | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,582,474 | 0 | G | A | 8.6% | 671.0 / 37.7 | 220 | H107H (CAC→CAT) | clpP1 | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (105/96); new base A (9/10); total (114/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TTTTTCAAGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGATGC > USA300TCH1516_ALE/1582384‑1582564 | tttCAAGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTtgtg > 2:209432/1‑91 (MQ=255) ttCAAGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGc < 2:2258426/91‑1 (MQ=255) aaGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATa < 2:1812572/91‑1 (MQ=255) aaGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATa < 2:67784/91‑1 (MQ=255) aaGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTATGCaca < 2:3438592/91‑3 (MQ=255) aaGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTATGCaca < 2:2775216/91‑3 (MQ=255) aGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATaa < 1:443725/91‑1 (MQ=255) aGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATaa < 1:2032687/91‑1 (MQ=255) aGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATaa > 1:2102193/1‑91 (MQ=255) aGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATaa < 1:2183874/91‑1 (MQ=255) aTCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATa > 1:466717/1‑91 (MQ=255) aTCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTATGCACAAAAATa < 1:925806/91‑1 (MQ=255) aTCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTATGCACAAAAATa < 1:1501750/91‑1 (MQ=255) ccGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAgt > 1:3861424/1‑91 (MQ=255) cGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTGATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAgtg < 2:3057876/91‑1 (MQ=255) cGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAgtg > 1:2702569/1‑91 (MQ=255) cGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAgtg < 1:407785/91‑1 (MQ=255) cGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTATGCACAAAAATAgtt < 1:2045486/91‑2 (MQ=255) gCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTATGCACAAAAATAgttt < 1:2845348/91‑3 (MQ=39) cTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTc > 2:2717679/1‑91 (MQ=255) gTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTcac < 1:1035234/91‑1 (MQ=255) tttcttAATTCTTCTGCATTACCTTCAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTcaccac < 2:2661243/91‑1 (MQ=255) tttcttAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTcaccac < 2:2073452/91‑1 (MQ=255) tcttAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTcac < 2:696220/86‑1 (MQ=255) ttAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCAt < 1:733007/91‑1 (MQ=255) tAATTCTGCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATa < 1:1952110/91‑1 (MQ=255) aTTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGc > 1:1301365/1‑91 (MQ=255) ttcttcTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCg > 2:3704763/1‑91 (MQ=255) ttctGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATa > 2:1021296/1‑91 (MQ=255) ctGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAac > 2:1632557/1‑91 (MQ=255) gCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAacac > 2:1996576/1‑91 (MQ=255) tACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAACCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGc < 2:1847837/91‑1 (MQ=255) aCCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCa > 1:2303175/1‑91 (MQ=255) aCCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCa < 2:254688/91‑1 (MQ=255) ccTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCaa > 1:3412876/1‑91 (MQ=255) cTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAAt < 2:1394420/91‑1 (MQ=255) tACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAAtt > 2:73242/1‑91 (MQ=255) caatCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGa < 2:811956/88‑1 (MQ=255) cAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGa < 2:565758/91‑1 (MQ=255) cAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGa < 1:83775/91‑1 (MQ=255) cAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGa > 2:446114/1‑91 (MQ=255) cAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGa < 1:742403/91‑1 (MQ=255) gTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATg < 2:3837169/91‑1 (MQ=255) aTAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGcct < 2:498058/91‑2 (MQ=255) aTAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCg < 1:789223/91‑1 (MQ=255) tAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGcctt < 1:1265412/91‑3 (MQ=255) tAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGcctt < 1:2218990/91‑3 (MQ=255) tAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGc > 2:3569673/1‑91 (MQ=255) tAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGc > 2:127501/1‑91 (MQ=255) aCCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGccttag < 2:1774780/91‑5 (MQ=255) aCCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGccttag < 2:3775440/91‑5 (MQ=255) aCCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTa < 2:2907529/91‑1 (MQ=255) aCCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTa < 2:934157/91‑1 (MQ=255) cccATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTaa > 1:3673167/1‑91 (MQ=255) aTGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGc > 1:2366722/1‑91 (MQ=255) aTGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGc > 1:2357639/1‑91 (MQ=255) aTGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGc > 2:2513437/1‑91 (MQ=255) aTGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCACAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGc > 1:3450170/1‑91 (MQ=255) aTGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACCCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAggg > 2:3848815/1‑90 (MQ=255) gAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCAt < 2:2605993/91‑1 (MQ=255) aaTTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATc > 1:3171492/1‑91 (MQ=255) aTTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCg > 1:580898/1‑91 (MQ=255) tATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGAc > 1:3260354/1‑91 (MQ=255) aTGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACa < 1:2706505/91‑1 (MQ=255) aTGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACa > 1:2440762/1‑91 (MQ=255) aTGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACa > 2:3212022/1‑91 (MQ=255) aTGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACa > 1:3766804/1‑91 (MQ=255) tGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACAt < 2:3067854/91‑1 (MQ=255) tGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACAt > 1:1848275/1‑91 (MQ=255) tGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATGGATGCCGCTAAGGCATCGACAt > 2:2950499/1‑91 (MQ=255) gAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATa > 2:2339000/1‑91 (MQ=255) gAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATa > 1:2931962/1‑91 (MQ=255) gAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATa > 2:3300233/1‑91 (MQ=255) gAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATa > 2:1950321/1‑91 (MQ=255) aTTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGatat < 2:710675/91‑1 (MQ=255) tAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTa > 1:2098224/1‑91 (MQ=255) aaaaCTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAAtt < 1:3337696/91‑1 (MQ=255) aaCTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAAtttt < 1:3479691/91‑1 (MQ=255) aaCTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAAtttt > 1:3828529/1‑91 (MQ=255) cTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTg > 2:1495098/1‑91 (MQ=255) aTTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCGATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCa > 1:2969336/1‑91 (MQ=255) aTTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCa > 2:2371125/1‑91 (MQ=255) tttttATGCACAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGAAAACACTAGCAATTTATGCCGCTAAGGCGTCGACATAGATATTAATTTCTGCAg > 1:3615713/1‑91 (MQ=255) ttttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAgg > 1:2244596/1‑91 (MQ=255) ttttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAgg < 2:3668510/91‑1 (MQ=255) ttttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAgg > 2:1490030/1‑91 (MQ=255) ttttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAgg < 2:3439644/91‑1 (MQ=255) ttttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAgg > 2:2039988/1‑91 (MQ=255) ttttATGCACAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAgg > 1:2205042/1‑91 (MQ=255) ttttATGCACAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAgg > 1:1109635/1‑91 (MQ=255) tttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGa > 2:1400007/1‑91 (MQ=255) ttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGAt < 2:3260354/91‑1 (MQ=255) ttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGAt < 2:3171492/91‑1 (MQ=255) ttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGAt < 1:3854874/91‑1 (MQ=255) ttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGAt < 1:1810443/91‑1 (MQ=255) ttGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGAt < 1:1765517/91‑1 (MQ=255) tgtgCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGATg < 2:31098/91‑1 (MQ=255) gtgCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGATGc < 2:2638808/91‑1 (MQ=255) gtgCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGATGc < 1:2077307/91‑1 (MQ=255) gtgCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGATGc < 2:1766677/91‑1 (MQ=255) | TTTTTCAAGTAAATCCGCTGTCTTTCTTAATTCTTCTGCATTACCTACAGTCATAACCCATGAATTATGAATCATTAAAAAACTATTTTTGTGCATAAAAATAGTGTCACCACTCATAGCGATAACACTAGCAATTGATGCCGCTAAGGCATCGACATAGATATTAATTTTTGCAGGATGC > USA300TCH1516_ALE/1582384‑1582564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |